Description
Data Records
The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 1,486 records.
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Versions
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Rights
Researchers should respect the following rights statement:
The publisher and rights holder of this work is Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.
GBIF Registration
This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: bc9f6237-f373-493a-a783-11b0c5eca844. Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by Biodiversity Information System of Mexico.
Keywords
Occurrence; Bacterias; Occurrence
External data
The resource data is also available in other formats
| SNIB-HA013-CSV.zip | http://www.snib.mx/proyectos/HA013/SNIB-HA013-CSV.zip UTF-8 CSV |
|---|---|
| SNIB-HA013-BD.zip | http://www.snib.mx/proyectos/HA013/SNIB-HA013-BD.zip UTF-8 MDB MicrosoftAccess2007 |
Contacts
- Originator
- Responsable
- Tel 01(669) 989 8700 xt 245 o 221
- Metadata Provider
- Dirección General de Sistemas
- Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
- 50045000
- Point Of Contact
- Directora General de Sistemas
- Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
- 50045000
Geographic Coverage
País: País: ALEMANIA País: ARGENTINA (BUENOS AIRES) País: AUSTRALIA (NO DISPONIBLE, QUEENSLAND, TASMANIA, VICTORIA) País: BANGLADESH (DHAKA BIBHAG) País: BELGICA (FLEMISH) País: BRASIL (NO DISPONIBLE, SANTA CATARINA, SAO PAULO) País: CANADA País: CHILE País: CHINA (, SHANDONG, TAIWAN, ZHEJIANG) País: COLOMBIA País: COREA DEL SUR (, CHUNG-NAM, GYEONGGI, JEJUDO) País: DINAMARCA País: ECUADOR (GUAYAS) País: EGIPTO (SOUTH SINAI) País: ENGLAND País: ESPAÑA (, ANDALUCIA, CANARIAS, CATALUÑA, GALICIA, ILLES BALEARS, NAVARRA, VALENCIA, VALENCIANA) País: ESTADOS UNIDOS DE AMERICA (, CALIFORNIA, CONNECTICUT, FLORIDA, GEORGIA, HAWAII, MARYLAND, MASSACHUSETTS, NEW YORK, NORTH CAROLINA, OHIO, OREGON, SOUTH CAROLINA, TEXAS, VIRGINIA, WASHINGTON) País: FRANCIA (, AQUITAINE, BASSE-NORMANDIE, BRETAGNE, CORSICA, LIMOUSIN, LORRAINE, POITOU-CHARENTES) País: GRECIA País: GUATEMALA (RETALHULEU) País: GUERNSEY (VALE) País: HOLANDA (ZUID-HOLLAND) País: INDIA (TAMIL NADU) País: INDONESIA País: IRAN (FARS) País: ISRAEL (, MERIDIONAL) País: ITALIA (CAMPANIA) País: JAPON (, HOKKAIDO, IWATE, KAGOSHIMA, KANAGAWA, KOCHI, NAGASAKI, SIZUOKA, TOKYO) País: MEXICO (, BAJA CALIFORNIA, BAJA CALIFORNIA SUR, COLIMA, HIDALGO, NAYARIT, SINALOA, SONORA, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE) País: NEW CALEDONIA País: NORUEGA (, HORDALAND) País: NUEVA ZELANDA (WELLINGTON) País: PAPUA NUEVA GUINEA País: PHILIPINES País: PORTUGAL País: REINO UNIDO (GREATER LONDON, WALES) País: SCOTLAND (HIGHLAND) País: TAILANDIA (, BANGKOK) País: TANZANIA (ZANZIBAR) País: WALES
| Bounding Coordinates | South West [14.279, -117.255], North East [32.867, -91.892] |
|---|
Taxonomic Coverage
Reino: Bacteria Filo: Proteobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes, Tenericutes, Actinobacteria Clase: Gammaproteobacteria, Bacilli, Alphaproteobacteria, Flavobacteriia Orden: Vibrionales, Bacillales, Alteromonadales, Lactobacillales, Pseudomonadales, Enterobacteriales, Aeromonadales, Rhizobiales, Oceanospirillales, Flavobacteriales, Caulobacterales, Entomoplasmatales, Rhodobacterales, Actinomycetales Familia: Vibrionaceae, Bacillaceae, Alteromonadaceae, Staphylococcaceae, Shewanellaceae, Streptococcaceae, Moraxellaceae, Enterobacteriaceae, Enterococcaceae, Pseudoalteromonadaceae, Pseudomonadaceae, Aeromonadaceae, Brucellaceae, Oceanospirillaceae, Flavobacteriaceae, Halomonadaceae, Alcanivoracaceae, Caulobacteraceae, Micrococcaceae, Spiroplasmataceae, Rhodobacteraceae, Microbacteriaceae
| Kingdom | Bacteria |
|---|---|
| Phylum | Proteobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes, Tenericutes, Actinobacteria |
| Class | Gammaproteobacteria, Bacilli, Alphaproteobacteria, Flavobacteriia |
| Order | Vibrionales, Bacillales, Alteromonadales, Lactobacillales, Pseudomonadales, Enterobacteriales, Aeromonadales, Rhizobiales, Oceanospirillales, Flavobacteriales, Caulobacterales, Entomoplasmatales, Rhodobacterales, Actinomycetales |
| Family | Vibrionaceae, Bacillaceae, Alteromonadaceae, Staphylococcaceae, Shewanellaceae, Streptococcaceae, Moraxellaceae, Enterobacteriaceae, Enterococcaceae, Pseudoalteromonadaceae, Pseudomonadaceae, Aeromonadaceae, Brucellaceae, Oceanospirillaceae, Flavobacteriaceae, Halomonadaceae, Alcanivoracaceae, Caulobacteraceae, Micrococcaceae, Spiroplasmataceae, Rhodobacteraceae, Microbacteriaceae |
| Genus | Vibrio, Bacillus, Marinobacter, Photobacterium, Staphylococcus, Oceanobacillus, Shewanella, Streptococcus, Listonella, Psychrobacter, Escherichia, Exiguobacterium, Enterococcus, Alteromonas, Pseudoalteromonas, Pseudomonas, Grimontia, Aeromonas, Pantoea, Agarivorans, Ochrobactrum, Marinomonas, Acinetobacter, Tenacibaculum, Enterobacter, Halomonas, Aliivibrio, Alcanivorax, Brevundimonas, Vagococcus, Micrococcus, Spiroplasma, Yersinia, Enterovibrio, Roseobacter, Salmonella, Edwardsiella, Microbacterium, Salinivibrio |
| Species | Vibrio fortis, Vibrio alginolyticus, Vibrio harveyi, Bacillus safensis, Vibrio parahaemolyticus, Vibrio ponticus, Vibrio campbellii, Vibrio mediterranei, Vibrio rotiferianus, Staphylococcus saprophyticus, Oceanobacillus sojae, Vibrio chagasii, Streptococcus iniae, Vibrio owensii, Vibrio crassostreae, Photobacterium damselae, Vibrio inusitatus, Listonella pelagia, Vibrio azureus, Vibrio cyclitrophicus, Vibrio coralliilyticus, Vibrio brasiliensis, Psychrobacter maritimus, Shewanella baltica, Vibrio communis, Photobacterium leiognathi, Bacillus tequilensis, Vibrio orientalis, Vibrio natriegens, Bacillus aryabhattai, Psychrobacter marincola, Photobacterium swingsii, Vibrio navarrensis, Vibrio proteolyticus, Vibrio splendidus, Vibrio kanaloae, Vibrio xuii, Escherichia coli, Vibrio ichthyoenteri, Bacillus infantis, Vibrio gigantis, Vibrio tubiashii, Shewanella xiamenensis, Oceanobacillus profundus, Exiguobacterium profundum, Vibrio sinaloensis, Staphylococcus gallinarum, Enterococcus hirae, Staphylococcus xylosus, Staphylococcus sciuri, Exiguobacterium mexicanum, Bacillus thioparans, Shewanella haliotis, Vibrio rumoiensis, Alteromonas macleodii, Pseudoalteromonas spongiae, Vibrio alfacsensis, Photobacterium indicum, Vibrio halioticoli, Vibrio cholerae, Pseudomonas beteli, Vibrio artabrorum, Vibrio vulnificus, Grimontia hollisae, Pseudomonas otitidis, Vibrio hepatarius, Vibrio neptunius, Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Aeromonas hydrophila, Pantoea dispersa, Vibrio mimicus, Agarivorans albus, Ochrobactrum lupini, Vibrio nereis, Marinomonas communis, Vibrio fluvialis, Vibrio ordalii, Pseudomonas taiwanensis, Staphylococcus arlettae, Listonella anguillarum, Acinetobacter baumannii, Photobacterium lutimaris, Aeromonas punctata, Pseudoalteromonas piscicida, Pseudoalteromonas prydzensis, Tenacibaculum mesophilum, Enterobacter cloacae, Halomonas alimentaria, Bacillus circulans, Vibrio cincinnatiensis, Shewanella loihica, Aliivibrio fischeri, Alcanivorax dieselolei, Bacillus cereus, Photobacterium gaetbulicola, Photobacterium jeanii, Acinetobacter schindleri, Brevundimonas terrae, Enterococcus gallinarum, Vagococcus lutrae, Micrococcus yunnanesis, Vibrio diabolicus, Aliivibrio logei, Spiroplasma penaei, Enterobacter hormaechei, Yersinia enterocolitica, Vibrio aestuarianus, Enterovibrio nigricans, Vibrio gazogenes, Vibrio pomeroyi, Vibrio rarus, Enterovibrio norvegicus, Edwardsiella tarda, Aeromonas veronii, Aeromonas jandaei, Pseudomonas anguilliseptica, Microbacterium paraoxydans, Pseudomonas mosselii, Photobacterium angustum |
| Infraspecificname | Photobacterium damselae subsp. damselae, Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila, Salmonella enterica subsp. enterica, Salinivibrio costicola subsp. vallismortis |
Temporal Coverage
| Start Date / End Date | 1964-09-08 / 2011-02-17 |
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Project Data
La colección CAIM ya gozó de un proyecto de computarización por parte de la CONABIO (CC007). Durante este proyecto se computarizó la Colección, pero varias de las cepas (261) quedaron incompletas en su identificación. De las 1813 cepas (registros) faltan por identificar 210 (11.6 %) y otros 51 sólo están a nivel de género; además se han adquirido varios nuevos ejemplares. Para poder llevar a cabo la actualización de la base de datos (BIOTICA), uno de los objetivos que no se pudo satisfacer plenamente en la propuesta anterior, es necesario identificar esas cepas. Para cumplir con este objetivo, en la presenta propuesta se realizarán secuenciaciones de genes útiles ("housekeeping") para poder llegar a una identificación correcta de las cepas bacterianas faltantes. Debido a que éstos genes ya se encuentran secuenciados y disponibles en bases de datos públicas (GenBank), los resultados que se ajusten con una similitud muy elevada (superior al 97-98% para el caso del 16S rARN, por ejemplo), será el criterio para identificar la cepa como perteneciente a esa especie. En caso de que el índice de similitud sea menor, se catalogará como potencial nueva especie y sujeta a posterior análisis. Con estos datos, se actualizará la base de datos para reflejar estas nuevas determinaciones y adicionar las bacterias que se han adquirido recientemente.
| Title | Actualización de la Colección de Microorganismos de importancia acuática |
|---|---|
| Identifier | SNIB-HA013-HA0131301F_corregida-ND |
| Funding | Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO) |
| Study Area Description | Bacterias no patógenas no patógenas y patógenas patógenas |
The personnel involved in the project:
- Content Provider
Collection Data
| Collection Name | Colección de Microorganismos de Importancia Acuática;CAIM;Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo A. C.;CIAD |
|---|---|
| Collection Identifier | SNIB-HA013-HA0131301F_corregida-ND |
| Parent Collection Identifier | NO APLICA |
| Curatorial Units | Between 1 and 1,311 Ejemplar |
|---|
Additional Metadata
| Alternative Identifiers | bc9f6237-f373-493a-a783-11b0c5eca844 |
|---|---|
| https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-HA013 |