Description
El desarrollo del presente proyecto sentará las bases para la creación de una base de datos de secuencias de ADN de referencia, asociadas a la información taxonómica de cada especie de anfibios y reptiles en México. Esta base de datos servirá en un futuro cercano como un sistema de identificación rápida de especies. De esta manera, se abrirá al fin una vía de comunicación ágil entre los generadores de información taxonómica y los usuarios de ésta (ecólogos, conservacionistas, ecoguardias, etc.), poniendo a su alcance información valiosa en la planeación de planes de manejo y conservación. El objetivo general del presente proyecto es caracterizar genéticamente a especies selectas de anfibios y reptiles en México, con secuencias del gen Citocromo Oxidasa I (COI) para generar una herramienta de identificación rápida de dichas especies. Se obtendrán las secuencias parciales del gen COI para 108 especies de anfibios y reptiles de México, amenazadas y/o con problemas taxonómicos. En los casos necesarios se obtendrán las secuencias de otras regiones de ADN para lograr la diferenciación de las especies. Las secuencias se analizarán con metodologías de agrupación filogenética como parsimonia o análisis bayesianos. La información taxonómica, geográfica, la secuencia de COI, la fotografía de los ejemplares, y otras secuencias si es el caso se incorporarán al sistema BOLD (www.boldsystem.org).
Reino: 1 Filo: 1 Clase: 2 Orden: 3 Familia: 14 Género: 36 Especie: 104 Epitetoinfraespecifico: 4
Data Records
The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 570 records.
This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.
Versions
The table below shows only published versions of the resource that are publicly accessible.
How to cite
Researchers should cite this work as follows:
'León R.V. 2015. Código de barras genético de especies de anfibios y reptiles de México. Instituto de Biología. Universidad Nacional Autónoma de México. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto HE010. México, D. F.'
Rights
Researchers should respect the following rights statement:
The publisher and rights holder of this work is Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.
GBIF Registration
This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: cf6ee0a4-cde8-4983-882c-a6e4d2f7de7e. Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by Biodiversity Information System of Mexico.
Keywords
Occurrence; Anfibios; Reptiles; Occurrence
External data
The resource data is also available in other formats
| SNIB-HE010-CSV.zip | http://www.snib.mx/proyectos/HE010/SNIB-HE010-CSV.zip UTF-8 CSV |
|---|---|
| SNIB-HE010-BD.zip | http://www.snib.mx/proyectos/HE010/SNIB-HE010-BD.zip UTF-8 MDB MicrosoftAccess2007 |
Contacts
- Originator
- Metadata Provider
- Point Of Contact
Geographic Coverage
País: COSTA RICA (HEREDIA, SAN JOSE) País: GUATEMALA (ALTA VERAPAZ, HUEHUETENANGO, JALAPA, QUETZALTENANGO, QUICHE, SAN MARCOS) País: HONDURAS (ATLANTIDA, CORTES, FRANCISCO MORAZAN, OCOTEPEQUE) País: MEXICO (CAMPECHE, CHIAPAS, CHIHUAHUA, CIUDAD DE MEXICO, COLIMA, DISTRITO FEDERAL, DURANGO, GUERRERO, HIDALGO, JALISCO, MEXICO, MICHOACAN DE OCAMPO, MORELOS, NAYARIT, OAXACA, PUEBLA, QUERETARO, QUINTANA ROO, SAN LUIS POTOSI, SINALOA, SONORA, TABASCO, TAMAULIPAS, TLAXCALA, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE, YUCATAN, ZACATECAS) País: NICARAGUA (JINOTEGA)
| Bounding Coordinates | South West [13.546, -110.742], North East [29.928, -85.742] |
|---|
Taxonomic Coverage
Reino: Animalia Filo: Chordata Clase: Amphibia, Reptilia Orden: Anura, Squamata, Testudines Familia: Ranidae, Craugastoridae, Microhylidae, Bufonidae, Anguidae, Dipsadidae, Colubridae, Phrynosomatidae, Leptodactylidae, Natricidae, Hylidae, Iguanidae, Leptotyphlopidae, Kinosternidae
| Kingdom | Animalia |
|---|---|
| Phylum | Chordata |
| Class | Amphibia, Reptilia |
| Order | Anura, Squamata, Testudines |
| Family | Ranidae, Craugastoridae, Microhylidae, Bufonidae, Anguidae, Dipsadidae, Colubridae, Phrynosomatidae, Leptodactylidae, Natricidae, Hylidae, Iguanidae, Leptotyphlopidae, Kinosternidae |
| Genus | Lithobates, Craugastor, Gastrophryne, Incilius, Mesaspis, Imantodes, Leptophis, Sceloporus, Leptodactylus, Thamnophis, Smilisca, Dendropsophus, Geophis, Conophis, Ctenosaura, Rhinella, Agalychnis, Abronia, Leptodeira, Tlalocohyla, Hypopachus, Diaglena, Hyla, Anaxyrus, Ficimia, Exerodonta, Gerrhonotus, Leptotyphlops, Pituophis, Charadrahyla, Plectrohyla, Kinosternon, Ecnomiohyla, Lampropeltis, Pseudelaphe, Bufo |
| Species | Lithobates forreri (otác (Seri), rana, rana de Forrer, rana del zacate, rana leopardo de Forrer, rana leopardo del zacate, ziix hax ano quiij (Seri)), Lithobates brownorum (rana de Brown, rana leopardo de Brown, x-túuts´ (Maya)), Craugastor rupinius (rana de arroyo escarpado), Gastrophryne olivacea (rana pajarito, ranita olivo, sapo boca angosta oliváceo), Incilius mazatlanensis (sapito de Mazatlán, sapito pinto de Mazatlán, sapo pinto, sapo sinaloense), Mesaspis gadovii, Imantodes cenchoa (cordelilla manchada, culebra cordelilla chata), Leptophis diplotropis (culebra perico, culebra perico gargantilla, culebra verde, güirotillera, ranera del litoral del Pacífico, ranera verde), Sceloporus horridus (chintete escamoso, lagartija, lagartija escamosa tarasca, lagartija espinosa del pacífico, torosco), Sceloporus internasalis (lagartija escamosa verde, lagartija espinosa verde), Sceloporus variabilis (lagartija escamosa panza rosada, lagartija espinosa panza rosada), Lithobates montezumae (rana de Moctezuma, rana leopardo de Moctezuma), Craugastor tarahumaraensis (otác (Seri), rana ladradora tarahumara, rana ladrona amarilla, ziix hax ano quiij (Seri)), Lithobates omiltemanus (rana guerrerense, rana leopardo de Guerrero, rana leopardo de Omilteme), Leptodactylus melanonotus (múuch (Maya), otác (Seri), rana del sabinal, rana nidificadora de sabinal, ranita espumera de dedos marginados, ranita hojarasca, ziix hax ano quiij (Seri)), Mesaspis moreletii (lagarto escorpión, lagarto escorpión de Morelet, lagarto escorpión sureño), Thamnophis mysocephalus, Thamnophis proximus (culebra acuática, culebra listonada occidental), Mesaspis viridiflava (lagarto escorpión enano), Smilisca baudinii (otác (Seri), quech (Maya), rana arborícola mexicana, rana arbórea de Baudin, rana de árbol mexicana, rana de árbol mexicana común, rana trepadora, x-túuts´ (Maya), ziix hax ano quiij (Seri)), Incilius nebulifer (sapo nebuloso), Dendropsophus microcephalus (quech (Maya), rana arborícola grillo amarilla, rana de árbol amarilla, rana grillo, ranita amarilla, ranita arborícola, x-túuts´ (Maya)), Craugastor pygmaeus (rana ladradora pigmea, rana ladrona pigmea, rana pigmea de dedos libres, rana pygmea ladradora), Geophis semidoliatus (coralillo falso, culebra minadora coralillo, minadora coralilla), Lithobates psilonota (rana espalda lisa), Conophis vittatus (culebra guardacaminos rayada, culebra mexicana de dos líneas), Ctenosaura similis (iguana espinosa rayada, iguana negra, iguana negra de cola espinosa), Rhinella horribilis (bezmuch (Maya), sapo común, sapo gigante, sapo grande, sapo lechero, sapo verrugoso, totmuch (Maya)), Lithobates sierramadrensis (rana Sierra Madre, rana de la Sierra Madre Occidental), Agalychnis dacnicolor (otác (Seri), rana cara de niño, rana verde, ranita verduzca, ziix hax ano quiij (Seri)), Abronia oaxacae (escorpión arborícola de Oaxaca, lagarto alicante oaxaqueño), Lithobates spectabilis (rana manchada, rana vistosa), Lithobates vaillanti (rana, rana de Vaillant, rana verde), Mesaspis juarezi (lagarto escorpión de Sierra de Juárez), Abronia graminea (escorpión arborícola de Tehuacán, lagarto alicante terrestre), Craugastor rhodopis (rana de hojarasca, rana de selva, rana hojarasquera común, rana ladradora polimorfa, rana ladrona polimorfa), Geophis laticinctus (culebra minera de la Mesa Central, minadora de la meseta central), Geophis dubius (culebra minera de la Mesa del Sur, minadora de la meseta del sur), Sceloporus mucronatus (chintete, chintete de grieta meridonial, lagartija escamosa de grieta sureña), Leptodeira septentrionalis subsp. polysticta (culebra ojo de gato), Lithobates neovolcanicus (rana leopardo neovolcánica, rana neovolcánica), Tlalocohyla smithii (otác (Seri), rana de árbol mexicana, rana de árbol mexicana enana, ranita enana mexicana, ziix hax ano quiij (Seri)), Hypopachus variolosus (chacmuch (Maya), múuch (Maya), otác (Seri), rana manglera, rana oveja común, rana ovejera, rana termitera, termitero balador, ziix hax ano quiij (Seri)), Thamnophis godmani (culebra listonada, culebra listonada de Godman, culebra rayada, víbora de agua, víbora rayada), Diaglena spatulata (rana de árbol cabeza de pala, rana pico de pato, rana pico de pato del pacífico, ranita de cabeza espatulada), Leptophis mexicanus (culebra perico mexicana, ranera mexicana), Sceloporus siniferus (lagartija escamosa cola larga, lagartija escamoso castaño, lagartija espinosa de cola larga), Abronia taeniata (escorpión arborícola de bandas, lagarto alicante de bromelia), Hyla eximia (rana de árbol de montaña, rana verde manchada, ranita de montaña), Dendropsophus sartori (rana de árbol, rana de árbol de Taylor, ranita amarilla de Taylor, ranita rayada), Anaxyrus kelloggi (sapito, sapito mexicano, sapo mexicano, sapo pequeño mexicano), Mesaspis antauges (lagartija lagarto del Pico de Orizaba, lagarto escorpión de Monte Orizaba), Geophis mutitorques (culebra minera de tierras altas, minadora de tierras altas), Incilius marmoreus (sapo jaspeado, sapo marmoleado), Thamnophis melanogaster (culebra de agua, culebra de agua de panza negra, culebra de agua de panza negra mexicana, culebra negra en Aguascalientes, víbora de agua), Lithobates magnaocularis (otác (Seri), rana del noroeste mexicano, rana leopardo del noreste, rana leopardo del noreste de México, ziix hax ano quiij (Seri)), Incilius valliceps (múuch (Maya), sapo, sapo común, sapo costero, sapo del golfo), Sceloporus formosus (chintete esmeralda, lagartija escamosa esmeralda norteña, lagartija espinosa esmeralda norteña), Lithobates berlandieri (otác (Seri), rana leopardo, rana leopardo del río Bravo, ziix hax ano quiij (Seri)), Craugastor hobartsmithi (rana ladradora de Smith, rana ladradora pigmea, rana ladrona pigmeo de Smith), Thamnophis chrysocephalus (culebra de agua nómada cabeza dorada, culebra listonada cabeza dorada), Leptodeira maculata (culebra ojo de gato del suroeste, escombreara del suroeste mexicano), Ficimia publia (culebra naricilla manchada), Exerodonta smaragdina (rana de árbol esmeralda, ranita de pastizal, ranita esmeralda), Gerrhonotus liocephalus (lagartija lagarto sureña, lagarto escorpión texano), Leptodeira septentrionalis (culebra ojo de gato norteña, escombrera manchada), Leptodeira splendida (culebra ojo de gato espléndida, escombrera ojo de gato), Lithobates zweifeli (rana de Zweifel), Leptotyphlops goudotii, Craugastor mexicanus (rana ladradora mexicana, rana ladrona mexicana, ranita de hojarasca), Pituophis deppei (alicante, cincuate, cincuate mexicana, culebra casera, culebra sorda mexicana, ratonera), Charadrahyla taeniopus (calate jarocho, rana de árbol jarocha), Sceloporus grammicus (chintete de mezquite, lagartija escamosa de mezquite, lagartija espinosa del mezquital), Mesaspis monticola, Hyla arenicolor (otác (Seri), rana de árbol color arena, ranita de cañon, ranita de las rocas, ziix hax ano quiij (Seri)), Abronia fimbriata, Plectrohyla cyclada (ranita de borde bronceado), Abronia martindelcampoi (escorpión arborícola, escorpión arborícola de Martin del Campo), Incilius perplexus (sapo confuso, sapo de la cuenca del rio Tepalcatepec, sapo perplejo), Ctenosaura pectinata (iguana de roca, iguana espinosa Mexicana, iguana mexicana de cola espinosa, iguana negra), Kinosternon leucostomum (abaniquillo de Hidalgo, casquito de labios blancos, pochitoque septentrional, tortuga pecho quebrado labios blancos), Kinosternon integrum (casquito de burro, tortuga de agua, tortuga de río, tortuga pecho quebrado mexicana), Geophis sallaei (culebra minadora de Salle, minadora de Sallé), Exerodonta sumichrasti (rana de árbol, rana de árbol de Sumichrast, ranita de Sumichrast), Ecnomiohyla miotympanum (calate, calate arborícola, rana de árbol orejas chicas), Craugastor rugulosus (rana de tierra, rana ladrona centroamericana), Sceloporus subpictus (lagartija escamosa pintada, lagartija espinosa de panza pinta), Imantodes gemmistratus (cordelilla de la escamuda, culebra, culebra cordelilla centroamericana), Abronia campbelli, Lampropeltis polyzona (falsa coralillo), Sceloporus jalapae (chintete, lagartija escamosa jalapeña, lagartija espinosa de Jalapa, lagartija espinosa del Valle de Tehuacán), Pseudelaphe flavirufa, Hyla euphorbiacea (rana de árbol de Los Altos del Sur, ranita de alta montaña), Leptotyphlops tenuis, Pituophis catenifer (burrillo, cincuate, cocasnáacöl (Seri), topera, víbora sorda), Geophis petersii (culebra minera de Peters, minadora de Peters), Abronia deppii (escorpión arborícola, escorpión arborícola de Deppe, lagarto alicante), Kinosternon hirtipes (casquito de pata rugosa, tortuga pecho quebrado pata rugosa), Thamnophis eques (culebra de agua, culebra de agua nómado mexicano, culebra listonada del sur Mexicano), Abronia lythrochila (escorpión arborícola de labios rojos, lagarto alicante labios rojos), Incilius tutelarius (sapo de Chimalapas), Abronia mixteca (escorpión arborícola mixteco, lagarto alicante mixteco), Geophis bicolor (culebra minera del Altiplano, minadora de la meseta mexicana), Abronia frosti |
| Infraspecificname | Mesaspis moreleti subsp. fulvus, Mesaspis moreleti subsp. salvadorensis, Mesaspis moreletii subsp. temporalis, Mesaspis moreletii subsp. moreletii |
Temporal Coverage
| Start Date / End Date | 1976-01-30 / 2010-02-02 |
|---|
Project Data
El desarrollo del presente proyecto sentará las bases para la creación de una base de datos de secuencias de ADN de referencia, asociadas a la información taxonómica de cada especie de anfibios y reptiles en México. Esta base de datos servirá en un futuro cercano como un sistema de identificación rápida de especies. De esta manera, se abrirá al fin una vía de comunicación ágil entre los generadores de información taxonómica y los usuarios de ésta (ecólogos, conservacionistas, ecoguardias, etc.), poniendo a su alcance información valiosa en la planeación de planes de manejo y conservación. El objetivo general del presente proyecto es caracterizar genéticamente a especies selectas de anfibios y reptiles en México, con secuencias del gen Citocromo Oxidasa I (COI) para generar una herramienta de identificación rápida de dichas especies. Se obtendrán las secuencias parciales del gen COI para 108 especies de anfibios y reptiles de México, amenazadas y/o con problemas taxonómicos. En los casos necesarios se obtendrán las secuencias de otras regiones de ADN para lograr la diferenciación de las especies. Las secuencias se analizarán con metodologías de agrupación filogenética como parsimonia o análisis bayesianos. La información taxonómica, geográfica, la secuencia de COI, la fotografía de los ejemplares, y otras secuencias si es el caso se incorporarán al sistema BOLD (www.boldsystem.org).
| Title | Código de barras genético de especies de anfibios y reptiles de México |
|---|---|
| Identifier | SNIB-HE010-HE0101412F-ND |
| Funding | Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO) |
| Study Area Description | Anfibios Reptiles boas, cobras, coralillos, culebras, pitones, serpientes, víboras camaleones, geckos, iguanas, lagartijas, lagartos ranas, sapos tortugas dulceacuícolas, tortugas terrestres |
The personnel involved in the project:
- Content Provider
Collection Data
| Collection Name | Colección Herpetológica;EBUAP;Facultad de Ciencias Biológicas, Benemérita Universidad Autónoma de Puebla;FCB-BUAP |
|---|---|
| Collection Identifier | SNIB-HE010-HE0101412F-ND |
| Parent Collection Identifier | NO APLICA |
| Collection Name | Colección Herpetológica;MZFC-HE;Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México;FC-UNAM |
|---|---|
| Collection Identifier | SNIB-HE010-HE0101412F-ND |
| Parent Collection Identifier | NO APLICA |
| Collection Name | Colección Nacional de Anfibios y Reptiles;CNAR;Instituto de Biología, Universidad Nacional Autónoma de México;IBUNAM |
|---|---|
| Collection Identifier | SNIB-HE010-HE0101412F-ND |
| Parent Collection Identifier | NO APLICA |
| Collection Name | Collection of Herpetology;UTA;University of Texas, Arlington;UTA |
|---|---|
| Collection Identifier | SNIB-HE010-HE0101412F-ND |
| Parent Collection Identifier | NO APLICA |
| Collection Name | Herpetological Collection;MVZ;Museum of Vertebrate Zoology, University of California, Berkeley;MVZ-UCB |
|---|---|
| Collection Identifier | SNIB-HE010-HE0101412F-ND |
| Parent Collection Identifier | NO APLICA |
Additional Metadata
| Alternative Identifiers | cf6ee0a4-cde8-4983-882c-a6e4d2f7de7e |
|---|---|
| https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-HE010 |