Código de barras genético de especies de anfibios y reptiles de México

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El desarrollo del presente proyecto sentará las bases para la creación de una base de datos de secuencias de ADN de referencia, asociadas a la información taxonómica de cada especie de anfibios y reptiles en México. Esta base de datos servirá en un futuro cercano como un sistema de identificación rápida de especies. De esta manera, se abrirá al fin una vía de comunicación ágil entre los generadores de información taxonómica y los usuarios de ésta (ecólogos, conservacionistas, ecoguardias, etc.), poniendo a su alcance información valiosa en la planeación de planes de manejo y conservación. El objetivo general del presente proyecto es caracterizar genéticamente a especies selectas de anfibios y reptiles en México, con secuencias del gen Citocromo Oxidasa I (COI) para generar una herramienta de identificación rápida de dichas especies. Se obtendrán las secuencias parciales del gen COI para 108 especies de anfibios y reptiles de México, amenazadas y/o con problemas taxonómicos. En los casos necesarios se obtendrán las secuencias de otras regiones de ADN para lograr la diferenciación de las especies. Las secuencias se analizarán con metodologías de agrupación filogenética como parsimonia o análisis bayesianos. La información taxonómica, geográfica, la secuencia de COI, la fotografía de los ejemplares, y otras secuencias si es el caso se incorporarán al sistema BOLD (www.boldsystem.org).

Reino: 1 Filo: 1 Clase: 2 Orden: 3 Familia: 15 Género: 36 Especie: 104 Epitetoinfraespecifico: 4

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León R.V. 2015. Código de barras genético de especies de anfibios y reptiles de México. Instituto de Biología. Universidad Nacional Autónoma de México. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto HE010. México, D. F.

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Keywords

Occurrence; Specimen; Anfibios; Reptiles

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Virginia León Régagnon
Responsable
Universidad Nacional Autónoma de MéxicoInstituto de BiologíaEstación Chamela 48980 San Patricio Melaque Jalisco MX 01 312 3161000 ext. 49003 01 315 35 10200 56229167

Who can answer questions about the resource:

Sonia Alejandra Careaga Olvera
Subcoordinadora en Información y Análisis
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal 14010 México Tlalpan MX 50045000
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CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal 14010 MÉXICO Tlalpan MX 50045000
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Geographic Coverage

País: COSTA RICA (HEREDIA, SAN JOSE) País: GUATEMALA (ALTA VERAPAZ, HUEHUETENANGO, JALAPA, QUETZALTENANGO, QUEZALTENANGO, QUICHE, SAN MARCOS) País: HONDURAS (ATLANTIDA, CORTES, FRANCISCO MORAZAN, OCOTEPEQUE) País: MEXICO (CAMPECHE, CHIAPAS, CHIHUAHUA, CIUDAD DE MEXICO, COLIMA, DISTRITO FEDERAL, DURANGO, GUERRERO, HIDALGO, JALISCO, MEXICO, MICHOACAN DE OCAMPO, MORELOS, NAYARIT, OAXACA, PUEBLA, QUERETARO, QUINTANA ROO, SAN LUIS POTOSI, SINALOA, SONORA, TABASCO, TAMAULIPAS, TLAXCALA, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE, YUCATAN, ZACATECAS) País: NICARAGUA (JINOTEGA)

Bounding Coordinates South West [9.567, -110.742], North East [29.928, -83.717]

Taxonomic Coverage

Reino: Animalia Filo: Chordata Clase: Reptilia, Amphibia Orden: Squamata, Anura, Testudines Familia: Anguidae, Ranidae, Craugastoridae, Microhylidae, Bufonidae, Dipsadidae, Colubridae, Phrynosomatidae, Natricidae, Hylidae, Iguanidae, Phyllomedusidae, Leptotyphlopidae, Kinosternidae, Leptodactylidae

Kingdom  Animalia
Phylum  Chordata
Class  Reptilia,  Amphibia
Order  Squamata,  Anura,  Testudines
Family  Anguidae,  Ranidae,  Craugastoridae,  Microhylidae,  Bufonidae,  Dipsadidae,  Colubridae,  Phrynosomatidae,  Natricidae,  Hylidae,  Iguanidae,  Phyllomedusidae,  Leptotyphlopidae,  Kinosternidae,  Leptodactylidae
Genus  Mesaspis,  Lithobates,  Craugastor,  Gastrophryne,  Incilius,  Imantodes,  Leptophis,  Sceloporus,  Thamnophis,  Dendropsophus,  Geophis,  Conophis,  Ctenosaura,  Agalychnis,  Abronia,  Leptodeira,  Tlalocohyla,  Hyla,  Anaxyrus,  Ficimia,  Exerodonta,  Leptotyphlops,  Pituophis,  Charadrahyla,  Plectrohyla,  Kinosternon,  Ecnomiohyla,  Lampropeltis,  Pseudelaphe,  Rhinella,  Leptodactylus,  Smilisca,  Hypopachus,  Diaglena,  Bufo,  Gerrhonotus
Species  Mesaspis juarezi (lagarto escorpión de Sierra de Juárez),  Lithobates zweifeli (rana de Zweifel),  Lithobates brownorum (rana de Brown, rana leopardo de Brown),  Craugastor rupinius (rana de arroyo escarpado),  Gastrophryne olivacea (sapo boca angosta oliváceo, ranita olivo, rana pajarito),  Incilius mazatlanensis (sapo sinaloense, sapo pinto, sapito de Mazatlán, sapito pinto de Mazatlán),  Mesaspis gadovii,  Imantodes cenchoa (culebra cordelilla chata, cordelilla manchada),  Lithobates forreri (rana de Forrer, rana del zacate, rana, rana leopardo de Forrer, rana leopardo del zacate),  Leptophis diplotropis (ranera del litoral del Pacífico, ranera verde, culebra verde, güirotillera, culebra perico gargantilla),  Sceloporus horridus (lagartija escamosa tarasca, torosco, lagartija espinosa del pacífico, lagartija, chintete escamoso),  Sceloporus internasalis (lagartija escamosa verde, lagartija espinosa verde),  Sceloporus variabilis (lagartija escamosa panza rosada, lagartija espinosa panza rosada),  Lithobates montezumae (rana de Moctezuma, rana leopardo de Moctezuma),  Craugastor tarahumaraensis (rana ladradora tarahumara, rana ladrona amarilla),  Lithobates omiltemanus (rana guerrerense, rana leopardo de Guerrero, rana leopardo de Omilteme),  Mesaspis moreletii (lagarto escorpión sureño, lagarto escorpión, lagarto escorpión de Morelet),  Thamnophis mysocephalus,  Thamnophis proximus (culebra listonada occidental, culebra acuática),  Incilius nebulifer (sapo nebuloso),  Dendropsophus microcephalus (rana grillo, ranita amarilla, rana arborícola grillo amarilla, ranita arborícola, rana de árbol amarilla),  Craugastor pygmaeus (rana ladrona pigmea, rana pigmea de dedos libres, rana pygmea ladradora, rana ladradora pigmea),  Geophis semidoliatus (culebra minadora coralillo, coralillo falso, minadora coralilla),  Conophis vittatus (culebra guardacaminos rayada, culebra mexicana de dos líneas),  Ctenosaura similis (iguana negra de cola espinosa, iguana espinosa rayada, iguana negra),  Lithobates sierramadrensis (rana de la Sierra Madre Occidental, rana Sierra Madre),  Agalychnis dacnicolor (rana cara de niño, ranita verduzca, rana verde),  Abronia oaxacae (lagarto alicante oaxaqueño, escorpión arborícola de Oaxaca),  Lithobates spectabilis (rana vistosa, rana manchada),  Craugastor rhodopis (rana hojarasquera común, rana de hojarasca, rana ladradora polimorfa, rana ladrona polimorfa, rana de selva),  Geophis dubius (culebra minera de la Mesa del Sur, minadora de la meseta del sur),  Sceloporus mucronatus (chintete, lagartija escamosa de grieta sureña, chintete de grieta meridonial),  Leptodeira annulata (culebra ojo de gato bandada, serpiente escombrera, escombrera),  Lithobates neovolcanicus (rana neovolcánica, rana leopardo neovolcánica),  Tlalocohyla smithii (rana de árbol mexicana enana, ranita enana mexicana),  Thamnophis godmani (culebra listonada de Godman, culebra rayada, víbora de agua, víbora rayada, culebra listonada),  Leptophis mexicanus (culebra perico mexicana, ranera mexicana),  Sceloporus siniferus (lagartija escamoso castaño, lagartija espinosa de cola larga, lagartija escamosa cola larga),  Abronia taeniata (lagarto alicante de bromelia, escorpión arborícola de bandas),  Hyla eximia (rana de árbol de montaña, ranita de montaña, rana verde manchada),  Dendropsophus sartori (rana de árbol de Taylor, ranita amarilla de Taylor, ranita rayada, rana de árbol),  Anaxyrus kelloggi (sapo mexicano, sapito mexicano, sapito, sapo pequeño mexicano),  Mesaspis antauges (lagarto escorpión de Monte Orizaba, lagartija lagarto del Pico de Orizaba),  Geophis mutitorques (culebra minera de tierras altas, minadora de tierras altas),  Thamnophis melanogaster (culebra de agua de panza negra, víbora de agua, culebra de agua, culebra de agua de panza negra mexicana, culebra negra en Aguascalientes),  Lithobates vaillanti (rana verde, rana, rana de Vaillant),  Lithobates magnaocularis (rana del noroeste mexicano, rana leopardo del noreste de México, rana leopardo del noreste),  Incilius valliceps (sapo común, sapo costero, sapo del golfo, sapo),  Sceloporus formosus (lagartija escamosa esmeralda norteña, chintete esmeralda, lagartija espinosa esmeralda norteña),  Craugastor hobartsmithi (rana ladradora de Smith, rana ladrona pigmeo de Smith, rana ladradora pigmea),  Thamnophis chrysocephalus (culebra listonada cabeza dorada, culebra de agua nómada cabeza dorada),  Leptodeira maculata (culebra ojo de gato del suroeste, escombreara del suroeste mexicano),  Ficimia publia (culebra naricilla manchada),  Exerodonta smaragdina (ranita de pastizal, rana de árbol esmeralda, ranita esmeralda),  Leptodeira septentrionalis (culebra ojo de gato norteña, escombrera manchada),  Leptodeira splendida (culebra ojo de gato espléndida, escombrera ojo de gato),  Leptotyphlops goudotii,  Lithobates berlandieri (rana leopardo, rana leopardo del río Bravo),  Craugastor mexicanus (rana ladrona mexicana, ranita de hojarasca, rana ladradora mexicana),  Pituophis deppei (cincuate mexicana, culebra casera, alicante, cincuate, culebra sorda mexicana, ratonera),  Charadrahyla taeniopus (rana de árbol jarocha, calate jarocho),  Sceloporus grammicus (lagartija escamosa de mezquite, chintete de mezquite, lagartija, lagartija espinosa del mezquital),  Hyla arenicolor (rana de árbol color arena, ranita de cañon, ranita de las rocas),  Plectrohyla cyclada (ranita de borde bronceado),  Incilius perplexus (sapo confuso, sapo de la cuenca del rio Tepalcatepec, sapo perplejo),  Ctenosaura pectinata (iguana espinosa Mexicana, iguana negra, iguana de roca, iguana mexicana de cola espinosa),  Kinosternon leucostomum (abaniquillo de Hidalgo, pochitoque septentrional, casquito de labios blancos, tortuga pecho quebrado labios blancos),  Abronia graminea (lagarto alicante terrestre, escorpión arborícola de Tehuacán),  Incilius marmoreus (sapo marmoleado, sapo jaspeado),  Kinosternon integrum (casquito de burro, tortuga pecho quebrado mexicana, tortuga de agua, tortuga de río),  Geophis sallaei (culebra minadora de Salle, minadora de Sallé),  Exerodonta sumichrasti (rana de árbol de Sumichrast, ranita de Sumichrast, rana de árbol),  Ecnomiohyla miotympanum (rana de árbol orejas chicas, calate arborícola, calate),  Craugastor rugulosus (rana ladrona centroamericana, rana de tierra),  Sceloporus subpictus (lagartija escamosa pintada, lagartija espinosa de panza pinta),  Imantodes gemmistratus (culebra cordelilla centroamericana, cordelilla de la escamuda, culebra),  Mesaspis viridiflava (lagarto escorpión enano),  Lampropeltis triangulum,  Lithobates psilonota (rana espalda lisa),  Sceloporus jalapae (lagartija espinosa de Jalapa, lagartija espinosa del Valle de Tehuacán, chintete, lagartija escamosa jalapeña),  Pseudelaphe flavirufa,  Hyla euphorbiacea (rana de árbol de Los Altos del Sur, ranita de alta montaña),  Leptotyphlops tenuis,  Pituophis melanoleucus,  Geophis petersii (culebra minera de Peters, minadora de Peters),  Abronia deppii (escorpión arborícola de Deppe, escorpión arborícola, lagarto alicante),  Kinosternon hirtipes (tortuga pecho quebrado pata rugosa, casquito de pata rugosa),  Rhinella horribilis (sapo lechero, sapo común, sapo gigante, sapo verrugoso, sapo grande),  Thamnophis eques (culebra listonada del sur Mexicano, culebra de agua, culebra de agua nómado mexicano),  Abronia lythrochila (lagarto alicante labios rojos, escorpión arborícola de labios rojos),  Incilius tutelarius (sapo de Chimalapas),  Abronia mixteca (lagarto alicante mixteco, escorpión arborícola mixteco),  Abronia martindelcampoi (escorpión arborícola de Martin del Campo, escorpión arborícola),  Geophis bicolor (culebra minera del Altiplano, minadora de la meseta mexicana),  Abronia frosti,  Leptodactylus melanonotus (rana nidificadora de sabinal, rana del sabinal, ranita espumera de dedos marginados, ranita hojarasca),  Smilisca baudinii (rana arbórea de Baudin, rana arborícola mexicana, rana de árbol mexicana común, rana de árbol mexicana, rana trepadora),  Hypopachus variolosus (rana manglera, rana termitera, termitero balador, rana oveja común, rana ovejera),  Diaglena spatulata (ranita de cabeza espatulada, rana pico de pato, rana pico de pato del pacífico, rana de árbol cabeza de pala),  Geophis laticinctus (culebra minera de la Mesa Central, minadora de la meseta central),  Mesaspis monticola,  Gerrhonotus liocephalus (escorpión, lagarto escorpión texano, lagartija lagarto sureña),  Abronia fimbriata,  Abronia campbelli
Infraspecificname  Mesaspis moreletii subsp. temporalis,  Mesaspis moreleti subsp. fulvus,  Mesaspis moreleti subsp. salvadorensis,  Mesaspis moreletii subsp. moreletii

Temporal Coverage

Start Date / End Date 1976-01-30 / 2010-02-02

Project Data

El desarrollo del presente proyecto sentará las bases para la creación de una base de datos de secuencias de ADN de referencia, asociadas a la información taxonómica de cada especie de anfibios y reptiles en México. Esta base de datos servirá en un futuro cercano como un sistema de identificación rápida de especies. De esta manera, se abrirá al fin una vía de comunicación ágil entre los generadores de información taxonómica y los usuarios de ésta (ecólogos, conservacionistas, ecoguardias, etc.), poniendo a su alcance información valiosa en la planeación de planes de manejo y conservación. El objetivo general del presente proyecto es caracterizar genéticamente a especies selectas de anfibios y reptiles en México, con secuencias del gen Citocromo Oxidasa I (COI) para generar una herramienta de identificación rápida de dichas especies. Se obtendrán las secuencias parciales del gen COI para 108 especies de anfibios y reptiles de México, amenazadas y/o con problemas taxonómicos. En los casos necesarios se obtendrán las secuencias de otras regiones de ADN para lograr la diferenciación de las especies. Las secuencias se analizarán con metodologías de agrupación filogenética como parsimonia o análisis bayesianos. La información taxonómica, geográfica, la secuencia de COI, la fotografía de los ejemplares, y otras secuencias si es el caso se incorporarán al sistema BOLD (www.boldsystem.org).

Title Código de barras genético de especies de anfibios y reptiles de México
Identifier SNIB-HE010-HE0101412F-ND
Funding Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
Study Area Description Anfibios Reptiles boas, cobras, coralillos, culebras, pitones, serpientes, víboras camaleones, geckos, iguanas, lagartijas, lagartos ranas, sapos tortugas dulceacuícolas, tortugas terrestres

The personnel involved in the project:

Virginia León Régagnon

Collection Data

Collection Name Colección Herpetológica;EBUAP;Escuela de Biología, Benemérita Universidad Autónoma de Puebla;EB-BUAP
Collection Identifier SNIB-HE010-HE0101412F-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Colección Herpetológica;MZFC;Museo de Zoología Alfonso L. Herrera, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México;FC-UNAM
Collection Identifier SNIB-HE010-HE0101412F-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Colección Nacional de Anfibios y Reptiles;CNAR;Instituto de Biología, Universidad Nacional Autónoma de México;IBUNAM
Collection Identifier SNIB-HE010-HE0101412F-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Collection of Herpetology;UTA;University of Texas, Arlington;UTA
Collection Identifier SNIB-HE010-HE0101412F-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Herpetological Collection;MVZ;Museum of Vertebrate Zoology, University of California, Berkeley;MVZ-UCB
Collection Identifier SNIB-HE010-HE0101412F-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA

Additional Metadata

Alternative Identifiers cf6ee0a4-cde8-4983-882c-a6e4d2f7de7e
http://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-HE010