Registros biológicos

Filogeografía y recursos genéticos de las vainillas de México

Última versión Publicado por Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad en 11 de abril de 2024 Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad

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Descripción

Se presentan las relaciones filogenéticas de las especies mexicanas de Vanilla, con base en caracteres moleculares de la región ITS de los genes ribosomales. Las 10 especies de vainillas mexicanas pertenecen a linajes distintos del género, aunque 8 forman parte del clado que incluye a las especies económicamente más importantes (V. planifolia y V. pompona) y representan una parte importante de los recursos genéticos secundarios de este cultivo. Se hicieron evaluaciones de la variación de los ITS y se determinó que su secuencia es específica para cada taxón y que constituye una herramienta útil para el reconocimiento de material estéril dentro de este grupo. Los recursos genéticos primarios de vainilla están conformados por los cultivares y especimenes silvestres de V. planifolia. Se obtuvieron secuencias nucleotídicas de regiones genómicas supuestamente hipervariables con objeto de colectar datos que permitieran establecer una genealogía en esta especie y contestar preguntas acerca del origen, diseminación y procesos de domesticación en este cultivo. Las secuencias obtenidas (parciales de los genes Adh, CaM y GapC4), muestran nula o poca variación, aunque en uno de los casos ésta es informativa y aparentemente permite reconocer clones y sitios de origen de los especimenes. Sin embargo, la variación hasta ahora detectada es insuficiente para realizar un análisis que brinde mayor información sobre la historia de V. planifolia. Se presentan los resultados de un estudio sobre la variación y estructura genética, de las plantaciones e individuos silvestres conocidos de V. planifolia, para lo cual se utilizaron datos de 15 loci electroforéticos polimórficos. Todas las localidades presentan valores bajos en niveles de heterocigosis (Ho=0.000 a 0.078). Distintos análisis: Fst, análisis fenéticos y de parsimonia, indican una estructura de muy definida a poco definida, pero existe. La variación está repartida principalmente en dos áreas distintas, el norte de Oaxaca y el norte de Veracruz, aunque individuos aislados de localidades de Tabasco, este de Oaxaca y Chiapas pueden ser muy diferentes electroforéticamente. Los índices de fijación (F) son positivos, muy altos y cercanos a 1, y difieren significativamente del esperado para un entrecruzamiento al azar. Los datos sugieren que ha existido endogamia. Se presentan valores de flujo génico y de tasas de entrecruzamiento; el flujo génico es bajo y el sistema de reproducción dominante es la autofertilización. Los valores de diversidad genotípica no reflejan la existencia de una extensa propagación clonal y sugieren que las técnicas de electroforesis están sobrestimando el número de genotipos existente. Por último se señalan algunas observaciones sobre el manejo de los recursos genéticos de las vainillas cultivadas, indicándose rasgos deseables de otras especies mexicanas silvestres susceptibles de ser incorporados a este cultivo. La conservación de los recursos genéticos de Vanilla planifolia requiere principalmente de un plan de manejo ex situ, debido a las condiciones críticas de conservación de esta especie en estado silvestre. Se recomienda la creación de un banco de germoplasma y el mejoramiento de las condiciones en las plantaciones, especialmente en Oaxaca, como una estrategia para el mantenimiento de la diversidad genotípica en las plantaciones.

Reino: 1 Filo: 1 Clase: 1 Orden: 1 Familia: 1 Género: 3 Especie: 10 Epitetoinfraespecifico: 4

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 142 registros.

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Versiones

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¿Cómo referenciar?

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'Soto-Arenas M.A. 1999. Filogeografía y recursos genéticos de las vainillas de México. Instituto Chinoin A. C. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto J101. México, D. F.'

Derechos

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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: c043cf3a-abb9-4039-bf5d-e2ae3a22e245.  Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Biodiversity Information System of Mexico.

Palabras clave

Occurrence; Plantas; Occurrence

Datos externos

Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos

SNIB-J101-CSV.zip http://www.snib.mx/proyectos/J101/SNIB-J101-CSV.zip UTF-8 CSV
SNIB-J101-BD.zip http://www.snib.mx/proyectos/J101/SNIB-J101-BD.zip UTF-8 MDB MicrosoftAccess2007

Contactos

Miguel Ángel Soto Arenas
  • Originador
Responsable
Instituto Chinoin ACHerbario de la Asociación Mexicana de Orquideología AC
Lago Tangañica # 18
11520 México
Distrito Federal
MX
Tel 5262 3193 (con la Srita. Nora), 294 2862, 262 3101, 294 2863, 622 9013 Fax 531 4349
CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
  • Proveedor De Los Metadatos
Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
14010 MÉXICO
Tlalpan
MX
50045000
Patricia Ramos Rivera
  • Punto De Contacto
Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
14010 México
Tlalpan
MX
50045000

Cobertura geográfica

País: MEXICO (CAMPECHE, CHIAPAS, OAXACA, PUEBLA, QUINTANA ROO, SAN LUIS POTOSI, TABASCO, TAMAULIPAS, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE)

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [16,113, -100,061], Latitud Máxima Longitud Máxima [23,227, -88,612]

Cobertura taxonómica

Reino: Plantae Filo: Tracheophyta Clase: Equisetopsida Orden: Asparagales Familia: Orchidaceae

Reino Plantae
Filo Tracheophyta
Class Equisetopsida
Orden Asparagales
Familia Orchidaceae
Género Vanilla, Palmorchis, Paphiopedilum
Especie Vanilla planifolia (bainii (Zapoteco), canela de cuya, cashisha (Totonaco), caxi-xanath (Totonaco), juju, kuoley gm (Chinanteco), piis'oxaanti (Tepehua), siisbik (Maya), sisbik (Maya), sisbik-k'aax (Maya), sumi xa'nat (Totonaco), sumi'xa'nat (Totonaco), sunti'xa'nat (Totonaco), tlilxóchitl (Náhuatl), vainilla, vainilla colibrí, vainilla escarchada, vainilla mansa, xuucy (Mixe), zizbic (Maya)), Vanilla insignis (sisbik (Maya), vainilla, vainilla cimarrona), Vanilla pompona (platanillo, plátano vainilla, segne-xeute (Totonaco), vainilla, vainilla boba, vainilla pompona, vainillán, vainillón), Vanilla cribbiana (vainilla), Vanilla inodora (vainilla, vainilla cerro amarillo, vainilla de puerco), Paphiopedilum fairrianum, Vanilla perplexa, Vanilla odorata (vainilla, vainilla de Teutila, vainilla de Tlatepusco), Vanilla phaeantha (vainilla), Vanilla grandiflora (platanillo, plátano vainilla, segne-xeute (Totonaco), vainilla, vainilla boba, vainilla pompona, vainillán, vainillón)
Infraspecificname Vanilla planifolia cv. mansa, Vanilla planifolia cv. oreja de burro, Vanilla planifolia cv. acamaya, Vanilla pompona cv. acamaya

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 1994-05-11 / 1999-01-27

Datos del proyecto

Se presentan las relaciones filogenéticas de las especies mexicanas de Vanilla, con base en caracteres moleculares de la región ITS de los genes ribosomales. Las 10 especies de vainillas mexicanas pertenecen a linajes distintos del género, aunque 8 forman parte del clado que incluye a las especies económicamente más importantes (V. planifolia y V. pompona) y representan una parte importante de los recursos genéticos secundarios de este cultivo. Se hicieron evaluaciones de la variación de los ITS y se determinó que su secuencia es específica para cada taxón y que constituye una herramienta útil para el reconocimiento de material estéril dentro de este grupo. Los recursos genéticos primarios de vainilla están conformados por los cultivares y especimenes silvestres de V. planifolia. Se obtuvieron secuencias nucleotídicas de regiones genómicas supuestamente hipervariables con objeto de colectar datos que permitieran establecer una genealogía en esta especie y contestar preguntas acerca del origen, diseminación y procesos de domesticación en este cultivo. Las secuencias obtenidas (parciales de los genes Adh, CaM y GapC4), muestran nula o poca variación, aunque en uno de los casos ésta es informativa y aparentemente permite reconocer clones y sitios de origen de los especimenes. Sin embargo, la variación hasta ahora detectada es insuficiente para realizar un análisis que brinde mayor información sobre la historia de V. planifolia. Se presentan los resultados de un estudio sobre la variación y estructura genética, de las plantaciones e individuos silvestres conocidos de V. planifolia, para lo cual se utilizaron datos de 15 loci electroforéticos polimórficos. Todas las localidades presentan valores bajos en niveles de heterocigosis (Ho=0.000 a 0.078). Distintos análisis: Fst, análisis fenéticos y de parsimonia, indican una estructura de muy definida a poco definida, pero existe. La variación está repartida principalmente en dos áreas distintas, el norte de Oaxaca y el norte de Veracruz, aunque individuos aislados de localidades de Tabasco, este de Oaxaca y Chiapas pueden ser muy diferentes electroforéticamente. Los índices de fijación (F) son positivos, muy altos y cercanos a 1, y difieren significativamente del esperado para un entrecruzamiento al azar. Los datos sugieren que ha existido endogamia. Se presentan valores de flujo génico y de tasas de entrecruzamiento; el flujo génico es bajo y el sistema de reproducción dominante es la autofertilización. Los valores de diversidad genotípica no reflejan la existencia de una extensa propagación clonal y sugieren que las técnicas de electroforesis están sobrestimando el número de genotipos existente. Por último se señalan algunas observaciones sobre el manejo de los recursos genéticos de las vainillas cultivadas, indicándose rasgos deseables de otras especies mexicanas silvestres susceptibles de ser incorporados a este cultivo. La conservación de los recursos genéticos de Vanilla planifolia requiere principalmente de un plan de manejo ex situ, debido a las condiciones críticas de conservación de esta especie en estado silvestre. Se recomienda la creación de un banco de germoplasma y el mejoramiento de las condiciones en las plantaciones, especialmente en Oaxaca, como una estrategia para el mantenimiento de la diversidad genotípica en las plantaciones.

Título Filogeografía y recursos genéticos de las vainillas de México
Identificador SNIB-J101-Varios archivos XLS-ND
Fuentes de Financiación Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
Descripción del área de estudio Plantas con flores como agapantos, ajos, azafránes, cebollas, espárragos, gladiolas, magueyes, orquídeas, patas de elefante, sábilas, vainillas, yucas

Personas asociadas al proyecto:

Miguel Ángel Soto Arenas
  • Content Provider

Datos de la colección

Nombre de la Colección NO DISPONIBLE
Identificador de la Colección SNIB-J101-Varios archivos XLS-ND
Identificador de la Colección Parental NO APLICA
Métodos de preservación de los ejemplares Congelado
Unidades curatoriales Entre 1 y 25 Ejemplar

Metadatos adicionales

Identificadores alternativos c043cf3a-abb9-4039-bf5d-e2ae3a22e245
https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-J101