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Elaboración de la base de datos de la colección de cepas de bacterias fitopatógenas de la Dirección General de Sanidad Vegetal

Latest version published by Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad on Aug 20, 2018 Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad

El Centro Nacional de Referencia Fitosanitaria, del Servicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad Agroalimentaria (SENASICA), tiene la misión de preservar la sanidad vegetal de nuestro país. Para el área de diagnóstico, el centro cuenta con laboratorios especializados, entre los cuales se encuentra el laboratorio de Bacteriología La Colección Bacteriológica de la Dirección General de Sanidad Vegetal (CNRF-B-DGSV), se encuentra en estado inicial, por su importancia biológica y económica, las cepas que se tienen se han aislado de material vegetal de importación, así como recientemente de material nacional, son de importancia para la agricultura, por ser consideradas como plagas. Por su distribución y presencia en el territorio se les conoce como plagas de importancia económica, cuando no están presente en país se les nombra como plaga cuarentenada, siendo esta última la de mayor relevancia por el costo económico y como contaminante biológico. El aumento del intercambio de productos con otros países y la actividad turística, favorecen la posible entrada de plagas cuarentenadas, por consiguiente, es importante tener información relacionada con la biología, distribución, hospedantes, además de tener ejemplares debidamente identificados que sirvan como material de referencia o como consulta para los investigadores. La CNRF-B-DGSV cuenta con 25 cepas, de diverso origen. La forma de preservación de la colección es a través del uso de agua destilada estéril a temperatura ambiente, agua destilada estéril a 4°C y en medio de cultivo con aceite mineral. Con la intención de contribuir al conocimiento cada vez más preciso de las bacterias que afectan a los vegetales, sus productos y subproductos, la Dirección General de Sanidad Vegetal-SAGARPA, ha fijado las bases para establecer un Sistema de Diagnóstico Fitosanitario, cuyas acciones básicas es la caracterización de bacterias fitopatógenas y de aquí la importancia de una Colección de Cepas Bacterianas organizada para permitir un eficiente sistema de consulta. De ahí la importancia de crear una base de datos adecuada para facilitar la ubicación exacta de cada ejemplar y la información básica y esencial para corroboraciones posteriores de bacterias fitopatógenas. Para el desarrollo de la base de datos de la Colección Bacteriológica de la DGSV, por el número de ejemplares que la integran, el proyecto se desarrollara en cuatro etapas, Acervo de la Colección La colección cuenta hasta el momento con un total de 25 cepas bacterianas. La colección está enfocada principalmente a bacterias de importancia cuarentenaria y económica de origen nacional e internacional La Colección está compuesta por los siguientes géneros de importancias agrícola: Clavibacter Curtobacterium Dickeya Pantoea Pseudomonas Ralstonia Stenotrophomonas Xanthomonas

Reino: 1 Filo: 1 Clase: 2 Orden: 4 Familia: 8 Género: 19 Especie: 43 Epitetoinfraespecifico: 6

Data Records

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Keywords

Occurrence; Specimen; Bacterias

External data

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Contacts

Who created the resource:

Bárbara Hernández Macías
Responsable
Secretaría de Agricultura, Ganadería, Desarrollo Rural, Pesca y AlimentaciónServicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad AgroalimentariaDirección General de Sanidad Vegetal MX (55) 50 90 30 00 Ext. 51333

Who can answer questions about the resource:

Sonia Alejandra Careaga Olvera
Subcoordinadora en Información y Análisis
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal 14010 México Tlalpan MX 50045000
https://www.gob.mx/conabio

Who filled in the metadata:

CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal 14010 MÉXICO Tlalpan MX 50045000
https://www.gob.mx/conabio

Geographic Coverage

País: CHILE País: CHINA País: COLOMBIA País: COSTA RICA País: ESTADOS UNIDOS DE AMERICA (CALIFORNIA, FLORIDA, GEORGIA, NEBRASKA, NO DISPONIBLE, OREGON, WASHINGTON) País: FRANCIA País: JAPON País: MEXICO (BAJA CALIFORNIA, CAMPECHE, CHIAPAS, CHIHUAHUA, COLIMA, DISTRITO FEDERAL, DURANGO, GUANAJUATO, GUERRERO, HIDALGO, JALISCO, MEXICO, MICHOACAN DE OCAMPO, MORELOS, NAYARIT, NO DISPONIBLE, NUEVO LEON, OAXACA, PUEBLA, QUINTANA ROO, SAN LUIS POTOSI, SINALOA, SONORA, TABASCO, TLAXCALA, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE, YUCATAN, ZACATECAS) País: NO DISPONIBLE País: REINO UNIDO País: SUDAFRICA País: TAILANDIA

Bounding Coordinates South West [15.358, -122.044], North East [42.302, -87.046]

Taxonomic Coverage

Reino: Prokaryotae Filo: Proteobacteria Clase: Gammaproteobacteria, Betaproteobacteria Orden: Pseudomonadales, Xanthomonadales, Enterobacteriales, Burkholderiales Familia: Xanthomonadaceae, Microbacteriaceae, Pseudomonadaceae, Enterobacteriaceae, Burkholderiaceae, Comamonadaceae, Rhizobiaceae, Spiroplasmataceae

Kingdom  Prokaryotae
Phylum  Proteobacteria
Class  Gammaproteobacteria,  Betaproteobacteria
Order  Pseudomonadales,  Xanthomonadales,  Enterobacteriales,  Burkholderiales
Family  Xanthomonadaceae,  Microbacteriaceae,  Pseudomonadaceae,  Enterobacteriaceae,  Burkholderiaceae,  Comamonadaceae,  Rhizobiaceae,  Spiroplasmataceae
Genus  Xylella,  Clavibacter,  Xanthomonas,  Pseudomonas,  Pantoea,  Burkholderia,  Curtobacterium,  Acidovorax,  Pectobacterium,  Erwinia,  Ralstonia,  Rhizobium,  Gibbsiella,  Stenotrophomonas,  Dickeya,  Spiroplasma,  Serratia,  Brenneria,  Tatumella
Species  Xanthomonas fragariae,  Pseudomonas fluorescens,  Xanthomonas albilineans,  Xanthomonas melonis,  Burkholderia cepacia,  Pseudomonas palleroniana,  Curtobacterium luteum,  Pseudomonas marginalis,  Acidovorax citrulli,  Xanthomonas sacchari,  Pseudomonas argentinensis,  Xanthomonas translucens,  Pseudomonas rizosphaerae,  Xanthomonas campestris,  Pectobacterium carotovorum,  Curtobacterium flaccumfaciens,  Erwinia amylovora,  Pantoea ananatis,  Ralstonia solanacearum,  Pantoea dispersa,  Rhizobium rhizogenes,  Pseudomonas aeruginosa,  Xanthomonas axonopodis,  Pantoea anthophila,  Pseudomonas viridiflava,  Pseudomonas lundensis,  Stenotrophomonas maltophilia,  Xanthomonas arboricola,  Dickeya chrysanthemi,  Burkholderia glumae,  Pseudomonas putida,  Spiroplasma kunkelii,  Spiroplasma citri,  Rhizobium radiobacter,  Pseudomonas taiwanensis,  Pseudomonas entomophila,  Serratia marcescens,  Pantoea agglomerans,  Pseudomonas syringae,  Pseudomonas cichorii,  Brenneria rubrifaciens,  Tatumella citrea,  Xanthomonas euvesicatoria
Infraspecificname  Xylella fastidiosa subsp. multiplex,  Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis,  Pantoea stewartii subsp. indologenes,  Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis,  Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa,  Pantoea stewartii subsp. stewartii

Temporal Coverage

Start Date / End Date 1996-01-01 / 2016-07-27

Project Data

El Centro Nacional de Referencia Fitosanitaria, del Servicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad Agroalimentaria (SENASICA), tiene la misión de preservar la sanidad vegetal de nuestro país. Para el área de diagnóstico, el centro cuenta con laboratorios especializados, entre los cuales se encuentra el laboratorio de Bacteriología La Colección Bacteriológica de la Dirección General de Sanidad Vegetal (CNRF-B-DGSV), se encuentra en estado inicial, por su importancia biológica y económica, las cepas que se tienen se han aislado de material vegetal de importación, así como recientemente de material nacional, son de importancia para la agricultura, por ser consideradas como plagas. Por su distribución y presencia en el territorio se les conoce como plagas de importancia económica, cuando no están presente en país se les nombra como plaga cuarentenada, siendo esta última la de mayor relevancia por el costo económico y como contaminante biológico. El aumento del intercambio de productos con otros países y la actividad turística, favorecen la posible entrada de plagas cuarentenadas, por consiguiente, es importante tener información relacionada con la biología, distribución, hospedantes, además de tener ejemplares debidamente identificados que sirvan como material de referencia o como consulta para los investigadores. La CNRF-B-DGSV cuenta con 25 cepas, de diverso origen. La forma de preservación de la colección es a través del uso de agua destilada estéril a temperatura ambiente, agua destilada estéril a 4°C y en medio de cultivo con aceite mineral. Con la intención de contribuir al conocimiento cada vez más preciso de las bacterias que afectan a los vegetales, sus productos y subproductos, la Dirección General de Sanidad Vegetal-SAGARPA, ha fijado las bases para establecer un Sistema de Diagnóstico Fitosanitario, cuyas acciones básicas es la caracterización de bacterias fitopatógenas y de aquí la importancia de una Colección de Cepas Bacterianas organizada para permitir un eficiente sistema de consulta. De ahí la importancia de crear una base de datos adecuada para facilitar la ubicación exacta de cada ejemplar y la información básica y esencial para corroboraciones posteriores de bacterias fitopatógenas. Para el desarrollo de la base de datos de la Colección Bacteriológica de la DGSV, por el número de ejemplares que la integran, el proyecto se desarrollara en cuatro etapas, Acervo de la Colección La colección cuenta hasta el momento con un total de 25 cepas bacterianas. La colección está enfocada principalmente a bacterias de importancia cuarentenaria y económica de origen nacional e internacional La Colección está compuesta por los siguientes géneros de importancias agrícola: Clavibacter Curtobacterium Dickeya Pantoea Pseudomonas Ralstonia Stenotrophomonas Xanthomonas

Title Elaboración de la base de datos de la colección de cepas de bacterias fitopatógenas de la Dirección General de Sanidad Vegetal
Identifier SNIB-JC004-JC0041707F_SIB_2017.08.10-ND
Funding Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
Study Area Description Bacterias bacterias (gram-negativas) bacterias gram negativas bacterias gram positivas proteobacteria proteobacterias beta pseudomonadales tenericutes

The personnel involved in the project:

Bárbara Hernández Macías

Collection Data

Collection Name Colección de Cepas de Bacterias Fitopatógenas;CNRF-B;Centro Nacional de Referencia Fitosanitaria, Dirección General de Sanidad Vegetal, Servicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad Agroalimentaria;CNRF-DGSV-SENASICA
Collection Identifier SNIB-JC004-JC0041707F_SIB_2017.08.10-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Curatorial Units Between 1 and 119 Ejemplar

Additional Metadata

Alternative Identifiers http://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-JC004