Computarización de la colección de dinoflagelados marinos (CODIMAR)

Descripción

Registros

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Versiones

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'Morquecho-Escamilla Ma. de L., Okolodkov Y. y A. Reyes-Salinas. 2016. Computarización de la colección de dinoflagelados marinos (CODIMAR). Colección CODIMAR. Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste S. C. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto JC006. México, D. F.'

Derechos

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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: a630ef16-132e-46d2-9e30-872d56437c63.  Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Biodiversity Information System of Mexico.

Palabras clave

Occurrence; Protoctistas; Occurrence

Datos externos

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Contactos

Cobertura geográfica

País: CUBA País: MEXICO (BAJA CALIFORNIA SUR, SINALOA)

Cobertura taxonómica

Reino: Protoctista Filo: Dinophyta, Ochrophyta Clase: Dinophyceae, Raphidophyceae Orden: Gonyaulacales, Gymnodiniales, Chattonellales, Prorocentrales, Peridiniales Familia: Ostreopsidaceae, Gonyaulacaceae, Gymnodiniaceae, Chattonellaceae, Prorocentraceae, Fibrocapsaceae, Peridiniaceae, Goniodomaceae, Ceratiaceae

Cobertura temporal

Datos del proyecto

Esta propuesta con una duración de dos años, tiene como objetivo computarizar y mejorar la calidad curatorial de la Colección de Dinoflagelados Marinos (CODIMAR) del Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. (CIBNOR). La base de datos de la CODIMAR se integrará al Sistema Nacional de Información sobre Biodiversidad de la CONABIO (SNIB), bajo la modalidad de colecciones científicas de plagas que afecten la salud humana. La CODIMAR está integrada por 131 cepas de dinoflagelados marinos aislados primordialmente del sur del Golfo de California y está formalmente registrada en la Dirección General de Vida Silvestre de la SEMARNAT. El acervo de la colección está integrado primordialmente por cepas con cualidades nocivas que pueden llegar a afectar la salud humana, ambiental y ocasionar pérdidas económicas en actividades acuícolas, pesqueras y turísticas (ver Tabla I al final de este documento). El acervo ha resultado fundamental para realizar investigación básica sobre taxonomía, fisiología, filogenia y toxicidad de especies nocivas como es el caso de Gymnodinium catenatum y Cochlodinium polykrikoides, así como en actividades docentes de nivel posgrado. Para lograr computarizar y mejorar la calidad curatorial del acervo se contempla completar la identificación taxonómica a nivel especie de 49 cepas para intercalarlas al acervo oficial de la colección. El trabajo taxonómico se realizará mediante métodos tradicionales de microscopia de luz (disección de la teca y observación de células en vivo) y de ser necesario se recurrirá a la microscopia electrónica de barrido. Se mejorará la calidad curatorial de las cepas mediante la combinación de métodos de axenización que incluye el uso de la micropipeta, diluciones seriadas y antibióticos. Como respaldo taxonómico, se mantendrán muestras en líquido fijadas con solución de Lugol y formol de cada una de las cepas. También se organizará y compilará un archivo fotográfico para crear láminas que describan los rasgos taxonómicos característicos de cada una de las especies identificadas y considerando los lineamientos que estipula la CONABIO para la elaboración de fotografías e ilustraciones digitales. El trabajo taxonómico será validado por un colega experto internacional en taxonomía de dinoflagelados marinos. La base de datos general de la colección se conformará considerando el sistema de información Biotica 5.0. CODIMAR, dinoflagelados, cepas, colección biológica, ficotoxinas, microalgas nocivas, rafidofíceas, Pacífico mexicano

Personas asociadas al proyecto:

Datos de la colección

Referencias bibliográficas

1. Fensome, R. A., Taylor, F. J. R., Norris, G., Sarjeant, W. A. S., Wharton, D. I. & Williams, G. L. 1993. A classification of living and fossil dinoflagellates. Micropaleontology. 7: 1-135.
2. Meave del Castillo, M. E., Zamudio Resendiz, M. E., Okolodkov, Y. B. & Salgado Ugarte, I. H. 2003. Ceratium balechii sp. nov. (Dinophyceae: Gonyaulacales) del Pacífico Mexicano. Hidrobiológica. 13(1): 75-91.
3. Daugbjerg, N., Hansen, G., Larsen, J. & Moestrup, Ø. 2000. Phylogeny of some of the major genera of dinoflagellates based on ultrastructure and partial LSU rDNA sequence data, including the erection of three new genera of unarmoured. dinoflagellates. Phycologia. 39(4): 302-317.
4. Iwataki, M., Kawami, H. & Matsuoka, K. 2007. Cochlodinium fulvescens sp. nov. (Gymnodiniales, Dinophyceae), a new chain-forming unarmored dinoflagellate from Asian coasts. Phycological Research. 55(3): 231-239.
5. Margalef, R. 1961. Hidrografía y fitoplancton de un área marina de la costa meridional de Puerto Rico. Investigación Pesquera. 18: 33-96.
6. Graham, H. W. 1943. Gymnodinium catenatum, a new dinoflagellate from the Gulf of California. Transactions of the American Microscopical Society. 62(3): 259-261.
7. Plate, L. 1906. Pyrodinium bahamense n.g., n. sp die Leucht-Peridinee des Feuersees von Nassau, Bahamas Arch. Arch Protistenkd. 7: 411-429.
8. Herrera-Sepúlveda, A., Hernández-Saavedra, N. Y., Medlin, L. K. & West, N. 2013. Capillary electrophoresis finger print technique (CE-SSCP): an alternative tool for the monitoring activities of HAB species in Baja California Sur Costal. Environmental Science and Pollution Research International. 20(10): 6863-6871.
9. Herrera-Sepúlveda, A. 2008. Diseño de métodos moleculares para el análisis de fitoplancton tóxico y nocivo. Tesis (Maestría en Ciencias).Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C. (CIBNOR). La Paz, B.C.S., 122 pp.
10. Iwataki, M., Kawami, H., Mizushima, K., Mikulski, C. M., Doucette, G. J., Relox, J. R. Jr., Anton, A., Fukuyo, Y. & Matsuoka, K. 2008. Phylogenetic relationships in the harmful dinoflagellate Cochlodinium polykrikoides (Gymnodiniales, Dinophyceae) inferred from LSU rDNA sequences. Harmful Algae. 7(3): 271-277.
11. Band-Schmidt, C. J., Rojas-Posadas, D. I., Morquecho, L. & Hernández-Saavedra, N. Y. 2008. Heterogeneity of LSU rDNA sequences and morphology of Gymnodinium catenatum dinoflagellate strains in Bahía Concepción, Gulf of California, Mexico. Journal of Plankton Research. 30(7): 755-763.
12. Band-Schmidt, C. J., Lilly, E. L. & Anderson, D. M. 2003. Identification of Alexandrium affine and A. margalefii (Dinophyceae) using DNA sequencing and LSU rDNA-based RFLP-PCR assays. Phycologia. 42(3): 261-268.
13. Tang, Y. Z. & Gobler, C. J. 2012. The toxic dinoflagellate Cochlodinium polykrikoides (Dinophyceae) produces resting cysts. Harmful Algae. 20: 71-80.
14. Dorantes-Aranda, J. J., García-de la Parra, L. M., Alonso-Rodríguez, R. & Morquecho, L. 2009. Hemolytic activity and fatty acids composition in the ichthyotoxic dinoflagellate Cochlodinium polykrikoides isolated from Bahía de La Paz, Gulf of California. Marine Pollution Bulletin. 58(9): 1401-1405.
15. Dorantes-Aranda, J. J., García-de la Parra, L. M., Alonso-Rodríguez, R., Morquecho, L. & Voltolina, D. 2010. Toxic Effect of the Harmful Dinoflagellate Cochlodinium polykrikoides on the Spotted Rose Snapper Lutjanus guttatus. Environmental Toxicology. 25(4): 319-326.
16. Gárate-Lizárraga, I., Bustillos-Guzmán, J. J., Morquecho, L., Band-Schmidt, C. J., Alonso-Rodríguez, R., Erler, K., Luckas, B., Reyes-Salinas, A. & Góngora-González, D. T. 2005. Comparative paralytic shellfish toxin profiles in the strains of Gymnodinium catenatum Graham from the Gulf of California, Mexico. Marine Pollution Bulletin. 50(2): 211-217.
17. Band-Schmidt, C. J., Bustillos-Guzmán, J. J., Morquecho, L., Gárate-Lizárraga, I., Alonso-Rodríguez, R., Reyes-Salinas, A., Releer, K. & Luckas, B. 2006. Variations of psp toxin profiles during different growth phases in Gymnodinium catenatum (dinophyceae) strains isolated from three Locations in the gulf of California, Mexico. Journal of Phycology. 42(4): 757-768.
18. Estrada, N. A., Rodríguez-Jaramillo, C., Contreras, G. & Ascencio, F. 2010. Effects of induced paralysis on emocytes and tissues of the giant lions-paw scallop by paralyzing shellfish poison. Marine Biology. 157:1401-1415.
19. Escobedo-Lozano, A. Y., Estrada, N. A., Ascencio, F., Contreras, G. & Alonso-Rodríguez, R. 2012. Accumulation, Biotransformation, Histopathology and Paralysis in the Pacific Calico Scallop Argopecten ventricosus by the Paralyzing Toxins of the Dinoflagellate Gymnodinium catenatum. Marine Drugs. 10(5): 1044-1065.
20. Estrada, N. A., Lagos, N., García, C., Maeda-Martínez, A. N. & Ascencio, F. 2007. Effects of the toxic dinoflagellate Gymnodinium catenatum on uptake and fate of paralytic shellfish poisons in the Pacific giant lions-paw scallop Nodipecten subnodosus. Marine Biology. 151: 1205-1214.
21. Estrada, N. A., Romero, M. J., Campa-Córdova, A., Luna, A. & Ascencio, F. 2007. Effects of the toxic dinoflagellate, Gymnodinium catenatum on hydrolytic and antioxidant enzymes, in tissues of the giant lions-paw scallop Nodipecten subnodosus. Comparative Biochemistry and Physiology Part C: Toxicology & Pharmacology. 146(4): 502-510.
22. Pérez Linares, J., Ochoa, J. L. & Gago Martínez, A. 2009. Retention and tissue damage of PSP and NSP toxins in shrimp: Is cultured shrimp a potential vector of toxins to human population?. Toxicon. 53(2): 185-195.
23. Balech, E. 1994. Three new species of the genus Alexandrium (Dinoflagellata). Transactions of the American Microscopical Society. 113(2): 216-220.
24. Dodge, J. D. 1989. Some revisions of the family Gonyaulacaceae (Dinophyceae) based on a scanning electron microscope study. Botanica Marina. 32: 275-298.
25. Faust, M. A. 1993. Prorocentrum belizeanum, Prorocentrum elegans, and Prorocentrum caribbaeum, three new benthic species (Dinophyceae) from a mangrove island, Twin Cays, Belize. Journal of Phycology. 29: 100-107.
26. Faust, M. A. 1993. Three new benthic species of Prorocentrum (Dinophyceae) from Twin Cays, Belize: P. maculosum sp nov., P. foraminosum sp nov. and P. formosum sp nov. Phycologia. 32(6): 410-418.
27. Loeblich, A. R. III, Sherley, J. L. & Schmidt, R. J. 1979. The correct position of flagellar insertion in Procentrum and description of Prorocentrum rhathymum sp. nov. (Pyrrophyta). Journal of Plankton Research. 1: 113-120.
28. Stein, F. R. Von. 1878. Der Organismus der Infusionsthiere nach eigenen Forschungen in systematischer Reihenfolge bearbeitet. III. Flagellaten I. Hälfte Engelmann, Leipzig, 154 pp.
29. Schiller, J. 1933. In: Kryptogamenflora. Dinoflagellatae. Rabenhorst, L. Eds. Vol. 10, III, pt. 1.
30. Meunier, A. 1919. Mikroplankton de la Mer Flamande. III. Les Peridiniens. M. Hayez. Mem. Mus. R. Hist. Nat. Eds. Bruxelles Hayez, 116 pp.
31. The Intergovernmental Oceanographic Commission of UNESCO. 2008. First record of Cochlodinium fulvescens in Mexican Pacific. Harmful Algal News. 37: 5. Paris, UNESCO.
32. Cuéllar-Martínez, T. C. 2012. Eficiencia de coagulantes y floculantes en la remoción de células vegetativas y toxinas de Gymnodinium catenatum Graham (Dinophyceae). Tesis (Maestría en Ciencias) Posgrado en Ciencias del Mar y Limnología de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM). 57 pp.
33. Martínez-Tecuapacho, G. A. 2009. Efecto del medio de cultivo en el crecimiento y toxicidad del dinoflagelado Gymnodinium catenatum Graham, aislado de la Bahía de Mazatlán, Sinaloa, México. Tesis de Licenciatura. Tecnológico de Estudios Superiores de Huixquilucan. 63 pp.
34. Martínez-Tecuapacho, G. A. 2011. Comparación morfológica y toxicologíca de las poblaciones de Pyrodinium bahamense Plate del sur del Golfo de California (México). Tesis (Maestría en Ciencias) Posgrado en Ciencias del Mar y Limnología de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM). 84 pp.
35. Kudela, M. R. & Glober, C. J. 2012. Harmful dinoflagellate bloms caused by Cochlodinium sp.: Global expansion and ecological strategies facilitating bloom formation. Harmful Algae. 14: 71-86.
36. Stein, F. R. Von. 1833. Der organismos der infusionthiere nach eigenen forschungen in systematischer reihenfolge bearbeitet. III. Abteilung. II. Hälfte. Die Naturgeschichte der arthrodelen flagellaten. Leipzing. Wilhelm Engelmann, 30 pp.
37. Claparède, E. & Lachmann, J. 1859. Etudes sur les Infusoires et les Rhizopodes. Mém. Inst. Genev. 5, 6: 489 pp.
38. Honsell, G. & Cabrini, M. 1991. Scrippsiella spinifera sp. nov (Pyrrhophyta): A new dinoflagellate from the Northern Adriatic Sea. Botanica Marina. 34: 167-175.
39. Dodge, J. D. 1975. The Prorocentrales (Dinophyceae). II. Revision of the taxonomy within the genus Prorocentrum. Linnean Society, Botanical Journal. 71(2): 103-125.
40. Fukuyo, Y. 1981. Taxonomical study on benthic dinoflagellates collected in coral reefs. Bulletin of the Japanese Society of Scientific Fisheries. 47(8): 967-978.
41. Ehrenberg, C. G. 1834. Beiträge zur physiologischen Kenntniss der Corallenthiere im allgemeinen, und besonders des rothen Meeres, nebst einem Versuche zur physiolo- gischen Systematik derselben. 1. Abhandlungen der Königlichen Akademie Wissenschaften zu Berlin, Physikalische Klasse. 1832(1): 225-380.
42. Hirasaka, K. 1922. On a case of discolored sea-water. Annotationes Zoologicae Japonenses. 10: 161-164. Tokio
43. Kofoid, C. A. & Michener, J. R. 1911. Reports of the scientific results of the expedition to the eastern tropical Pacific in charge of Alexander Agassiz, 22. New genera and species of Dinoflagellates. Bulletin Museum of Comparative Zoollogy at Harvard College. 54(7): 267-302.
44. Loeblich, A. R. III. 1976. Dinoflagellate Evolution: Speculation and Evidence. The Journal of Protozoology. 23(1): 13-28
45. Band-Schmidt, C. J., Morquecho, L., Hernández-Becerril, D. U., Reyes-Salinas, A. & Bravo-Sierra, E. 2004. Raphidophyceans on the coasts of Mexico. Hydrobiologia. 1(515): 79-89.
46. Band-Schmidt, C. J., Martínez-López, A., Bustillos-Guzmán, J. J., Carreón-Palau, L., Morquecho, L. Olguín-Monroy, N. O., Zenteno-Savín, T., Mendoza-Flores, A., González-Acosta, B., Hernández-Sandoval, F. H. & Tomas, C. R. 2012. Morphology, biochemistry, and growth of raphidophyte strains from the Gulf of California. Hydrobiologia. 693: 81-97.
47. Martínez-López, A., Band-Schmidt, C. J., Escobedo-Urías, D. & Ulloa-Pérez, A. E. 2006. Bloom of Chattonella subsalsa in an impacted coastal lagoon in the Gulf of California. Harmful Algae News. 31: 4-5.
48. Indelicato, S. R. & Loeblich, A. R. III. 1986. A revision of the marine peridinioid genera (Pyrrhophyta) utilizing hypothecal-cingular plate relationships as a taxonomic guideline. Japanese Journal of Phycology. 34: 153-162.
49. Throndsen, J. 1997. The planktonic marine flagellates. Identifying Marine Phytoplankton. In. Tomas, C. R. (Ed.). Academic Press, Harcourt Brace, San Diego, California: pp. 591-729.
50. Demura, M., Noël, M., Kasai, F., Watanabe, M. M. & Kawachi, M. 2009. Taxonomic revision of Chattonella antiqua, C. marina and C. ovata (Raphidophyceae) based on their morphological characteristics and genetic diversity. Phycologia. 48(6): 518-535.
51. Hara, Y. & Chihara, M. 1982. Ultrastructure and taxonomy of Chattonella (Class Raphidophyceae) in Japan. Japanese Journal of Phycology. 30: 47-56.
52. Biecheler, B. 1936. Sur une Chloromonadine nouvelle d'eau saumatre Chattonella subsalsa n. gen., n. sp. Archives de Zoologie Experimental et Générale. 79: 79-83
53. Heywood, P. 1989. Some affinities of the Raphidophyceae with other chromophyte algae. The Chromophyte Algae: Problems and Perspectives. Green, J.C., Leadbeater, B.S.C. & Diver, W.L. (Eds.). 38. Clarendon Press, Oxford, pp. 279-293.
54. Toriumi, S. & Takano, H. 1973. Fibrocapsa, a new genus in Chloromonadophyceae from Atsumi Bay, Japan. Bulletin of the Tokai Regional Fisheries Research Laboratory. 76: 25-35.
55. Cavalier-Smith, T. 1981. Eukaryote kingdoms: seven or nine?. Biosystems. 14: 461-481.

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