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Geographic distribution of lizards (genus Plestiodon) and hummingbirds endemics of México" (Distribución geográfica de lagartijas (género Plestiodon) y colibríes endémicos de México)

Latest version published by Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad on Aug 20, 2018 Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad

The great biological richness and the high number of endemism of Mexico are being threatened, because of the excessive transformation of habitat that occurs in different regions of the country, in addition to other factors. Thus, it is urgent to document the distribution of Mexican species, particularly those that are endemic, in a category of risk, or that lack of detailed geographic information. The objective of this study is to contribute to the biogeographical knowledge of some endemic species of lizards and hummingbirds in Mexico. For this, a database with detailed information about the geographical distribution of 12 endemic lizard species of the Plestiodon genera, and 24 endemic species of hummingbirds, will be compiled by the exhaustive review of literature, personal databases of the participants of this project, and online databases (e.g., REMIB). Maps of potential distribution of the study species will be obtained with MaxEnt and 19 climatic variables. These maps will be evaluated quantitatively and qualitatively. During the quantitative evaluation, the presence data will be divided into the training data (70%), and test data (30%), and will be assessed by the AUC (Area Under the Curve), in the ROC statistic; this process will be conducted in MaxEnt. In the qualitative evaluation, group experts will be evaluating the maps according to their experience. After this, the maps with the best quantitative and qualitative evaluations will be edited to obtain more realistic maps of distribution of the study species. The editing of maps will be performed using maps of the biographic provinces, hydrological sub-basins, and land cover/use from INEGI. The results will be sent to CONABIO as in this call for grants, and will be presented in different national and international congresses, as well as published in per-review journals. La gran riqueza biológica y el número tan alto de endemismos en México se ven amenazados, entre otros factores, por la desmedida transformación del hábitat que ocurre en algunas regiones del país. Por lo tanto resulta urgente documentar la distribución de sus especies, particularmente de aquellas que son endémicas, se encuentran en alguna categoría de riesgo, o bien se cuenta con pocos datos sobre su distribución. El objetivo de este estudio es contribuir con el conocimiento biogeográfico de algunas especies endémicas de lagartijas y colibríes de México. Para lo cual se compilará una base de datos con información detallada sobre la distribución geográfica de 12 especies endémicas de lagartijas del género Plestiodon y 24 especies de colibríes endémicos mediante la revisión exhaustiva de literatura, bases de datos personales de los participantes de este proyecto y bases de datos en línea (p.e., REMIB). Se obtendrán mapas de distribución potencial para las especies de estudio mediante el uso de MaxEnt y 19 variables climáticas. Los mapas se evaluaran cuantitativa y cualitativamente. En la evaluación cualitativa, se dividirán los datos de presencia en datos de entrenamiento (70%) y datos de prueba (30%) y se evaluaran mediante el AUC (Area Under the Curve) en el estadístico ROC, proceso que se realizara en MaxEnt. En la evaluación cualitativa, los expertos de los grupos evaluaran los mapas de acuerdo a su experiencia. Posteriormente, los mapas que tengan las mejores evaluaciones cuantitativas y cualitativas se editaran para obtener mapas más realísticos de la distribución de las especies de estudio. La edición de mapas se realizará utilizando los mapas de Provincias Biogeográficas, Subcuencas Hidrológicas y Uso de Suelo y Vegetación de INEGI. Los resultados serán enviados a la Conabio conforme a las especificaciones de esta convocatoria y serán presentados en diferentes congresos nacionales e internacionales, así como publicados en revistas arbitradas.

Reino: 1 Filo: 1 Clase: 2 Orden: 2 Familia: 2 Género: 11 Especie: 18 Epitetoinfraespecifico: 2

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The publisher and rights holder of this work is Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

GBIF Registration

This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: 6ef46ac2-8d5d-4a5b-a4f8-ea055d0e745d.  Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by Biodiversity Information System of Mexico.

Keywords

Occurrence; Specimen; Aves; Reptiles

External data

The resource data is also available in other formats

SNIB-JM007-CSV.ziphttp://www.snib.mx/proyectos/JM007/SNIB-JM007-CSV.zip UTF-8 CSV
SNIB-JM007-BD.ziphttp://www.snib.mx/proyectos/JM007/SNIB-JM007-BD.zip UTF-8 MDB MicrosoftAccess2007

Contacts

Who created the resource:

Teresa Patricia Feria Arroyo
Responsable
The University of TexasPan American 78539 Edinburg Informacion NO disponible MX (956) 665-7322 Texas, EUA

Who can answer questions about the resource:

Sonia Alejandra Careaga Olvera
Subcoordinadora en Información y Análisis
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal 14010 México Tlalpan MX 50045000
https://www.gob.mx/conabio

Who filled in the metadata:

CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal 14010 MÉXICO Tlalpan MX 50045000
https://www.gob.mx/conabio

Geographic Coverage

País: MEXICO (BAJA CALIFORNIA SUR, CHIHUAHUA, COLIMA, DISTRITO FEDERAL, DURANGO, GUERRERO, HIDALGO, JALISCO, MEXICO, MICHOACAN DE OCAMPO, MORELOS, NAYARIT, NUEVO LEON, OAXACA, PUEBLA, QUERETARO, QUINTANA ROO, SINALOA, SONORA, TABASCO, TAMAULIPAS, TLAXCALA, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE, YUCATAN, ZACATECAS)

Bounding Coordinates South West [16.222, -112.075], North East [26.993, -86.946]

Taxonomic Coverage

Reino: Animalia Filo: Chordata Clase: Aves, Reptilia Orden: Apodiformes, Squamata Familia: Trochilidae, Scincidae

Kingdom  Animalia
Phylum  Chordata
Class  Aves,  Reptilia
Order  Apodiformes,  Squamata
Family  Trochilidae,  Scincidae
Genus  Atthis,  Plestiodon,  Thalurania,  Cynanthus,  Hylocharis,  Campylopterus,  Chlorostilbon,  Amazilia,  Eupherusa,  Doricha,  Lampornis
Species  Atthis heloisa (Bumblebee Hummingbird, zumbador mexicano),  Plestiodon brevirostris (ajolote, eslizón chato, salamanquesa),  Thalurania ridgwayi (ninfa mexicana),  Cynanthus sordidus (colibrí obscuro, colibrí opaco, colibrí oscuro),  Plestiodon dugesii (eslizón chato, eslizón de Cuitzeo),  Hylocharis xantusii (Xantus's Hummingbird, zafiro bajacaliforniano, zafiro de Xantus),  Plestiodon parviauriculatus (ajolote, eslizón pigmeo norteño, lince, lince pigmeo norteño, salamanquesa),  Campylopterus excellens (fandanguero cola larga, fandanguero tuxtleño),  Chlorostilbon auriceps (esmeralda mexicana, esmeralda occidental, Golden-crowned Emerald),  Amazilia yucatanensis (Buff-bellied Hummingbird, colibrí vientre canelo, colibrí yucateco),  Amazilia wagneri,  Plestiodon dicei,  Eupherusa poliocerca (colibrí cola blanca, colibrí guerrerense, White-tailed Hummingbird),  Doricha eliza (colibrí cola hendida, colibrí tijereta mexicano),  Eupherusa cyanophrys (Blue-capped Hummingbird, colibrí miahuatleco, colibrí oaxaqueño),  Chlorostilbon forficatus (Cozumel emerald, esmeralda de Cozumel, esmeralda de Isla Cozumel),  Cynanthus doubledayi,  Plestiodon sumichrasti (eslizón listado, eslizón listado del sureste, sumichrast skink)
Infraspecificname  Amazilia rutila subsp. graysoni,  Lampornis amethystinus subsp. margaritae

Temporal Coverage

Start Date / End Date 1859-11-26 / 2011-11-06

Project Data

The great biological richness and the high number of endemism of Mexico are being threatened, because of the excessive transformation of habitat that occurs in different regions of the country, in addition to other factors. Thus, it is urgent to document the distribution of Mexican species, particularly those that are endemic, in a category of risk, or that lack of detailed geographic information. The objective of this study is to contribute to the biogeographical knowledge of some endemic species of lizards and hummingbirds in Mexico. For this, a database with detailed information about the geographical distribution of 12 endemic lizard species of the Plestiodon genera, and 24 endemic species of hummingbirds, will be compiled by the exhaustive review of literature, personal databases of the participants of this project, and online databases (e.g., REMIB). Maps of potential distribution of the study species will be obtained with MaxEnt and 19 climatic variables. These maps will be evaluated quantitatively and qualitatively. During the quantitative evaluation, the presence data will be divided into the training data (70%), and test data (30%), and will be assessed by the AUC (Area Under the Curve), in the ROC statistic; this process will be conducted in MaxEnt. In the qualitative evaluation, group experts will be evaluating the maps according to their experience. After this, the maps with the best quantitative and qualitative evaluations will be edited to obtain more realistic maps of distribution of the study species. The editing of maps will be performed using maps of the biographic provinces, hydrological sub-basins, and land cover/use from INEGI. The results will be sent to CONABIO as in this call for grants, and will be presented in different national and international congresses, as well as published in per-review journals. La gran riqueza biológica y el número tan alto de endemismos en México se ven amenazados, entre otros factores, por la desmedida transformación del hábitat que ocurre en algunas regiones del país. Por lo tanto resulta urgente documentar la distribución de sus especies, particularmente de aquellas que son endémicas, se encuentran en alguna categoría de riesgo, o bien se cuenta con pocos datos sobre su distribución. El objetivo de este estudio es contribuir con el conocimiento biogeográfico de algunas especies endémicas de lagartijas y colibríes de México. Para lo cual se compilará una base de datos con información detallada sobre la distribución geográfica de 12 especies endémicas de lagartijas del género Plestiodon y 24 especies de colibríes endémicos mediante la revisión exhaustiva de literatura, bases de datos personales de los participantes de este proyecto y bases de datos en línea (p.e., REMIB). Se obtendrán mapas de distribución potencial para las especies de estudio mediante el uso de MaxEnt y 19 variables climáticas. Los mapas se evaluaran cuantitativa y cualitativamente. En la evaluación cualitativa, se dividirán los datos de presencia en datos de entrenamiento (70%) y datos de prueba (30%) y se evaluaran mediante el AUC (Area Under the Curve) en el estadístico ROC, proceso que se realizara en MaxEnt. En la evaluación cualitativa, los expertos de los grupos evaluaran los mapas de acuerdo a su experiencia. Posteriormente, los mapas que tengan las mejores evaluaciones cuantitativas y cualitativas se editaran para obtener mapas más realísticos de la distribución de las especies de estudio. La edición de mapas se realizará utilizando los mapas de Provincias Biogeográficas, Subcuencas Hidrológicas y Uso de Suelo y Vegetación de INEGI. Los resultados serán enviados a la Conabio conforme a las especificaciones de esta convocatoria y serán presentados en diferentes congresos nacionales e internacionales, así como publicados en revistas arbitradas.

Title Geographic distribution of lizards (genus Plestiodon) and hummingbirds endemics of México" (Distribución geográfica de lagartijas (género Plestiodon) y colibríes endémicos de México)
Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Funding Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
Study Area Description Aves Reptiles colibríes salamanquesas; eslizones

The personnel involved in the project:

Teresa Patricia Feria Arroyo

Collection Data

Collection Name NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Bird Studies Canada;BSC;The Canadian Migration Monitoring Network;CMMN
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name NO DISPONIBLE;BSC;NO DISPONIBLE;USNM
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name National Bird Collection;USNM;National Museum of Natural History, Smithsonian Institution;NMNH-SI
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Birds Collection;FMNH;Field Museum of Natural History;FMNH
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name NO DISPONIBLE;UNAM;Universidad Nacional Autónoma de México;UNAM
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Collection of Birds;LSU;Louisiana State University, Museum of Natural Science;LSU
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Collection of Ornithology;SDNHM;San Diego Natural History Museum;SDNHM
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Birds Collection;MVZ;Museum of Vertebrate Zoology, University of California, Berkeley;MVZ-UCB
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Colección Nacional de Aves;CNAV;Instituto de Biología, Universidad Nacional Autónoma de México;IBUNAM
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Birds Collection;MCZ;Museum of Comparative Zoology, Harvard University;MCZ-HU
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Ornithology Collection;CAS-ORN;California Academy of Sciences;CAS
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Collection of Ornithology;YPM;Yale Peabody Museum of Natural History, Yale University;YPMNH-YU
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Birds Collection;CM;Carnegie Museum of Natural History;CMNH
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Ornithology Collection;AMNH;American Museum of Natural History;AMNH
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Ornithology Collection;MLZ;Occidental College;OC
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Collection of Ornithology;KU;Kansas University Natural History Museum, University of Kansas;KUNHM
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Birds Collection;DMNH;Delaware Museum of Natural History;DMNH
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Collection Name Ornithological Collection;ANSP;Academy of Natural Sciences, Philadelphia;ANSP
Collection Identifier SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Curatorial Units Between 1 and 239 Ejemplar

Additional Metadata

Alternative Identifiers http://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-JM007