Diversidad genética de las especies de cucurbita en México e hibridación entre plantas genéticamente modificadas y especies silvestres de cucurbita

Latest version published by Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad on May 30, 2020 Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad

México es el centro de origen y diversidad del género Cucurbita, ya que dentro de sus límites geográficos prosperan 15 de los 20 taxa que lo conforman. Los taxa mexicanos de Cucurbita incluyen plantas domesticadas (C. argyrosperma ssp. argyrosperma, C. pepo ssp. pepo, C. ficifolia y C. moschata), así como dos de sus ancestros silvestres (C. pepo ssp. fraterna y C. argyrosperma ssp. sororia). La revisión de todos los estudios realizados hasta la fecha con marcadores moleculares para las especies del género que crecen en México ha revelado que falta incluir a varias de las especies silvestres nativas de México, además de que no existe un verdadero registro de la diversidad genética de todas las especies. Otro aspecto que también se puede derivar de todos esos trabajos es que el genoma de las diferentes especies de Cucurbita es relativamente pequeño, de unos 337.41 Mpb/C a 422.5 Mpb/C, apenas alrededor del doble que en Arabidopsis thaliana (115 a 211 Mbp/C) y mucho menor que el maíz (2, 500 Mbp/C), y hay estudios detallados de su transcritoma y mapas con marcadores moleculares realtivmente densos (Gong et al., 2008; Gong y Lelley, 2008; Blanca et al. 2011) por lo que su estudio no debe ser tan complejo. Por otra parte, otros estudios muestran que las características reproductivas de los taxa de Cucurbita y las posibilidades de hibridizar entre ellos, implican problemas en el contexto de la liberación de Organismos Genéticamente Modificados (OGMs), por lo que en México la introducción de éstos últimos debe restringirse desde el nivel experimental. En este contexto, se deben realizar experimentos que sustenten lo anterior, donde se evalúan los posibles efectos de híbridos silvestre-OGMs en diferentes componentes de la adecuación en plantas silvestres de Cucurbita. En estos experimentos, además, será importante estudiar los componentes masculinos y femeninos de la fecundidad de dichos híbridos y especialmente determinar el movimiento de su polen. Evidentemente, se necesitarán hacer estudios detallados y análisis de paternidad, utilizando la técnica de microsatélites. Considerando lo anterior, los objetivos de este proyecto son 1) Analizar la diversidad genética de las especies de Cucurbita que crecen en México y 2) Evaluar las posibles consecuencias en diversos aspectos de la biología reproductiva y adecuación, por la hibridación de tres taxa silvestres de Cucurbita (C. pepo ssp. fraterna, C. argyrosperma ssp. sororia y C. okeechobeensis ssp. martinezii) y dos cultivares genéticamente modificados (CGMs) de la planta domesticada Cucurbita pepo ssp. pepo

Reino: 1 Filo: 1 Clase: 1 Orden: 1 Familia: 1 Género: 1 Especie: 8 Epitetoinfraespecifico: 4

Data Records

The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 768 records.

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

Downloads

Download the latest version of this resource data as a Darwin Core Archive (DwC-A) or the resource metadata as EML or RTF:

Data as a DwC-A file download 768 records in Spanish (124 KB) - Update frequency: not planned
Metadata as an EML file download in Spanish (22 KB)
Metadata as an RTF file download in Spanish (17 KB)

Versions

The table below shows only published versions of the resource that are publicly accessible.

How to cite

Researchers should cite this work as follows:

Lira S. R., Eguiarte F. L. y Montes H. S. 2018. Diversidad genética de las especies de cucurbita en México e hibridación entre plantas genéticamente modificadas y especies silvestres de cucurbita. Unidad Iztacala. Facultad de Estudios Superiores. Universidad Nacional Autónoma de México. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto KE004. Ciudad de México

Rights

Researchers should respect the following rights statement:

The publisher and rights holder of this work is Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

GBIF Registration

This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: 95e0540e-aead-4402-b77d-738b846dafc5.  Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by Biodiversity Information System of Mexico.

Keywords

Occurrence; Specimen; Plantas

External data

The resource data is also available in other formats

SNIB-KE004-CSV.ziphttp://www.snib.mx/proyectos/KE004/SNIB-KE004-CSV.zip UTF-8 CSV
SNIB-KE004-BD.ziphttp://www.snib.mx/proyectos/KE004/SNIB-KE004-BD.zip UTF-8 MDB MicrosoftAccess2007

Contacts

Who created the resource:

Rafael Lira Saade
Responsable
Universidad Nacional Autónoma de MéxicoFacultad de Estudios Superiores IztacalaDivisión de Investigación y PosgradoUnidad de Biotecnología y Prototipos 54090 Tlalnepantla Estado de México MX Tel 5623 1333 ext. 39780 Fax 5623 1193

Who can answer questions about the resource:

Sonia Alejandra Careaga Olvera
Subcoordinadora en Información y Análisis
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal 14010 México Tlalpan MX 50045000
https://www.gob.mx/conabio

Who filled in the metadata:

CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal 14010 MÉXICO Tlalpan MX 50045000
https://www.gob.mx/conabio

Geographic Coverage

País: MEXICO (AGUASCALIENTES, CAMPECHE, CHIAPAS, CHIHUAHUA, CIUDAD DE MEXICO, COAHUILA DE ZARAGOZA, COLIMA, DURANGO, GUANAJUATO, GUERRERO, JALISCO, MEXICO, MICHOACAN DE OCAMPO, MORELOS, NAYARIT, NUEVO LEON, OAXACA, PUEBLA, QUERETARO, SAN LUIS POTOSI, SINALOA, SONORA, TAMAULIPAS, TLAXCALA, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE, YUCATAN, ZACATECAS)

Bounding Coordinates South West [15.319, -111.587], North East [30.083, -89.667]

Taxonomic Coverage

Reino: Plantae Filo: Tracheophyta Clase: Equisetopsida Orden: Cucurbitales Familia: Cucurbitaceae

Kingdom  Plantae
Phylum  Tracheophyta
Class  Equisetopsida
Order  Cucurbitales
Family  Cucurbitaceae
Genus  Cucurbita
Species  Cucurbita argyrosperma (NO DISPONIBLE, pepita verde, pepitona, pepitoria, pipián, pipiana, sopoma, tamala, tecomala, variedad Guadalajara, zapoma, zapoma de cuello corto, zapoma sin cuello, arota, cabrita, cuilona, calabaza, calabaza caliente, calabaza chica de Salamanca, calabaza de cáscara dura, calabaza de milpa, pipiana, calabaza de pipian, calabaza dura, calabaza grande, calabaza pinta, calabaza serrana, calabaza temprana, cherota, chicayota, chompa, guayeca, hizayota, huizayota, calabaza de castilla, calabaza pipiana, calabaza samalayota, calabaza tamala),  Cucurbita moschata (calabaza, calabaza camotuda, calabaza colorada, calabaza criolla, calabaza criolla de Yuriria, calabaza de año, calabaza de cáscara blanda, calabaza de cáscara dura, calabaza de castilla, calabaza de gajo, calabaza dura, calabaza pachona, cehualca, criollo, cuaresmera, guito, NO DISPONIBLE, pepitas, sopoma, tamala, tamalayota, tamaloyota de pellejo, variedad costa noreste, zapoma de cuello corto, calabacita amarilla, sequaloa, calabaza pipiana, chicamita, calabaza amarilla, calabacita italiana, calabaza de bola, flor de calabaza, calabaza melón, calabaza de pellejo, calabaza samalayota, calabaza tamala, melocotón),  Cucurbita ficifolia (chilacayota, chilacayote, chilacayote pinto, NO DISPONIBLE, meloncillo, calabacilla, cidra cayote, calabacita, calabaza, calabaza melón, calabaza de agua, calabaza spaguetti, chilacayote blanco, chilacayote de cajete, chilacayote de temporal, chilacayote verde, cidracayote, mail),  Cucurbita pepo (calabaza, calabaza corriente, calabaza criolla, calabaza de castilla, calabaza de codo, calabaza de china, calabaza de manteca, calabaza de sierra, calabaza de tierra, calabaza india, criollo, huiche, imai, india, NO DISPONIBLE, tamala, tempranilla, uuli totokama, iman, vavuli, wicha, wiche, wichi, quelite, calabaza pipiana, cabeza de turco, calabaza de semilla, calabacita, flor de calabaza, calabacita criolla, calabaza güichi, calabaza mayera, calabacita yucateca, hoja de calabaza, calabaza biche, calabaza chompa, calabaza cumpata, criolla, italiana, calabaza costillona, calabaza de india, calabaza sihuina),  Cucurbita maxima (calabaza de castilla, calabaza, calabaza criolla, calabacita de bola, calabacita de castilla, calabacita banana, calabaza pepita, calabaza tamala, tamalayota),  Cucurbita foetidissima (calabacilla, calabaza silvestre, hideonda, larra pima, NO DISPONIBLE, ara chiki, meloncillo, calabaza del diablo, hierba de la víbora, aala, chichicamole, alidimai, calabacilla loca, calabacilla amarga, calabacilla de burro, calabaza, aisiki arisi, calabaza amargosa, calabacilla silvestre, calabaza de burro, calabaza hedionda),  Cucurbita pedatifolia (NO DISPONIBLE, torito, calabacilla, calabacilla cimarrona),  Cucurbita radicans (calabacilla, meloncillo, chichicamole, calabaza de coyote)
Infraspecificname  Cucurbita argyrosperma subsp. sororia (ahuichichi, calabacilla, cuacualaiztle, chicacayota, chicayota, chicayote, chicayote, coyote, chichicayota, chilacayote, halawe chipu, morchete, NO DISPONIBLE, calabaza de caballo, guedu laac, agualaxtle, coloquinto, calabaza de coyote, coyote, ahuaxtle, calabaza de burro, chamaco, tecomachichi, calabaza amarga, almochete, moriche),  Cucurbita pepo subsp. pepo (NO DISPONIBLE, calabaza, calabaza de castilla, calabaza de comer, calabaza de temporal),  Cucurbita okeechobeensis subsp. martinezii (calabaza de monte, calabaza loca, moriche, NO DISPONIBLE, silvestre),  Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma (NO DISPONIBLE, calabaza de casco, temprana, tecomata, calabaza, calabaza pinta, salayota, xtop', xka', calabaza criolla, calabaza de pepita gruesa, zapoma, chiua, chuma, calabaza tupona, pipian)

Temporal Coverage

Start Date / End Date 1954-12-10 / 1999-04-29

Project Data

México es el centro de origen y diversidad del género Cucurbita, ya que dentro de sus límites geográficos prosperan 15 de los 20 taxa que lo conforman. Los taxa mexicanos de Cucurbita incluyen plantas domesticadas (C. argyrosperma ssp. argyrosperma, C. pepo ssp. pepo, C. ficifolia y C. moschata), así como dos de sus ancestros silvestres (C. pepo ssp. fraterna y C. argyrosperma ssp. sororia). La revisión de todos los estudios realizados hasta la fecha con marcadores moleculares para las especies del género que crecen en México ha revelado que falta incluir a varias de las especies silvestres nativas de México, además de que no existe un verdadero registro de la diversidad genética de todas las especies. Otro aspecto que también se puede derivar de todos esos trabajos es que el genoma de las diferentes especies de Cucurbita es relativamente pequeño, de unos 337.41 Mpb/C a 422.5 Mpb/C, apenas alrededor del doble que en Arabidopsis thaliana (115 a 211 Mbp/C) y mucho menor que el maíz (2, 500 Mbp/C), y hay estudios detallados de su transcritoma y mapas con marcadores moleculares realtivmente densos (Gong et al., 2008; Gong y Lelley, 2008; Blanca et al. 2011) por lo que su estudio no debe ser tan complejo. Por otra parte, otros estudios muestran que las características reproductivas de los taxa de Cucurbita y las posibilidades de hibridizar entre ellos, implican problemas en el contexto de la liberación de Organismos Genéticamente Modificados (OGMs), por lo que en México la introducción de éstos últimos debe restringirse desde el nivel experimental. En este contexto, se deben realizar experimentos que sustenten lo anterior, donde se evalúan los posibles efectos de híbridos silvestre-OGMs en diferentes componentes de la adecuación en plantas silvestres de Cucurbita. En estos experimentos, además, será importante estudiar los componentes masculinos y femeninos de la fecundidad de dichos híbridos y especialmente determinar el movimiento de su polen. Evidentemente, se necesitarán hacer estudios detallados y análisis de paternidad, utilizando la técnica de microsatélites. Considerando lo anterior, los objetivos de este proyecto son 1) Analizar la diversidad genética de las especies de Cucurbita que crecen en México y 2) Evaluar las posibles consecuencias en diversos aspectos de la biología reproductiva y adecuación, por la hibridación de tres taxa silvestres de Cucurbita (C. pepo ssp. fraterna, C. argyrosperma ssp. sororia y C. okeechobeensis ssp. martinezii) y dos cultivares genéticamente modificados (CGMs) de la planta domesticada Cucurbita pepo ssp. pepo

Title Diversidad genética de las especies de cucurbita en México e hibridación entre plantas genéticamente modificadas y especies silvestres de cucurbita
Identifier SNIB-KE004-KE0041610F_corregida-ND
Funding Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
Study Area Description Plantas con flores, con semillas, con frutos como begonias, calabazas, chayotes, melones, pepinos, sandías

The personnel involved in the project:

Luis E Eguiarte Fruns
Rafael Lira Saade
Salvador Montes Hernández

Collection Data

Collection Name Colección de Germoplasma;INIFAP-CG;Centro de Investigación Regional Centro, Campo Experimental Bajío, Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias;CIRCE-CEBAJ-INIFAP
Collection Identifier SNIB-KE004-KE0041610F_corregida-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Specimen preservation methods Other
Curatorial Units Between 1 and 1 Ejemplar

Additional Metadata

Alternative Identifiers 95e0540e-aead-4402-b77d-738b846dafc5
http://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-KE004