Filogeografía y recursos genéticos de las vainillas de México

Miguel Ángel Soto Arenas1, CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad2

1 Instituto Chinoin ACHerbario de la Asociación Mexicana de Orquideología AC, 11520, México, Mexico; 2 Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad, Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal, 14010, MÉXICO, Mexico

Corresponding author(s): Miguel Ángel Soto Arenas, CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad (patricia.ramos@conabio.gob.mx)

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Abstract

Se presentan las relaciones filogenéticas de las especies mexicanas de Vanilla, con base en caracteres moleculares de la región ITS de los genes ribosomales. Las 10 especies de vainillas mexicanas pertenecen a linajes distintos del género, aunque 8 forman parte del clado que incluye a las especies económicamente más importantes (V. planifolia y V. pompona) y representan una parte importante de los recursos genéticos secundarios de este cultivo. Se hicieron evaluaciones de la variación de los ITS y se determinó que su secuencia es específica para cada taxón y que constituye una herramienta útil para el reconocimiento de material estéril dentro de este grupo. Los recursos genéticos primarios de vainilla están conformados por los cultivares y especimenes silvestres de V. planifolia. Se obtuvieron secuencias nucleotídicas de regiones genómicas supuestamente hipervariables con objeto de colectar datos que permitieran establecer una genealogía en esta especie y contestar preguntas acerca del origen, diseminación y procesos de domesticación en este cultivo. Las secuencias obtenidas (parciales de los genes Adh, CaM y GapC4), muestran nula o poca variación, aunque en uno de los casos ésta es informativa y aparentemente permite reconocer clones y sitios de origen de los especimenes. Sin embargo, la variación hasta ahora detectada es insuficiente para realizar un análisis que brinde mayor información sobre la historia de V. planifolia. Se presentan los resultados de un estudio sobre la variación y estructura genética, de las plantaciones e individuos silvestres conocidos de V. planifolia, para lo cual se utilizaron datos de 15 loci electroforéticos polimórficos. Todas las localidades presentan valores bajos en niveles de heterocigosis (Ho=0.000 a 0.078). Distintos análisis: Fst, análisis fenéticos y de parsimonia, indican una estructura de muy definida a poco definida, pero existe. La variación está repartida principalmente en dos áreas distintas, el norte de Oaxaca y el norte de Veracruz, aunque individuos aislados de localidades de Tabasco, este de Oaxaca y Chiapas pueden ser muy diferentes electroforéticamente. Los índices de fijación (F) son positivos, muy altos y cercanos a 1, y difieren significativamente del esperado para un entrecruzamiento al azar. Los datos sugieren que ha existido endogamia. Se presentan valores de flujo génico y de tasas de entrecruzamiento; el flujo génico es bajo y el sistema de reproducción dominante es la autofertilización. Los valores de diversidad genotípica no reflejan la existencia de una extensa propagación clonal y sugieren que las técnicas de electroforesis están sobrestimando el número de genotipos existente. Por último se señalan algunas observaciones sobre el manejo de los recursos genéticos de las vainillas cultivadas, indicándose rasgos deseables de otras especies mexicanas silvestres susceptibles de ser incorporados a este cultivo. La conservación de los recursos genéticos de Vanilla planifolia requiere principalmente de un plan de manejo ex situ, debido a las condiciones críticas de conservación de esta especie en estado silvestre. Se recomienda la creación de un banco de germoplasma y el mejoramiento de las condiciones en las plantaciones, especialmente en Oaxaca, como una estrategia para el mantenimiento de la diversidad genotípica en las plantaciones.
Reino: 1
Filo: 1
Clase: 1
Orden: 1
Familia: 1
Género: 3
Especie: 10
Epitetoinfraespecifico: 5

Keywords: Occurrence, Specimen, Plantas

Project details

Project title: Filogeografía y recursos genéticos de las vainillas de México
Personnel: Miguel Ángel Soto Arenas
Funding: Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
Study area descriptions/descriptor: Plantas
Con flores; angiospermas (orquídeas; vainillas; canelitas)

Data published through GBIF: http://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-J101

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: Reino: Plantae
Filo: Tracheophyta
Clase: Equisetopsida
Orden: Asparagales
Familia: Orchidaceae
Taxonomic ranks
Kingdom: Plantae
Phylum: Tracheophyta
Class: Equisetopsida
Order: Asparagales
Family: Orchidaceae
Genus: Vanilla, Palmorchis, Paphiopedilum
Species: Vanilla inodora, Vanilla planifolia, Vanilla cribbiana, Vanilla grandiflora, Vanilla perplexa, Vanilla odorata, Vanilla pompona, Vanilla insignis, Paphiopedilum fairrieanum, Vanilla phaeantha
Infraspecificname: oreja de burro, Vanilla pompona cv. acamaya, Vanilla planifolia cv. acamaya, Vanilla planifolia cv. mansa, Vanilla planifolia cv. oreja de burro
Common names: bainii, canela de cuya, cashisha, piis'oxaanti, quelite, siisbik, sisbik, sisbik-k'aax, sumi xa'nat, sumi'xa'nat, sunti'xa'nat, tlilxóchitl, vainilla, vainilla escarchada, vainilla mansa, xuucy, zizbic, platanillo, plátano vainilla, segne-xeute, vainilla, vainilla boba, vainilla pompona, vainillán, vainillón

Spatial coverage

General spatial coverage: País: MEXICO (CAMPECHE, CHIAPAS, NO DISPONIBLE, OAXACA, QUINTANA ROO, TABASCO, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE)
Coordinates: 16°6'45.97''N and 23°13'39''N Latitude; 100°3'39''W and 88°36'42''W Longitude 

Temporal coverage: May 11, 1994 - January 27, 1999

Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE
Collection identifier: SNIB-J101-Varios archivos XLS-ND
Curatorial unit: Between 1 and 67 (Ejemplar)

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive Filogeografía y recursos genéticos de las vainillas de México
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: http://www.snib.mx/iptconabio/archive.do?r=SNIB-J101
Publication date of data: 2018-08-20
Language: Spanish
Licences of use: Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License

External datasets

Dataset description
Object name: SNIB-J101-CSV.zip
Character encoding: UTF-8
Format name: CSV
Distribution: http://www.snib.mx/proyectos/J101/SNIB-J101-CSV.zip

Dataset description
Object name: SNIB-J101-BD.zip
Character encoding: UTF-8
Format name: MDB
Format version: MicrosoftAccess2007
Distribution: http://www.snib.mx/proyectos/J101/SNIB-J101-BD.zip

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2023-10-18
Hierarchy level: Dataset