Computarización de la colección de dinoflagelados marinos (CODIMAR)

María de Lourdes Morquecho Escamilla1, CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad2

1 Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste SCPrograma de Planeación Ambiental y ConservaciónLaboratorio de Ecología de Fitoplancton, 23090, La Paz, Mexico; 2 Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad, Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal, 14010, MÉXICO, Mexico

Corresponding author(s): María de Lourdes Morquecho Escamilla (lamorquecho@cibnor.mx), CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad (patricia.ramos@conabio.gob.mx)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

Morquecho-Escamilla Ma. de L., Okolodkov Y. y A. Reyes-Salinas. 2016. Computarización de la colección de dinoflagelados marinos (CODIMAR). Colección CODIMAR. Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste S. C. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto JC006. México, D. F.

Abstract

Esta propuesta con una duración de dos años, tiene como objetivo computarizar y mejorar la calidad curatorial de la Colección de Dinoflagelados Marinos (CODIMAR) del Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. (CIBNOR). La base de datos de la CODIMAR se integrará al Sistema Nacional de Información sobre Biodiversidad de la CONABIO (SNIB), bajo la modalidad de colecciones científicas de plagas que afecten la salud humana. La CODIMAR está integrada por 131 cepas de dinoflagelados marinos aislados primordialmente del sur del Golfo de California y está formalmente registrada en la Dirección General de Vida Silvestre de la SEMARNAT. El acervo de la colección está integrado primordialmente por cepas con cualidades nocivas que pueden llegar a afectar la salud humana, ambiental y ocasionar pérdidas económicas en actividades acuícolas, pesqueras y turísticas (ver Tabla I al final de este documento). El acervo ha resultado fundamental para realizar investigación básica sobre taxonomía, fisiología, filogenia y toxicidad de especies nocivas como es el caso de Gymnodinium catenatum y Cochlodinium polykrikoides, así como en actividades docentes de nivel posgrado. Para lograr computarizar y mejorar la calidad curatorial del acervo se contempla completar la identificación taxonómica a nivel especie de 49 cepas para intercalarlas al acervo oficial de la colección. El trabajo taxonómico se realizará mediante métodos tradicionales de microscopia de luz (disección de la teca y observación de células en vivo) y de ser necesario se recurrirá a la microscopia electrónica de barrido. Se mejorará la calidad curatorial de las cepas mediante la combinación de métodos de axenización que incluye el uso de la micropipeta, diluciones seriadas y antibióticos. Como respaldo taxonómico, se mantendrán muestras en líquido fijadas con solución de Lugol y formol de cada una de las cepas. También se organizará y compilará un archivo fotográfico para crear láminas que describan los rasgos taxonómicos característicos de cada una de las especies identificadas y considerando los lineamientos que estipula la CONABIO para la elaboración de fotografías e ilustraciones digitales. El trabajo taxonómico será validado por un colega experto internacional en taxonomía de dinoflagelados marinos. La base de datos general de la colección se conformará considerando el sistema de información Biotica 5.0.
CODIMAR, dinoflagelados, cepas, colección biológica, ficotoxinas, microalgas nocivas, rafidofíceas, Pacífico mexicano
Reino: 1
Filo: 2
Clase: 2
Orden: 4
Familia: 8
Género: 16
Especie: 28

Keywords: Occurrence, Specimen, Protoctistas

Project details

Project title: Computarización de la colección de dinoflagelados marinos (CODIMAR)
Personnel: María de Lourdes Morquecho Escamilla
Funding: Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
Study area descriptions/descriptor: Protoctistas
algas
protozoarios: dinoflagelados

Data published through GBIF: http://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-JC006

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: Reino: Protoctista
Filo: Dinophyta, Ochrophyta
Clase: Dinophyceae, Raphidophyceae
Orden: Gonyaulacales, Gymnodiniales, Prorocentrales, Peridiniales
Familia: Ostreopsidaceae, Gonyaulacaceae, Gymnodiniaceae, Chattonellaceae, Prorocentraceae, Peridiniaceae, Goniodomaceae, Ceratiaceae
Taxonomic ranks
Kingdom: Protoctista
Phylum: Dinophyta, Ochrophyta
Class: Dinophyceae, Raphidophyceae
Order: Gonyaulacales, Gymnodiniales, Prorocentrales, Peridiniales
Family: Ostreopsidaceae, Gonyaulacaceae, Gymnodiniaceae, Chattonellaceae, Prorocentraceae, Peridiniaceae, Goniodomaceae, Ceratiaceae
Genus: Coolia, Protoceratium, Akashiwo, Chattonella, Cochlodinium, Gymnodinium, Prorocentrum, Fibrocapsa, Scrippsiella, Pyrophacus, Pyrodinium, Ceratium, Ostreopsis, Pentapharsodinium, Alexandrium, Lingulodinium
Species: Coolia monotis, Protoceratium reticulatum, Akashiwo sanguinea, Chattonella marina, Cochlodinium polykrikoides, Gymnodinium catenatum, Prorocentrum rathymum, Prorocentrum lima, Fibrocapsa japonica, Chattonella subsalsa, Protoceratium globosum, Scrippsiella trochoidea, Cochlodinium fulvescens, Prorocentrum minimum, Prorocentrum maculosum, Pyrophacus horologium, Prorocentrum micans, Pyrodinium bahamense, Prorocentrum compressum, Ceratium balechii, Ostreopsis ovata, Prorocentrum concavum, Pentapharsodinium dalei, Scrippsiella spinifera, Alexandrium margalefi, Prorocentrum belizeanum, Alexandrium tamiyavanichii, Lingulodinium polyedra

Spatial coverage

General spatial coverage: País: CUBA (CIUDAD DE LA HABANA)
País: MEXICO (BAJA CALIFORNIA SUR, NO APLICA, SINALOA)
Coordinates: 23°5'32.53''N and 26°35'46.3''N Latitude; 111°44'20.66''W and 82°29'23.43''W Longitude 

Temporal coverage: April 15, 2000 - March 14, 2013

Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: Colección de Dinoflagelados Marinos;CODIMAR;Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C.;CIBNOR
Collection identifier: SNIB-JC006-JC0061405F_corregida-ND
Specimen preservation method: Other
Curatorial unit: Between 1 and 3 (Ejemplar)

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive Computarización de la colección de dinoflagelados marinos (CODIMAR)
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: http://www.snib.mx/iptconabio/archive.do?r=SNIB-JC006
Publication date of data: 2020-05-30
Language: Spanish
Licences of use: Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License

External datasets

Dataset description
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Format name: CSV
Distribution: http://www.snib.mx/proyectos/JC006/SNIB-JC006-CSV.zip

Dataset description
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Format name: MDB
Format version: MicrosoftAccess2007
Distribution: http://www.snib.mx/proyectos/JC006/SNIB-JC006-BD.zip

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2020-05-29
Hierarchy level: Dataset

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