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Proyecto HA013
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Título: |
Actualización de la Colección de Microorganismos de importancia acuática |
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Responsable: |
Dr. Bruno Gómez Gil Rodríguez Sala |
| | Correo electrónico: | bruno@ciad.mx |
| | Institución: | Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo AC
Coordinación de Acuicultura y Manejo Ambiental (Mazatlán, Sinaloa) |
| | Dirección: | Av Sábalo Cerritos s/n Estero del Yugo, Cerritos, Mazatlán, Sin, 82100 , México
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| | Teléfono/Fax: | Tel: 01(669) 989 8700
xt 245 o 221
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| | Fecha de inicio: | Jan 15 2010 |
| | Fecha de término: | May 21 2013 |
| | Estatus: | CONCLUIDO SATISFACTORIAMENTE |
| | Ejemplares: | 91 |
| | Especies: | 45 |
| | Cobertura: | | Regional | Noreste del país y datos de otros 35 países
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| | Región: | | Colima | | | Sinaloa | | | Nayarit | | | Hidalgo | | | Veracruz | | | Baja California Sur | | | Sonora | | | Baja California | | |
| | Resumen: | La colección CAIM ya gozó de un proyecto de computarización por parte de la CONABIO (CC007). Durante este proyecto se computarizó la Colección, pero varias de las cepas (261) quedaron incompletas en su identificación. De las 1813 cepas (registros) faltan por identificar 210 (11.6 %) y otros 51 sólo están a nivel de género; además se han adquirido varios nuevos ejemplares. Para poder llevar a cabo la actualización de la base de datos (BIOTICA), uno de los objetivos que no se pudo satisfacer plenamente en la propuesta anterior, es necesario identificar esas cepas. Para cumplir con este objetivo, en la presenta propuesta se realizarán secuenciaciones de genes útiles ("housekeeping") para poder llegar a una identificación correcta de las cepas bacterianas faltantes. Debido a que éstos genes ya se encuentran secuenciados y disponibles en bases de datos públicas (GenBank), los resultados que se ajusten con una similitud muy elevada (superior al 97-98% para el caso del 16S rARN, por ejemplo), será el criterio para identificar la cepa como perteneciente a esa especie. En caso de que el índice de similitud sea menor, se catalogará como potencial nueva especie y sujeta a posterior análisis. Con estos datos, se actualizará la base de datos para reflejar estas nuevas determinaciones y adicionar las bacterias que se han adquirido recientemente.
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| Costo: | $147,000 |
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| | Productos: |
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| | | La base de datos del proyecto fue migrada al modelo de datos del Sistema Nacional de Información sobre Biodiversidad (SNIB) en formato Access. (Modelo y diccionario de datos)
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| | | | CONABIO-SNIB-BaseDatos | ZIP | Gómez-Gil B. 2013. Actualización de la Colección de Microorganismos de Importancia Acuática (CAIM). Colección CAIM. Unidad Mazatlán. Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo A. C. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyectos HA013 y CC007. México, D. F. |
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| | | | CONABIO-SNIB-Metadato | PDF | Gómez-Gil B. 2013. Actualización de la Colección de Microorganismos de Importancia Acuática (CAIM). Colección CAIM. Unidad Mazatlán. Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo A. C. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyectos HA013 y CC007. México, D. F. |
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| | | | CONABIO-SNIB-ReporteCalidad | PDF | Gómez-Gil B. 2013. Actualización de la Colección de Microorganismos de Importancia Acuática (CAIM). Colección CAIM. Unidad Mazatlán. Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo A. C. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyectos HA013 y CC007. México, D. F. |
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| | | | CONABIO-SNIB-CSV | ZIP | Gómez-Gil B. 2013. Actualización de la Colección de Microorganismos de Importancia Acuática (CAIM). Colección CAIM. Unidad Mazatlán. Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo A. C. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyectos HA013 y CC007. México, D. F. |
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| | | DwC
GBIF | ZIP | El contenido de esta base de datos ha sido publicado en el sitio de GBIF (Global Biodiversity Information Facility) y puede consultarse en el siguiente vinculo:GBIF |
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| | | | Informe final | PDF | Gómez-Gil B. 2013. Actualización de la Colección de Microorganismos de Importancia Acuática (CAIM). Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo A.C. Unidad Mazatlán. Informe final SNIB-CONABIO proyecto No. HA013 México D. F. |
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| | | Los archivos que se pueden consultar en la sección de Productos, no necesariamente incluyen todos los resultados aportados por el proyecto. Si requiere más información puede comunicarse con Servicios Externos al correo electrónico servext@conabio.gob.mx
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