bc9f6237-f373-493a-a783-11b0c5eca844 https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-HA013 Bruno Gómez Gil Rodríguez Sala Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo ACCoordinación de Acuicultura y Manejo Ambiental (Mazatlán, Sinaloa) Responsable

Mazatlán Sinaloa 82100 MX

Tel 01(669) 989 8700 xt 245 o 221 bruno@ciad.mx CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad Dirección General de Sistemas

Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal MÉXICO Tlalpan 14010 MX

50045000 patricia.ramos@conabio.gob.mx https://www.gob.mx/conabio 2025-04-01 spa La colección CAIM ya gozó de un proyecto de computarización por parte de la CONABIO (CC007). Durante este proyecto se computarizó la Colección, pero varias de las cepas (261) quedaron incompletas en su identificación. De las 1813 cepas (registros) faltan por identificar 210 (11.6 %) y otros 51 sólo están a nivel de género; además se han adquirido varios nuevos ejemplares. Para poder llevar a cabo la actualización de la base de datos (BIOTICA), uno de los objetivos que no se pudo satisfacer plenamente en la propuesta anterior, es necesario identificar esas cepas. Para cumplir con este objetivo, en la presenta propuesta se realizarán secuenciaciones de genes útiles ("housekeeping") para poder llegar a una identificación correcta de las cepas bacterianas faltantes. Debido a que éstos genes ya se encuentran secuenciados y disponibles en bases de datos públicas (GenBank), los resultados que se ajusten con una similitud muy elevada (superior al 97-98% para el caso del 16S rARN, por ejemplo), será el criterio para identificar la cepa como perteneciente a esa especie. En caso de que el índice de similitud sea menor, se catalogará como potencial nueva especie y sujeta a posterior análisis. Con estos datos, se actualizará la base de datos para reflejar estas nuevas determinaciones y adicionar las bacterias que se han adquirido recientemente.Reino: 1 Filo: 5 Clase: 4 Orden: 14 Familia: 22 Género: 39 Especie: 120 Epitetoinfraespecifico: 4 Occurrence GBIF Dataset Type Vocabulary: http://rs.gbif.org/vocabulary/gbif/dataset_type.xml Bacterias N/A Occurrence GBIF Dataset Type Vocabulary: http://rs.gbif.org/vocabulary/gbif/dataset_type_2015-07-10.xml This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License. http://www.snib.mx/proyectos/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=HA&Numero=13 País: País: ALEMANIA País: ARGENTINA (BUENOS AIRES) País: AUSTRALIA (NO DISPONIBLE, QUEENSLAND, TASMANIA, VICTORIA) País: BANGLADESH (DHAKA BIBHAG) País: BELGICA (FLEMISH) País: BRASIL (NO DISPONIBLE, SANTA CATARINA, SAO PAULO) País: CANADA País: CHILE País: CHINA (, SHANDONG, TAIWAN, ZHEJIANG) País: COLOMBIA País: COREA DEL SUR (, CHUNG-NAM, GYEONGGI, JEJUDO) País: DINAMARCA País: ECUADOR (GUAYAS) País: EGIPTO (SOUTH SINAI) País: ENGLAND País: ESPAÑA (, ANDALUCIA, CANARIAS, CATALUÑA, GALICIA, ILLES BALEARS, NAVARRA, VALENCIA, VALENCIANA) País: ESTADOS UNIDOS DE AMERICA (, CALIFORNIA, CONNECTICUT, FLORIDA, GEORGIA, HAWAII, MARYLAND, MASSACHUSETTS, NEW YORK, NORTH CAROLINA, OHIO, OREGON, SOUTH CAROLINA, TEXAS, VIRGINIA, WASHINGTON) País: FRANCIA (, AQUITAINE, BASSE-NORMANDIE, BRETAGNE, CORSICA, LIMOUSIN, LORRAINE, POITOU-CHARENTES) País: GRECIA País: GUATEMALA (RETALHULEU) País: GUERNSEY (VALE) País: HOLANDA (ZUID-HOLLAND) País: INDIA (TAMIL NADU) País: INDONESIA País: IRAN (FARS) País: ISRAEL (, MERIDIONAL) País: ITALIA (CAMPANIA) País: JAPON (, HOKKAIDO, IWATE, KAGOSHIMA, KANAGAWA, KOCHI, NAGASAKI, SIZUOKA, TOKYO) País: MEXICO (, BAJA CALIFORNIA, BAJA CALIFORNIA SUR, COLIMA, HIDALGO, NAYARIT, SINALOA, SONORA, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE) País: NEW CALEDONIA País: NORUEGA (, HORDALAND) País: NUEVA ZELANDA (WELLINGTON) País: PAPUA NUEVA GUINEA País: PHILIPINES País: PORTUGAL País: REINO UNIDO (GREATER LONDON, WALES) País: SCOTLAND (HIGHLAND) País: TAILANDIA (, BANGKOK) País: TANZANIA (ZANZIBAR) País: WALES -117.255278 -91.891667 32.866667 14.279167 1964-09-08 2011-02-17 Reino: Bacteria Filo: Proteobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes, Tenericutes, Actinobacteria Clase: Gammaproteobacteria, Bacilli, Alphaproteobacteria, Flavobacteriia Orden: Vibrionales, Bacillales, Alteromonadales, Lactobacillales, Pseudomonadales, Enterobacteriales, Aeromonadales, Rhizobiales, Oceanospirillales, Flavobacteriales, Caulobacterales, Entomoplasmatales, Rhodobacterales, Actinomycetales Familia: Vibrionaceae, Bacillaceae, Alteromonadaceae, Staphylococcaceae, Shewanellaceae, Streptococcaceae, Moraxellaceae, Enterobacteriaceae, Enterococcaceae, Pseudoalteromonadaceae, Pseudomonadaceae, Aeromonadaceae, Brucellaceae, Oceanospirillaceae, Flavobacteriaceae, Halomonadaceae, Alcanivoracaceae, Caulobacteraceae, Micrococcaceae, Spiroplasmataceae, Rhodobacteraceae, Microbacteriaceae kingdom Bacteria phylum Proteobacteria phylum Firmicutes phylum Bacteroidetes phylum Tenericutes phylum Actinobacteria class Gammaproteobacteria class Bacilli class Alphaproteobacteria class Flavobacteriia order Vibrionales order Bacillales order Alteromonadales order Lactobacillales order Pseudomonadales order Enterobacteriales order Aeromonadales order Rhizobiales order Oceanospirillales order Flavobacteriales order Caulobacterales order Entomoplasmatales order Rhodobacterales order Actinomycetales family Vibrionaceae family Bacillaceae family Alteromonadaceae family Staphylococcaceae family Shewanellaceae family Streptococcaceae family Moraxellaceae family Enterobacteriaceae family Enterococcaceae family Pseudoalteromonadaceae family Pseudomonadaceae family Aeromonadaceae family Brucellaceae family Oceanospirillaceae family Flavobacteriaceae family Halomonadaceae family Alcanivoracaceae family Caulobacteraceae family Micrococcaceae family Spiroplasmataceae family Rhodobacteraceae family Microbacteriaceae genus Vibrio genus Bacillus genus Marinobacter genus Photobacterium genus Staphylococcus genus Oceanobacillus genus Shewanella genus Streptococcus genus Listonella genus Psychrobacter genus Escherichia genus Exiguobacterium genus Enterococcus genus Alteromonas genus Pseudoalteromonas genus Pseudomonas genus Grimontia genus Aeromonas genus Pantoea genus Agarivorans genus Ochrobactrum genus Marinomonas genus Acinetobacter genus Tenacibaculum genus Enterobacter genus Halomonas genus Aliivibrio genus Alcanivorax genus Brevundimonas genus Vagococcus genus Micrococcus genus Spiroplasma genus Yersinia genus Enterovibrio genus Roseobacter genus Salmonella genus Edwardsiella genus Microbacterium genus Salinivibrio species Vibrio fortis species Vibrio alginolyticus species Vibrio harveyi species Bacillus safensis species Vibrio parahaemolyticus species Vibrio ponticus species Vibrio campbellii species Vibrio mediterranei species Vibrio rotiferianus species Staphylococcus saprophyticus species Oceanobacillus sojae species Vibrio chagasii species Streptococcus iniae species Vibrio owensii species Vibrio crassostreae species Photobacterium damselae species Vibrio inusitatus species Listonella pelagia species Vibrio azureus species Vibrio cyclitrophicus species Vibrio coralliilyticus species Vibrio brasiliensis species Psychrobacter maritimus species Shewanella baltica species Vibrio communis species Photobacterium leiognathi species Bacillus tequilensis species Vibrio orientalis species Vibrio natriegens species Bacillus aryabhattai species Psychrobacter marincola species Photobacterium swingsii species Vibrio navarrensis species Vibrio proteolyticus species Vibrio splendidus species Vibrio kanaloae species Vibrio xuii species Escherichia coli species Vibrio ichthyoenteri species Bacillus infantis species Vibrio gigantis species Vibrio tubiashii species Shewanella xiamenensis species Oceanobacillus profundus species Exiguobacterium profundum species Vibrio sinaloensis species Staphylococcus gallinarum species Enterococcus hirae species Staphylococcus xylosus species Staphylococcus sciuri species Exiguobacterium mexicanum species Bacillus thioparans species Shewanella haliotis species Vibrio rumoiensis species Alteromonas macleodii species Pseudoalteromonas spongiae species Vibrio alfacsensis species Photobacterium indicum species Vibrio halioticoli species Vibrio cholerae species Pseudomonas beteli species Vibrio artabrorum species Vibrio vulnificus species Grimontia hollisae species Pseudomonas otitidis species Vibrio hepatarius species Vibrio neptunius species Staphylococcus epidermidis species Pseudomonas aeruginosa species Aeromonas hydrophila species Pantoea dispersa species Vibrio mimicus species Agarivorans albus species Ochrobactrum lupini species Vibrio nereis species Marinomonas communis species Vibrio fluvialis species Vibrio ordalii species Pseudomonas taiwanensis species Staphylococcus arlettae species Listonella anguillarum species Acinetobacter baumannii species Photobacterium lutimaris species Aeromonas punctata species Pseudoalteromonas piscicida species Pseudoalteromonas prydzensis species Tenacibaculum mesophilum species Enterobacter cloacae species Halomonas alimentaria species Bacillus circulans species Vibrio cincinnatiensis species Shewanella loihica species Aliivibrio fischeri species Alcanivorax dieselolei species Bacillus cereus species Photobacterium gaetbulicola species Photobacterium jeanii species Acinetobacter schindleri species Brevundimonas terrae species Enterococcus gallinarum species Vagococcus lutrae species Micrococcus yunnanesis species Vibrio diabolicus species Aliivibrio logei species Spiroplasma penaei species Enterobacter hormaechei species Yersinia enterocolitica species Vibrio aestuarianus species Enterovibrio nigricans species Vibrio gazogenes species Vibrio pomeroyi species Vibrio rarus species Enterovibrio norvegicus species Edwardsiella tarda species Aeromonas veronii species Aeromonas jandaei species Pseudomonas anguilliseptica species Microbacterium paraoxydans species Pseudomonas mosselii species Photobacterium angustum infraspecificname Photobacterium damselae subsp. damselae infraspecificname Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila infraspecificname Salmonella enterica subsp. enterica infraspecificname Salinivibrio costicola subsp. vallismortis notPlanned Patricia Ramos Rivera Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad Directora General de Sistemas

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50045000 patricia.ramos@conabio.gob.mx https://www.gob.mx/conabio Bruno Gómez Gil Rodríguez Sala Content Provider La colección CAIM ya gozó de un proyecto de computarización por parte de la CONABIO (CC007). Durante este proyecto se computarizó la Colección, pero varias de las cepas (261) quedaron incompletas en su identificación. De las 1813 cepas (registros) faltan por identificar 210 (11.6 %) y otros 51 sólo están a nivel de género; además se han adquirido varios nuevos ejemplares. Para poder llevar a cabo la actualización de la base de datos (BIOTICA), uno de los objetivos que no se pudo satisfacer plenamente en la propuesta anterior, es necesario identificar esas cepas. Para cumplir con este objetivo, en la presenta propuesta se realizarán secuenciaciones de genes útiles ("housekeeping") para poder llegar a una identificación correcta de las cepas bacterianas faltantes. Debido a que éstos genes ya se encuentran secuenciados y disponibles en bases de datos públicas (GenBank), los resultados que se ajusten con una similitud muy elevada (superior al 97-98% para el caso del 16S rARN, por ejemplo), será el criterio para identificar la cepa como perteneciente a esa especie. En caso de que el índice de similitud sea menor, se catalogará como potencial nueva especie y sujeta a posterior análisis. Con estos datos, se actualizará la base de datos para reflejar estas nuevas determinaciones y adicionar las bacterias que se han adquirido recientemente. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO) Bacterias no patógenas no patógenas y patógenas patógenas 2033-09-01T00:00:00.000-05:00 dataset SNIB-HA013-CSV.zip UTF-8 CSV http://www.snib.mx/proyectos/HA013/SNIB-HA013-CSV.zip SNIB-HA013-BD.zip UTF-8 MDB MicrosoftAccess2007 http://www.snib.mx/proyectos/HA013/SNIB-HA013-BD.zip NO APLICA SNIB-HA013-HA0131301F_corregida-ND Colección de Microorganismos de Importancia Acuática;CAIM;Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo A. C.;CIAD Ejemplar 1 1311 bc9f6237-f373-493a-a783-11b0c5eca844/v1.17.xml