2d3327e9-2d4e-4471-a4c0-a0ffc02a5201 https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-PE001 Rafael Lira Saade Universidad Nacional Autónoma de MéxicoFacultad de Estudios Superiores IztacalaDivisión de Investigación y PosgradoUnidad de Biotecnología y Prototipos Responsable

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Tel 5623 1333 ext. 39780 Fax 5623 1193 rlira@unam.mx CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad Dirección General de Sistemas

Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal MÉXICO Tlalpan 14010 MX

50045000 patricia.ramos@conabio.gob.mx https://www.gob.mx/conabio 2025-04-01 spa México es centro de origen y diversificación del género Cucurbita. Dentro de sus límites geográficos se encuentran 15 taxa del género, de los cuales 5 son endémicos de México y otros 5 son taxa domesticados. Sin embargo, estos taxa habían sido poco estudiados desde el punto de vista genético hasta antes del desarrollo de la primera fase del presente proyecto. Durante la primera fase del proyecto se realizaron avances considerables en el análisis filogenético de todos los taxa (excepto C. radicans), así como en estudios poblacionales de tres taxa domesticados (C. argyrosperma ssp. argyrosperma, C. moschata y C. pepo ssp. pepo) y sus parientes silvestres más cercanos (C. argyrosperma ssp. sororia y C. pepo ssp. fraterna). De acuerdo con estos análisis, la diversificación del grupo ocurrió durante el Pleistoceno, siendo los grupos xerofíticos perennes los más basales y observándose una progresión de norte a sur en el área de distribución de los grupos. Adicionalmente, se detectaron niveles de variación genética considerable en los taxa domesticados y señales de flujo génico entre C. argyrosperma ssp. argyrosperma y el taxa silvestre C. argyrosperma ssp. sororia. Por otra parte, se ha avanzado considerablemente en el ensamble y anotación de los genomas de C. argyrosperma ssp. argyrosperma, C. argyrosperma ssp. sororia y C. moschata; datos que permitirán identificar regiones genómicas asociadas con el síndrome de domesticación y con la respuesta a distintas condiciones ambientales. En la presente fase del proyecto se obtendrán datos moleculares de regiones de mitocondria, cloroplasto y microsatélites nucleares para complementar los datos obtenidos durante la primera fase del proyecto en las especies cultivadas y sus parientes cercanos. Además, se obtendrán SNPs con el método tGBS para todas las especies del género distribuidas en México y se secuenciarán y analizarán genomas tanto de taxa domesticados como silvestres con el objetivo de: 1) Estudiar detalladamente la diversidad genética de las especies de Cucurbita que crecen en México y su relación con variables climáticas, incluyendo aspectos genómicos a nivel población; y 2) Avanzar en el estudio genómico de diferentes especies de Cucurbita y sus comparaciones en términos de evolución molecular. Se realizarán análisis de genética y genómica de poblaciones, así como filogenia y filogeografía de taxa silvestres y domesticados y de adaptación local para profundizar en la compresión del proceso de domesticación de las especies del género Cucurbita, su biogeografía y demografía histórica y relaciones de ancestría-descendencia entre especies silvestres y domesticadas. También se van a llevar a cabo análisis de genómica comparativa, que permitan avanzar en la comprensión de los cambios genómicos asociados al síndrome de domesticación y adaptación a distintas condiciones ambientales.Reino: 1 Filo: 1 Clase: 1 Orden: 1 Familia: 1 Género: 2 Especie: 9 Epitetoinfraespecifico: 6 Occurrence GBIF Dataset Type Vocabulary: http://rs.gbif.org/vocabulary/gbif/dataset_type.xml Plantas N/A Occurrence GBIF Dataset Type Vocabulary: http://rs.gbif.org/vocabulary/gbif/dataset_type_2015-07-10.xml This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License. http://www.snib.mx/proyectos/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=PE&Numero=1 País: MEXICO (AGUASCALIENTES, BAJA CALIFORNIA, BAJA CALIFORNIA SUR, CAMPECHE, CHIAPAS, CHIHUAHUA, CIUDAD DE MEXICO, COAHUILA DE ZARAGOZA, DURANGO, GUANAJUATO, GUERRERO, HIDALGO, JALISCO, MEXICO, MICHOACAN DE OCAMPO, MORELOS, NAYARIT, NUEVO LEON, OAXACA, PUEBLA, QUERETARO, QUINTANA ROO, SAN LUIS POTOSI, SINALOA, SONORA, TABASCO, TAMAULIPAS, TLAXCALA, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE, YUCATAN, ZACATECAS) -114.122778 -87.733333 31.292879 15.918225 2013-12-08 2020-01-04 Reino: Plantae Filo: Tracheophyta Clase: Magnoliopsida Orden: Cucurbitales Familia: Cucurbitaceae kingdom Plantae phylum Tracheophyta class Magnoliopsida order Cucurbitales family Cucurbitaceae genus Cucurbita genus Apodanthera species Cucurbita moschata calabaza de castilla, calabacita amarilla, calabacita italiana, calabaza, calabaza amarilla, calabaza de bola, calabaza de castilla, calabaza de pellejo, calabaza melón, calabaza pipiana, calabaza samalayota, calabaza tamalayota (Zapoteco), calabaza támala, chicamita, flor de calabaza, jogamu (Otomí), k'uum (Maya), macú-te (Huichol), melocotón, nipishi' (Totonaco), nipshi (Totonaco), sequaloa, sikil-k'um (Maya), tamalayoxóchitl (Náhuatl), ts'ol (Maya), ts'umu (Otomí), xete (Zapoteco) species Cucurbita lundelliana calabacita, calabacilla de monte, calabacita, xbon dzek (Maya), xburut (Maya) species Cucurbita foetidissima calabacilla loca, oreja de burro, aala, aisiki arisi, alidimai, ara chiki, calabacilla, calabacilla amarga, calabacilla de burro, calabacilla loca, calabacilla silvestre, calabaza, calabaza amargosa, calabaza de burro, calabaza del diablo, calabaza hedionda, calabaza silvestre, chichicamole, chilacayote (Náhuatl), cua-aua (Chontal de Oaxaca), gueeto-lana (Zapoteco), hierba de la víbora, meloncillo species Cucurbita radicans calabaza cimarrona, calabacilla, calabaza de coyote, chichicamole, meloncillo, yutmú (Otomí) species Cucurbita ficifolia chilacayote, calabacilla, calabacita, calabaza, calabaza de agua, calabaza melón, calabaza spaguetti, chilacayota (Náhuatl), chilacayote (Náhuatl), chilacayote blanco, chilacayote de cajete, chilacayote de temporal, chilacayote verde, cidra cayote, cidracayote, cyutsi'i (Mixe), gueeto-xiu (Zapoteco), gueto-xembé (Zapoteco), guito-shembe (Zapoteco), guitu-xembe (Zapoteco), ka'y (Totonaco), ka'ya' (Totonaco), kyutsi'i (Mixe), ma-cúa (Chinanteco), mail, meloncillo, mon-a-ua (Chontal de Oaxaca), ndëmi'i (Mazahua), silacayote (Náhuatl), t'scatsu (Tarasco), ticati (Tarasco), ticatsa (Tarasco), ticatz (Tarasco), ticotz (Tarasco), tikatsu (Tarasco), tzalacajoj (Náhuatl), tziquilayojtli (Náhuatl) species Cucurbita cordata melon de coyote, calabacilla amarga, melón cimarrón species Cucurbita pedatifolia tetele, calabacilla, calabacilla cimarrona, torito species Cucurbita digitata calabacilla, chilacayota (Náhuatl), chilacayote (Náhuatl), melón de coyote, sangre de cristo species Apodanthera undulata arco negro, calabaza hedionda, chulub (Maya), ebano, gubaguinashi (Zapoteco), guye-biche (Zapoteco), lan-uo-shé (Chontal de Oaxaca), matagallina, melón de coyote, melón loco, palo de arco, palo de arco negro, palo mata gallina infraspecificname Cucurbita argyrosperma subsp. sororia ahuachichi, calabacilla, calabaza de coyote, chicayote, tecomachichi, aguachichi (Náhuatl), agualaxtle, aguichichi (Náhuatl), ahuaxtle, almochete, calabacilla, calabaza amarga, calabaza de burro, calabaza de caballo, calabaza de coyote, chamaco, chicayota (Náhuatl), chichicayota (Náhuatl), chichicayote (Náhuatl), chichicoyota (Náhuatl), coloquinto, coyote, guedu laac, moriche, sicayota (Náhuatl), tecomachichi, tolenche (Náhuatl), tololonche (Náhuatl), tolonche (Náhuatl), tolonchi (Náhuatl) infraspecificname Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma arota, chigua, chompa, kuum, patipona, pipiana, calabaza, calabaza criolla, calabaza de casco, calabaza de pepita gruesa, calabaza pinta, calabaza tupona, chiua, chuma, nipxi (Totonaco), pipian, salayota, tecomata, temprana, xka', xtop', zapoma infraspecificname Cucurbita maxima subsp. maxima kabocha, semilla blanca, calabacita banana, calabacita de bola, calabacita de castilla, calabaza, calabaza criolla, calabaza de castilla, calabaza pepita, calabaza tamala, calabaza tamalayota (Zapoteco), gueeto goo (Zapoteco), gueto-guu (Zapoteco), guito-gu (Zapoteco), is-k'um (Maya), k'um (Maya), noh-k'um (Maya), queeto-coo (Zapoteco), tamalayota, uajpada (Cuicateco), ualama (Cuicateco), xigaba (Zapoteco) infraspecificname Cucurbita pepo subsp. pepo calabacita, calabaza, calabaza de castilla, calabaza de comer, calabaza de temporal, güiche (Zapoteco), huiche (Zapoteco), shikin-iñu (Mixteco) infraspecificname Cucurbita pepo subsp. fraterna calabacilla loca, calabacilla, calabacilla loca, calabaza amarga, calabaza amargosa infraspecificname Cucurbita okeechobeensis subsp. martinezii calabacilla, calabacilla de monte notPlanned Patricia Ramos Rivera Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad Directora General de Sistemas

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50045000 patricia.ramos@conabio.gob.mx https://www.gob.mx/conabio Rafael Lira Saade Content Provider Salvador Montes Hernández Principal Investigator México es centro de origen y diversificación del género Cucurbita. Dentro de sus límites geográficos se encuentran 15 taxa del género, de los cuales 5 son endémicos de México y otros 5 son taxa domesticados. Sin embargo, estos taxa habían sido poco estudiados desde el punto de vista genético hasta antes del desarrollo de la primera fase del presente proyecto. Durante la primera fase del proyecto se realizaron avances considerables en el análisis filogenético de todos los taxa (excepto C. radicans), así como en estudios poblacionales de tres taxa domesticados (C. argyrosperma ssp. argyrosperma, C. moschata y C. pepo ssp. pepo) y sus parientes silvestres más cercanos (C. argyrosperma ssp. sororia y C. pepo ssp. fraterna). De acuerdo con estos análisis, la diversificación del grupo ocurrió durante el Pleistoceno, siendo los grupos xerofíticos perennes los más basales y observándose una progresión de norte a sur en el área de distribución de los grupos. Adicionalmente, se detectaron niveles de variación genética considerable en los taxa domesticados y señales de flujo génico entre C. argyrosperma ssp. argyrosperma y el taxa silvestre C. argyrosperma ssp. sororia. Por otra parte, se ha avanzado considerablemente en el ensamble y anotación de los genomas de C. argyrosperma ssp. argyrosperma, C. argyrosperma ssp. sororia y C. moschata; datos que permitirán identificar regiones genómicas asociadas con el síndrome de domesticación y con la respuesta a distintas condiciones ambientales. En la presente fase del proyecto se obtendrán datos moleculares de regiones de mitocondria, cloroplasto y microsatélites nucleares para complementar los datos obtenidos durante la primera fase del proyecto en las especies cultivadas y sus parientes cercanos. Además, se obtendrán SNPs con el método tGBS para todas las especies del género distribuidas en México y se secuenciarán y analizarán genomas tanto de taxa domesticados como silvestres con el objetivo de: 1) Estudiar detalladamente la diversidad genética de las especies de Cucurbita que crecen en México y su relación con variables climáticas, incluyendo aspectos genómicos a nivel población; y 2) Avanzar en el estudio genómico de diferentes especies de Cucurbita y sus comparaciones en términos de evolución molecular. Se realizarán análisis de genética y genómica de poblaciones, así como filogenia y filogeografía de taxa silvestres y domesticados y de adaptación local para profundizar en la compresión del proceso de domesticación de las especies del género Cucurbita, su biogeografía y demografía histórica y relaciones de ancestría-descendencia entre especies silvestres y domesticadas. También se van a llevar a cabo análisis de genómica comparativa, que permitan avanzar en la comprensión de los cambios genómicos asociados al síndrome de domesticación y adaptación a distintas condiciones ambientales. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO) Plantas con flores como begonias, calabazas, chayotes, melones, pepinos, sandías 2033-09-01T00:00:00.000-05:00 dataset SNIB-PE001-CSV.zip UTF-8 CSV http://www.snib.mx/proyectos/PE001/SNIB-PE001-CSV.zip SNIB-PE001-BD.zip UTF-8 MDB MicrosoftAccess2007 http://www.snib.mx/proyectos/PE001/SNIB-PE001-BD.zip NO APLICA SNIB-PE001-PE0012111F_SIB.2022.05.19-ND Banco de Semillas;FESI;Facultad de Estudios Superiores Iztacala, Universidad Nacional Autónoma de México;FESI-UNAM Ejemplar 1 222 2d3327e9-2d4e-4471-a4c0-a0ffc02a5201/v1.7.xml