Código de barras genético de cinco grupos críticos de la flora de México

Occurrence
Dernière version Publié par Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad le mai 8, 2026 Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad

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Description

Los códigos de barras genéticos consisten en secuencias cortas y estandarizadas de DNA que permiten la identificación de las especies de organismos conocidas y el descubrimiento de especies desconocidas. A diferencia de muchos animales (y otros eucariontes) para los que el gen mitocondrial CO1 es fácil de secuenciar y altamente informativo, las plantas terrestres presentan problemas particulares para la selección de un código de barras. Esto se debe a la baja tasa de substitución y la frecuencia de rearreglos del genoma mitocondrial. También existen problemas debidos a poliploidía y paralogía en los genes nucleares. Aunque existe consenso en que el genoma del cloroplasto es la fuente más prometedora de códigos de barras genéticos para plantas, la tasa de evolución relativamente baja de muchos genes de plástidos hace necesaria la concatenación de varias secuencias para incrementar la resolución. En este proyecto se generarán códigos de barras de DNA de cloroplasto de 319 ejemplares de c. 170 especies pertenecientes a nueve familias de plantas vasculares de gran relevancia biológica, ecológica, económica y cultural en México, incluyendo Agavaceae, Cactaceae, Crassulaceae, Cupressaceae, Orchidaceae, Pinaceae, Podocarpaceae y Taxaceae. En la selección de los grupos de estudio se priorizaron los taxones listados en la Norma Oficial Mexicana NOM-059-ECOL-2001. Los códigos propuestos consistirán de secuencias concatenadas de cuatro regiones en total. Candidatos por evaluar incluyen las regiones codificantes de los genes matK, rbcL y rpoC1, y los espaciadores intergénicos trnH-psbA, psbK-psbI y dos más hipervariables por definir en el curso de este estudio.Reino: 1 Filo: 2 Clase: 3 Orden: 7 Familia: 8 Género: 61 Subgénero: 4 Especie: 162 Epitetoinfraespecifico: 4

Enregistrements de données

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Mots-clé

Occurrence; Plantas; Occurrence

Données externes

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Contacts

David Gernandt
  • Créateur
  • Responsable
Universidad Nacional Autónoma de MéxicoInstituto de Biología
04510 de México
Distrito Federal
MX
  • 5622 9065,
CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  • Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
14010 MÉXICO
Tlalpan
MX
  • 50045000
Patricia Ramos Rivera
  • Personne De Contact
  • Directora General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  • Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
14010 México
Tlalpan
MX
  • 50045000

Couverture géographique

País: EL SALVADOR (CHALATENANGO, SANTA ANA, SONSONATE) País: ESTADOS UNIDOS DE AMERICA (OREGON) País: GUATEMALA (ALTA VERAPAZ, GUATEMALA, SONSONATE) País: MEXICO (AGUASCALIENTES, BAJA CALIFORNIA, BAJA CALIFORNIA SUR, CHIAPAS, CHIHUAHUA, CIUDAD DE MEXICO, COAHUILA DE ZARAGOZA, DISTRITO FEDERAL, DURANGO, GUANAJUATO, GUERRERO, HIDALGO, JALISCO, MEXICO, MORELOS, NAYARIT, NUEVO LEON, OAXACA, PUEBLA, QUERETARO, SAN LUIS POTOSI, SINALOA, SONORA, TAMAULIPAS, TLAXCALA, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE, ZACATECAS)

Enveloppe géographique Sud Ouest [13,872, -116,811], Nord Est [32,557, -89,552]

Couverture taxonomique

Reino: Plantae Filo: Tracheophyta, Magnoliophyta Clase: Magnoliopsida, Liliopsida, Pinopsida Orden: Asparagales, Saxifragales, Caryophyllales, Ephedrales, Pinales, Araucariales, Cupressales Familia: Orchidaceae, Asparagaceae, Crassulaceae, Cactaceae, Ephedraceae, Pinaceae, Podocarpaceae, Cupressaceae

Kingdom Plantae
Phylum Tracheophyta, Magnoliophyta
Class Magnoliopsida, Liliopsida, Pinopsida
Order Asparagales, Saxifragales, Caryophyllales, Ephedrales, Pinales, Araucariales, Cupressales
Family Orchidaceae, Asparagaceae, Crassulaceae, Cactaceae, Ephedraceae, Pinaceae, Podocarpaceae, Cupressaceae
Genus Galeandra, Encyclia, Galeoglossum, Laelia, Manfreda, Papperitzia, Helleriella, Corallorhiza, Oncidium, Echeveria, Geohintonia, Clowesia, Cyrtochiloides, Agave, Yucca, Sedum, Rhynchostele, Prosthechea, Vanilla, Epidendrum, Pelexia, Cuitlauzina, Beschorneria, Ephedra, Pinus, Eurystyles, Furcraea, Lepanthes, Podocarpus, Sobralia, Abies, Callitropsis, Mammillaria, Cumarinia, Mormodes, Rossioglossum, Graptopetalum, Ariocarpus, Bletia, Taxodium, Masdevallia, Lycaste, Pseudogoodyera, Ortegocactus, Trichopilia, Acharagma, Juniperus, Echinocactus, Tacitus, Sigmatostalix, Polianthes, Picea, Phragmipedium, Plectrophora, Lophophora, Astrophytum, Cypripedium, Pseudotsuga, Coelia, Echinocereus, Echinomastus
Subgenus Littaea, Agave, Pinus, Strobus
Species Galeandra greenwoodiana, Encyclia adenocaula, Galeoglossum thysanochilum, Manfreda pubescens, Papperitzia leiboldii, Helleriella nicaraguensis, Corallorhiza macrantha, Oncidium incurvum (angelitos), Manfreda variegata, Geohintonia mexicana (biznaga del yeso), Oncidium ornithorhynchum, Clowesia rosea, Cyrtochiloides ochmatochila (oncidium de abanico), Agave (Littaea) polianthiflora (maguey), Agave (Agave) vizcainoensis (maguey, maguey de El Vizcaíno), Yucca lacandonica, Echeveria longissima, Echeveria setosa, Sedum torulosum, Rhynchostele rossii, Rhynchostele cordata (manuelitos, odontoglossum acorazonado, tigrillas), Laelia anceps (camote de San Diego, flor de todos los santos, lipa-nish-nopf-ni (Chontal de Oaxaca), lirio, tekxochitl (Náhuatl), tzicxóchitl (Náhuatl), vara de San Diego), Prosthechea chondylobulbon (conchitas), Vanilla parviflora, Prosthechea pseudopygmaea, Epidendrum parkinsonianum (baros, lirio, lirio pata de gallo, lirio pata de paloma, pata de gallo, pata de paloma), Pelexia funckiana, Cuitlauzina pendula (chorrito, cola de borrego, cuitlauzina perfumada, pozolillo, uts pîj (Mixe)), Oncidium sphacelatum (anis nikte' (Español-Maya), flor de la santa cruz, flor de mayo, mayitos, zuch´ zuch´ jaz (Tseltal)), Prosthechea cochleata (am (Maya), araña, conchita, flor de concha, lirio, pulpito), Epidendrum raniferum (lluvia de estrellas), Beschorneria calcicola (ahuimo mixteco), Ephedra compacta (canutillo, cañatilla, comida de víbora, pitamo real, retama real, sanguinaria, tepopote), Pinus (Pinus) attenuata (pino), Eurystyles borealis, Furcraea guatemalensis (ishté (Tojolabal), maguey, maguey cimarrón, ojoyó (Zoque)), Sedum tortuosum, Sedum platyphyllum, Lepanthes tenuiloba, Oncidium suttonii, Pinus (Pinus) contorta (pino, pino de San Pedro Mártir), Agave (Littaea) striata (estoquillo, maguey, maguey espadín, palmita, peinecillo), Agave (Littaea) stricta (maguey), Yucca carnerosana (palma, palma barreta, palma de San José, palma de San Pedro, palma de ixtle, palma loca, yuca), Manfreda nanchititlensis (amole de Nanchititla), Manfreda maculata, Rhynchostele aptera, Manfreda guttata, Agave (Littaea) chiapensis (maguey, maguey chamula), Manfreda longiflora, Rhynchostele maculata, Galeoglossum cactorum, Podocarpus matudae (cedro blanco, jarilla, lengua de pájaro, olivo, palmilla, palmillo, palmito, peinecillo, sabino), Furcraea pubescens, Echeveria derenbergii, Echeveria purpusiorum, Rhynchostele cervantesii (lirio, mariposa, tigrillo), Sobralia macdougallii, Agave (Littaea) parviflora (amole, maguey, tauta), Abies hickelii, Callitropsis lusitanica (cedro, cedro blanco, cedro rojo, ciprés, pino, sabino, sësa'na (Mazahua), tatzcanti (Náhuatl), táscate), Mammillaria huitzilopochtli (biznaga, biznaga del dios sol y guerra), Laelia superbiens (candelaria de la vara larga, flor de la candelaria, laelia de San José, lirios, palo de águila, tanal), Beschorneria rigida, Laelia speciosa (chichiltepetzacuxóchitl (Náhuatl), deuntzá (Otomí), flor de corpus, itzamacua (Tarasco), juritzquiri-tzitzica (Tarasco), lirio), Cumarinia odorata (biznaga, biznaga olorosa, biznaga partida olorosa), Mormodes sotoana, Rossioglossum splendens, Graptopetalum macdougallii, Echeveria globulosa, Echeveria moranii, Ariocarpus kotschoubeyanus (biznaga maguey, biznaga maguey pata de venado, falso peyote, pata de venado, peyote, pezuña de venado), Agave (Littaea) titanota (maguey, maguey del sol), Mammillaria crucigera (biznaga con espinas en cruz, biznaguita), Corallorhiza striata, Callitropsis forbesii (ciprés, ciprés Guadalupe, ciprés brillante, ciprés de Tecate, ciprés negro), Oncidium oliganthum, Bletia urbana (chautle (Náhuatl)), Corallorhiza maculata, Ariocarpus agavoides (biznaga maguey pequeño, magueycito, magueyito), Taxodium mucronatum (ahoehuetl (Náhuatl), ahuehuete, ahuéhuetl (Náhuatl), cedro, chuche (Huasteco), ciprés, hauoli (Guarijío), jahuolí (Guarijío), jauolí (Guarijío), matéoco (Tarahumara), penhamu (Tarasco), penjamu (Tarasco), quitsincui (Zoque), sabino, t-nuyucul (Mixteco), tnuyucu (Mixteco), ya'ayitz (Zapoteco), yaga-chichicina (Zapoteco), yaga-guichi-ciña (Zapoteco), yaga-quichi (Zapoteco), yaga-quichiciña (Zapoteco), yagachicina (Zapoteco), yucun-datura (Zapoteco), yág-guizdóo (Zapoteco), yáguistóo (Zapoteco), árbol de Sta. María del tule, árbol del tule), Prosthechea vitellina (manuelitos, toalxóchitl (Náhuatl), uts pîj (Mixe)), Oncidium sotoanum, Masdevallia tuerckheimii, Ariocarpus trigonus (biznaga maguey chautle, chaute, chautle (Náhuatl)), Echeveria coccinea, Graptopetalum grande, Prosthechea citrina (aróracua (Tarasco), azucena amarilla, costicoatexóchitl (Náhuatl), costictexóchitl (Náhuatl), orquídea hojas de cebolla, tatzingueni (Purépecha)), Lycaste crinita, Echeveria kimnachii, Pinus (Strobus) maximartinezii (pino, pino azul, piñonero de Zacatecas, piñón, piñón real), Sedum craigii, Pseudogoodyera pseudogoodyeroides, Ortegocactus macdougallii (biznaga pistache de chico ortega), Trichopilia galeottiana, Acharagma aguirreana, Trichopilia tortilis, Pinus (Pinus) radiata (pino, pino de Monterrey, pino radiata), Galeoglossum tubulosum, Ariocarpus fissuratus (biznaga peyotillo, chaute, chautle (Náhuatl), falso peyote, hikuli sunamé (Tarahumara), híkuli sunami (Tarahumara), peyote, peyote cimarrón, suname (Tarahumara), sunami (Tarahumara), tzuwiri (Tarahumara)), Pinus (Strobus) johannis (pino, pino piñonero, piñón), Juniperus deppeana (aorí (Tarahumara), cedro, cedro blanco, cedro chino, cedro de incienso, ciprés, enebro, junípero, sabino, táscate), Echinocactus parryi (barrilito, biznaga tonel del lago guzmán), Tacitus bellus, Corallorhiza odontorhiza, Juniperus monticola (cedro, cedro blanco, cedro colorado, ciprés, enebro, enebro azul, sabino), Agave petrophila (maguey), Mammillaria candida (biznaga cabeza de viejo, biznaga de Ortiz-Rubio, bola de nieve, cabeza de viejo, viejita, viejito), Mammillaria sanchez-mejoradae (biznaga de Sánchez-Mejorada, biznaguita), Pinus (Strobus) flexilis (pino, pino enano, pino prieto, pino torcido), Echeveria amphoralis, Echeveria elegans, Echeveria secunda (conchita, oreja de ratón, siempre viva), Epidendrum lowilliamsii, Manfreda potosina (amole cenizo), Rossioglossum williamsianum, Sigmatostalix mexicana (sigmatostalix mexicano), Polianthes graminifolia, Corallorhiza bulbosa, Sedum suaveolens, Picea chihuahuana (pinabete, pinabete de Nuevo Léon, pinabete espinoso, pinabeto), Laelia furfuracea (flor de nochebuena, gihtsl (Mixteco), ita achaca (Mixteco), ita nchaca (Mixteco), ita ndeka morada (Mixteco), laelia de muertos, lirio de San Francisco, monja), Epidendrum dorsocarinatum, Oncidium suave, Vanilla pompona (platanillo, plátano vainilla, segne-xeute (Totonaco), vainilla, vainilla boba, vainilla pompona, vainillán, vainillón), Mormodes pardalinata, Echeveria laui, Phragmipedium exstaminodium, Oncidium poikilostalix, Plectrophora alata, Lophophora williamsii (bacánoc (Tarahumara), beyo (Otomí), biznaga, botones de mescal, camaba (Tepehuano del sur), chice (Cora), chíeé (Cora), curi (Cora), el capullo, el resplandeciente, hicori (Huichol), hicouri (Tarahumara), hikule waname (Huichol), hikuli (Huichol), hikuli walula saeliami (Huichol), houanamé (Tarahumara), huanamé (Tarahumara), huatari (Cora), hícore (Huichol), hículi, hícuri (Huichol), híkoli (Tarahumara), híkori (Tarahumara), híkuli (Tarahumara), híkuli huanamé (Tarahumara), híkuli walúla (Tarahumara), icuri (Cora), jicore (Huichol), jicori (Huichol), jicule (Huichol), jiculi (Huichol), jiculi huanamé (Tarahumara), jicure (Huichol), jicuri (Huichol), jicurite (Huichol), jikuhl sik (Tepehuano del sur), joutouri (Tarahumara), jícoe, jícoli (Tarahumara), jícori, jíkuli (Tarahumara), jíkuri (Tarahumara), kamaba (Tepehuano del sur), kamba (Tepehuano del sur), meca, mezcal, pejote, pellote, peote, peyori, peyot, peyote, peyote seni, peyotl (Náhuatl), peyule, peyull, pezote, piote, piotl, piule, raíz diabólica, rhaitoumuanitari-hikuri (Huichol), saelíami (Tarahumara), señi, tuna de tierra, tzinouritehua-hikuri (Huichol), venado divino, xicora (Huichol), xicori (Huichol)), Pinus (Strobus) remota (pino, piñón de Catarina), Mormodes luxata, Astrophytum caput-medusae (medusa), Cypripedium irapeanum (flor de calavera, flor del pelícano, pichahuastle (Náhuatl), pichehuastle (Náhuatl), pipixihuatli (Náhuatl), pisahuastle (Náhuatl)), Abies vejarii, Yucca mixtecana, Lycaste aromatica (canela, canela ornamental, canelita, flor de canela, torito), Pinus (Strobus) quadrifolia (pino, pino piñonero, piñonero, piñón, piñón bueno, piñón de California), Clowesia thylaciochila, Furcraea parmentieri, Agave (Agave) lurida, Pseudotsuga menziesii (abeto, abeto Douglas, acahuite, cahuite, falso abeto, hayarín, hayarín colorado, oyamel, oyamel colorado, oyamel de barranca, pinabete, romerillo), Coelia macrostachya, Oncidium pollardii, Graptopetalum saxifragoides, Eurystyles auriculata, Sedum frutescens (siempreviva), Galeandra batemanii, Coelia densiflora, Mormodes nagelii, Cypripedium molle, Echinocereus delaetii (alicoche viejo chaparro, viejito), Echinomastus unguispinus (biznaga, biznaga bola de espinas de garra, nido de pájaro), Agave (Littaea) dasylirioides (maguey, maguey intrépido), Prosthechea brassavolae, Echeveria shaviana, Beschorneria tubiflora, Helleriella guerrerensis, Phragmipedium humboldtii, Prosthechea karwinskii (ita ndeka (Mixteco), orquídea hojas de cebolla), Graptopetalum fruticosum
Infraspecificname Echeveria setosa minor, Echeveria setosa oteroi, Echeveria setosa deminuta, Pinus (Pinus) contorta murrayana (pino, pino de San Pedro Mártir)

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 1972-03-01 / 2010-09-13

Données sur le projet

Los códigos de barras genéticos consisten en secuencias cortas y estandarizadas de DNA que permiten la identificación de las especies de organismos conocidas y el descubrimiento de especies desconocidas. A diferencia de muchos animales (y otros eucariontes) para los que el gen mitocondrial CO1 es fácil de secuenciar y altamente informativo, las plantas terrestres presentan problemas particulares para la selección de un código de barras. Esto se debe a la baja tasa de substitución y la frecuencia de rearreglos del genoma mitocondrial. También existen problemas debidos a poliploidía y paralogía en los genes nucleares. Aunque existe consenso en que el genoma del cloroplasto es la fuente más prometedora de códigos de barras genéticos para plantas, la tasa de evolución relativamente baja de muchos genes de plástidos hace necesaria la concatenación de varias secuencias para incrementar la resolución. En este proyecto se generarán códigos de barras de DNA de cloroplasto de 319 ejemplares de c. 170 especies pertenecientes a nueve familias de plantas vasculares de gran relevancia biológica, ecológica, económica y cultural en México, incluyendo Agavaceae, Cactaceae, Crassulaceae, Cupressaceae, Orchidaceae, Pinaceae, Podocarpaceae y Taxaceae. En la selección de los grupos de estudio se priorizaron los taxones listados en la Norma Oficial Mexicana NOM-059-ECOL-2001. Los códigos propuestos consistirán de secuencias concatenadas de cuatro regiones en total. Candidatos por evaluar incluyen las regiones codificantes de los genes matK, rbcL y rpoC1, y los espaciadores intergénicos trnH-psbA, psbK-psbI y dos más hipervariables por definir en el curso de este estudio.

Titre Código de barras genético de cinco grupos críticos de la flora de México
Identifiant SNIB-GE021-GE021_Enlaces-ND
Financement Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
Description du domaine détude / de recherche Plantas con flores como acelgas, amarantos, betabeles, biznagas, bugambilias, claveles, epazotes, espinacas, huauhzontles, jojobas, nopales, quelites, quinoas, saguaros, trigos serracenos, tunas, verdolagas, xoconostles con flores como agapantos, ajos, azafránes, cebollas, espárragos, gladiolas, magueyes, orquídeas, patas de elefante, sábilas, vainillas, yucas con flores como echeverias, kalanchoes, liquidámbares, siempre vivas con flores, con semillas, con frutos como acelgas, amarantos, betabeles, biznagas, bugambilias, claveles, epazotes, espinacas, huauhzontles, jojobas, nopales, quelites, quinoas, saguaros, trigos serracenos, tunas, verdolagas, xoconostles con flores, con semillas, con frutos como agapantos, ajos, azafránes, cebollas, espárragos, gladiolas, magueyes, orquídeas, patas de elefante, sábilas, vainillas, yucas Con flores; angiospermas (orquídeas; vainillas; canelitas) sin flores como abetos, araucarias, cedros, cícadas, cipreses, efedras, ginkgos, pinos, secuoyas sin flores, con semillas, sin frutos como abetos, araucarias, cedros, cícadas, cipreses, efedras, ginkgos, pinos, secuoyas

Les personnes impliquées dans le projet:

David Gernandt
  • Content Provider

Données de collection

Nom de la collection Herbario;SERO;Sociedad para el Estudio de los Recursos Bióticos de Oaxaca, A. C.;SERBO
Identifiant de collection SNIB-GE021-GE021_Enlaces-ND
Identifiant de la collection parente NO APLICA
Nom de la collection Herbario;AMO;Asociación Mexicana de Orquideología, Instituto Chinoin A.C.;AMO
Identifiant de collection SNIB-GE021-GE021_Enlaces-ND
Identifiant de la collection parente NO APLICA
Nom de la collection Herbario;XAL;Instituto de Ecología, A. C., Xalapa;INECOL
Identifiant de collection SNIB-GE021-GE021_Enlaces-ND
Identifiant de la collection parente NO APLICA
Nom de la collection Herbario Luz María Villarreal de Puga;IBUG;Centro Universitario de Ciencias Biológicas y Agropecuarias, Universidad de Guadalajara;CUCBA-UDG
Identifiant de collection SNIB-GE021-GE021_Enlaces-ND
Identifiant de la collection parente NO APLICA
Nom de la collection Herbario Nacional de México, Plantas Vasculares;MEXU;Instituto de Biología, Universidad Nacional Autónoma de México;IBUNAM
Identifiant de collection SNIB-GE021-GE021_Enlaces-ND
Identifiant de la collection parente NO APLICA
Nom de la collection Herbarium;OS;Museum of Biological Diversity, The Ohio State University;MBD-OSU
Identifiant de collection SNIB-GE021-GE021_Enlaces-ND
Identifiant de la collection parente NO APLICA
Unités de conservation Entre (nombre minimal) 1 et (nombre maximal) 205 Ejemplar

Métadonnées additionnelles

Identifiants alternatifs d54974b5-c680-44fa-b82a-9f84148d46b5
https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-GE021