Descripción
Registros
Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 1.486 registros.
Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.
Versiones
La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.
Derechos
Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:
El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).
Registro GBIF
Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: bc9f6237-f373-493a-a783-11b0c5eca844. Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Biodiversity Information System of Mexico.
Palabras clave
Occurrence; Bacterias; Occurrence
Datos externos
Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos
| SNIB-HA013-CSV.zip | http://www.snib.mx/proyectos/HA013/SNIB-HA013-CSV.zip UTF-8 CSV |
|---|---|
| SNIB-HA013-BD.zip | http://www.snib.mx/proyectos/HA013/SNIB-HA013-BD.zip UTF-8 MDB MicrosoftAccess2007 |
Contactos
- Originador
- Responsable
- Tel 01(669) 989 8700 xt 245 o 221
- Proveedor De Los Metadatos
- Dirección General de Sistemas
- Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
- 50045000
- Punto De Contacto
- Directora General de Sistemas
- Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
- 50045000
Cobertura geográfica
País: País: ALEMANIA País: ARGENTINA (BUENOS AIRES) País: AUSTRALIA (NO DISPONIBLE, QUEENSLAND, TASMANIA, VICTORIA) País: BANGLADESH (DHAKA BIBHAG) País: BELGICA (FLEMISH) País: BRASIL (NO DISPONIBLE, SANTA CATARINA, SAO PAULO) País: CANADA País: CHILE País: CHINA (, SHANDONG, TAIWAN, ZHEJIANG) País: COLOMBIA País: COREA DEL SUR (, CHUNG-NAM, GYEONGGI, JEJUDO) País: DINAMARCA País: ECUADOR (GUAYAS) País: EGIPTO (SOUTH SINAI) País: ENGLAND País: ESPAÑA (, ANDALUCIA, CANARIAS, CATALUÑA, GALICIA, ILLES BALEARS, NAVARRA, VALENCIA, VALENCIANA) País: ESTADOS UNIDOS DE AMERICA (, CALIFORNIA, CONNECTICUT, FLORIDA, GEORGIA, HAWAII, MARYLAND, MASSACHUSETTS, NEW YORK, NORTH CAROLINA, OHIO, OREGON, SOUTH CAROLINA, TEXAS, VIRGINIA, WASHINGTON) País: FRANCIA (, AQUITAINE, BASSE-NORMANDIE, BRETAGNE, CORSICA, LIMOUSIN, LORRAINE, POITOU-CHARENTES) País: GRECIA País: GUATEMALA (RETALHULEU) País: GUERNSEY (VALE) País: HOLANDA (ZUID-HOLLAND) País: INDIA (TAMIL NADU) País: INDONESIA País: IRAN (FARS) País: ISRAEL (, MERIDIONAL) País: ITALIA (CAMPANIA) País: JAPON (, HOKKAIDO, IWATE, KAGOSHIMA, KANAGAWA, KOCHI, NAGASAKI, SIZUOKA, TOKYO) País: MEXICO (, BAJA CALIFORNIA, BAJA CALIFORNIA SUR, COLIMA, HIDALGO, NAYARIT, SINALOA, SONORA, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE) País: NEW CALEDONIA País: NORUEGA (, HORDALAND) País: NUEVA ZELANDA (WELLINGTON) País: PAPUA NUEVA GUINEA País: PHILIPINES País: PORTUGAL País: REINO UNIDO (GREATER LONDON, WALES) País: SCOTLAND (HIGHLAND) País: TAILANDIA (, BANGKOK) País: TANZANIA (ZANZIBAR) País: WALES
| Coordenadas límite | Latitud Mínima Longitud Mínima [14,279, -117,255], Latitud Máxima Longitud Máxima [32,867, -91,892] |
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Cobertura taxonómica
Reino: Bacteria Filo: Proteobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes, Tenericutes, Actinobacteria Clase: Gammaproteobacteria, Bacilli, Alphaproteobacteria, Flavobacteriia Orden: Vibrionales, Bacillales, Alteromonadales, Lactobacillales, Pseudomonadales, Enterobacteriales, Aeromonadales, Rhizobiales, Oceanospirillales, Flavobacteriales, Caulobacterales, Entomoplasmatales, Rhodobacterales, Actinomycetales Familia: Vibrionaceae, Bacillaceae, Alteromonadaceae, Staphylococcaceae, Shewanellaceae, Streptococcaceae, Moraxellaceae, Enterobacteriaceae, Enterococcaceae, Pseudoalteromonadaceae, Pseudomonadaceae, Aeromonadaceae, Brucellaceae, Oceanospirillaceae, Flavobacteriaceae, Halomonadaceae, Alcanivoracaceae, Caulobacteraceae, Micrococcaceae, Spiroplasmataceae, Rhodobacteraceae, Microbacteriaceae
| Reino | Bacteria |
|---|---|
| Filo | Proteobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes, Tenericutes, Actinobacteria |
| Class | Gammaproteobacteria, Bacilli, Alphaproteobacteria, Flavobacteriia |
| Orden | Vibrionales, Bacillales, Alteromonadales, Lactobacillales, Pseudomonadales, Enterobacteriales, Aeromonadales, Rhizobiales, Oceanospirillales, Flavobacteriales, Caulobacterales, Entomoplasmatales, Rhodobacterales, Actinomycetales |
| Familia | Vibrionaceae, Bacillaceae, Alteromonadaceae, Staphylococcaceae, Shewanellaceae, Streptococcaceae, Moraxellaceae, Enterobacteriaceae, Enterococcaceae, Pseudoalteromonadaceae, Pseudomonadaceae, Aeromonadaceae, Brucellaceae, Oceanospirillaceae, Flavobacteriaceae, Halomonadaceae, Alcanivoracaceae, Caulobacteraceae, Micrococcaceae, Spiroplasmataceae, Rhodobacteraceae, Microbacteriaceae |
| Género | Vibrio, Bacillus, Marinobacter, Photobacterium, Staphylococcus, Oceanobacillus, Shewanella, Streptococcus, Listonella, Psychrobacter, Escherichia, Exiguobacterium, Enterococcus, Alteromonas, Pseudoalteromonas, Pseudomonas, Grimontia, Aeromonas, Pantoea, Agarivorans, Ochrobactrum, Marinomonas, Acinetobacter, Tenacibaculum, Enterobacter, Halomonas, Aliivibrio, Alcanivorax, Brevundimonas, Vagococcus, Micrococcus, Spiroplasma, Yersinia, Enterovibrio, Roseobacter, Salmonella, Edwardsiella, Microbacterium, Salinivibrio |
| Especie | Vibrio fortis, Vibrio alginolyticus, Vibrio harveyi, Bacillus safensis, Vibrio parahaemolyticus, Vibrio ponticus, Vibrio campbellii, Vibrio mediterranei, Vibrio rotiferianus, Staphylococcus saprophyticus, Oceanobacillus sojae, Vibrio chagasii, Streptococcus iniae, Vibrio owensii, Vibrio crassostreae, Photobacterium damselae, Vibrio inusitatus, Listonella pelagia, Vibrio azureus, Vibrio cyclitrophicus, Vibrio coralliilyticus, Vibrio brasiliensis, Psychrobacter maritimus, Shewanella baltica, Vibrio communis, Photobacterium leiognathi, Bacillus tequilensis, Vibrio orientalis, Vibrio natriegens, Bacillus aryabhattai, Psychrobacter marincola, Photobacterium swingsii, Vibrio navarrensis, Vibrio proteolyticus, Vibrio splendidus, Vibrio kanaloae, Vibrio xuii, Escherichia coli, Vibrio ichthyoenteri, Bacillus infantis, Vibrio gigantis, Vibrio tubiashii, Shewanella xiamenensis, Oceanobacillus profundus, Exiguobacterium profundum, Vibrio sinaloensis, Staphylococcus gallinarum, Enterococcus hirae, Staphylococcus xylosus, Staphylococcus sciuri, Exiguobacterium mexicanum, Bacillus thioparans, Shewanella haliotis, Vibrio rumoiensis, Alteromonas macleodii, Pseudoalteromonas spongiae, Vibrio alfacsensis, Photobacterium indicum, Vibrio halioticoli, Vibrio cholerae, Pseudomonas beteli, Vibrio artabrorum, Vibrio vulnificus, Grimontia hollisae, Pseudomonas otitidis, Vibrio hepatarius, Vibrio neptunius, Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Aeromonas hydrophila, Pantoea dispersa, Vibrio mimicus, Agarivorans albus, Ochrobactrum lupini, Vibrio nereis, Marinomonas communis, Vibrio fluvialis, Vibrio ordalii, Pseudomonas taiwanensis, Staphylococcus arlettae, Listonella anguillarum, Acinetobacter baumannii, Photobacterium lutimaris, Aeromonas punctata, Pseudoalteromonas piscicida, Pseudoalteromonas prydzensis, Tenacibaculum mesophilum, Enterobacter cloacae, Halomonas alimentaria, Bacillus circulans, Vibrio cincinnatiensis, Shewanella loihica, Aliivibrio fischeri, Alcanivorax dieselolei, Bacillus cereus, Photobacterium gaetbulicola, Photobacterium jeanii, Acinetobacter schindleri, Brevundimonas terrae, Enterococcus gallinarum, Vagococcus lutrae, Micrococcus yunnanesis, Vibrio diabolicus, Aliivibrio logei, Spiroplasma penaei, Enterobacter hormaechei, Yersinia enterocolitica, Vibrio aestuarianus, Enterovibrio nigricans, Vibrio gazogenes, Vibrio pomeroyi, Vibrio rarus, Enterovibrio norvegicus, Edwardsiella tarda, Aeromonas veronii, Aeromonas jandaei, Pseudomonas anguilliseptica, Microbacterium paraoxydans, Pseudomonas mosselii, Photobacterium angustum |
| Infraspecificname | Photobacterium damselae subsp. damselae, Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila, Salmonella enterica subsp. enterica, Salinivibrio costicola subsp. vallismortis |
Cobertura temporal
| Fecha Inicial / Fecha Final | 1964-09-08 / 2011-02-17 |
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Datos del proyecto
La colección CAIM ya gozó de un proyecto de computarización por parte de la CONABIO (CC007). Durante este proyecto se computarizó la Colección, pero varias de las cepas (261) quedaron incompletas en su identificación. De las 1813 cepas (registros) faltan por identificar 210 (11.6 %) y otros 51 sólo están a nivel de género; además se han adquirido varios nuevos ejemplares. Para poder llevar a cabo la actualización de la base de datos (BIOTICA), uno de los objetivos que no se pudo satisfacer plenamente en la propuesta anterior, es necesario identificar esas cepas. Para cumplir con este objetivo, en la presenta propuesta se realizarán secuenciaciones de genes útiles ("housekeeping") para poder llegar a una identificación correcta de las cepas bacterianas faltantes. Debido a que éstos genes ya se encuentran secuenciados y disponibles en bases de datos públicas (GenBank), los resultados que se ajusten con una similitud muy elevada (superior al 97-98% para el caso del 16S rARN, por ejemplo), será el criterio para identificar la cepa como perteneciente a esa especie. En caso de que el índice de similitud sea menor, se catalogará como potencial nueva especie y sujeta a posterior análisis. Con estos datos, se actualizará la base de datos para reflejar estas nuevas determinaciones y adicionar las bacterias que se han adquirido recientemente.
| Título | Actualización de la Colección de Microorganismos de importancia acuática |
|---|---|
| Identificador | SNIB-HA013-HA0131301F_corregida-ND |
| Fuentes de Financiación | Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO) |
| Descripción del área de estudio | Bacterias no patógenas no patógenas y patógenas patógenas |
Personas asociadas al proyecto:
- Content Provider
Datos de la colección
| Nombre de la Colección | Colección de Microorganismos de Importancia Acuática;CAIM;Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo A. C.;CIAD |
|---|---|
| Identificador de la Colección | SNIB-HA013-HA0131301F_corregida-ND |
| Identificador de la Colección Parental | NO APLICA |
| Unidades curatoriales | Entre 1 y 1.311 Ejemplar |
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Metadatos adicionales
| Identificadores alternativos | bc9f6237-f373-493a-a783-11b0c5eca844 |
|---|---|
| https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-HA013 |