Estudio de la microflora de los suelos de la zona de preservación ecológica 'La Uva' (Sinaloa) con vegetación de selva baja caducifolia empleando taxonomía molecular

Событие
Последняя версия опубликовано Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad мая 8, 2026 Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
Дата публикации:
8 мая 2026 г.
Лицензия:
CC-BY 4.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 2 226 Записи в Spanish (273 KB) - Частота обновления: не планируется
Метаданные в формате EML Скачать в Spanish (138 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в Spanish (36 KB)

Описание

La diversidad microbiana es un recurso poco estudiado en México. En zonas como Sinaloa en donde la agricultura es un importante motor socioeconómico, la mayor parte de la superficie es empleada para cultivos agrícolas. Este es el caso del municipio de Guasave, en donde la zona de preservación ecológica de centro de población La Uva constituye el único relicto de vegetación original preservada. Es de vital importancia iniciar esfuerzos a nivel local y nacional para conocer y conservar la diversidad microbiana presente en los suelos de esta región y del país en general. Una de las dificultades en el estudio de la diversidad microbiana es que se calcula que sólo se pueden cultivar en el laboratorio del 1 al 5% de la diversidad total de microorganismos. Por lo tanto, la utilización de técnicas moleculares de identificación en las que no se involucre el aislamiento de microorganismos resulta una estrategia que permite describir de manera más real la diversidad de los microorganismos presentes en un ecosistema tan diverso como lo es el suelo. En nuestro grupo iniciamos un primer esfuerzo a partir del 2006 a través de la generación de un banco de germoplasma vivo de microorganismos de suelo asociados a la rizosfera de plantas de tomate en un campo agrícola de la región, el cual consiste de cerca de 750 aislados de microorganismos preservados en ultracongelación a -70°C. Del mismo modo se generó información de la diversidad microbiana total a través del aislamiento de ADN genómico de suelo, y la posterior generación y secuenciación de bibliotecas de ADNr. Mediante esta estrategia se identificaron 500 fragmentos de ADN de origen procariote y 500 de origen eucariote. En el presente proyecto primeramente se propone concluir la identificación de los microorganismos existentes en el banco de tomate para posteriormente utilizar la misma estrategia de generación de un banco de microorganismos vivos y un banco de DNA de suelo a partir de muestras de rizosfera de Datura stramonium, la cual es una planta solanácea silvestre común en la zona de reserva. Posteriormente esta información será utilizada para realizar estudios comparativos entre tipo de organismos presentes en la rizosfera de solanáceas en zonas de cultivo, tal como el tomate, y solanáceas en zonas preservadas. El objetivo del trabajo en la zona de reserva incluirá el análisis de la diversidad de microorganismos asociados a la rizosfera de D. stramonium a través de la secuenciación masiva de 1,000 fragmentos de ADN ribosomal de una biblioteca generada a partir de ADN genómico de suelo y la generación de un banco de germoplasma vivo de 750 especimenes criopreservados a -70°C. Finalmente se propone elaborar una base de datos compatible con el sistema Biótica con los datos recabados para cada espécimen del banco, el cual incluirá los datos de colecta, georeferencias, características físicas y químicas de los suelos, fotografías que muestren la morfología colonial y microscópica de cada aislado, los datos del procedimiento de identificación molecular y análisis de secuencias. Además se pondrán a disposición los datos de las listas de las especies identificadas en los dos bancos de germoplasma vivos y en los bancos generados a partir de los datos de secuenciación masiva de ADN ribosomal tanto de los suelos de la zona de cultivo como los de la zona de reserva.Reino: 5 Filo: 21 Clase: 33 Orden: 59 Familia: 95 Género: 144 Especie: 183 Epitetoinfraespecifico: 1

Записи данных

Данные этого находка ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 2 226 записей.

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: bbedc129-ddc2-4651-b64d-f9d7666e4b74.  Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Biodiversity Information System of Mexico.

Ключевые слова

Occurrence; Bacterias; Hongos; Invertebrados; Plantas; Cromistas; Occurrence

Внешние данные

Ресурс также доступен в других форматах

SNIB-IE001-CSV.zip http://www.snib.mx/proyectos/IE001/SNIB-IE001-CSV.zip UTF-8 CSV
SNIB-IE001-BD.zip http://www.snib.mx/proyectos/IE001/SNIB-IE001-BD.zip UTF-8 MDB MicrosoftAccess2007

Контакты

Ignacio Eduardo Maldonado Mendoza
  • Originator
  • Responsable
Instituto Politécnico NacionalCentro Interdisciplinario de Investigación para el Desarrollo Integral Regional-Sinaloa
81101 Guasave
Sinaloa
MX
  • (687) 87 29626 y 29625
CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
  • Metadata Provider
  • Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  • Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
14010 MÉXICO
Tlalpan
MX
  • 50045000
Patricia Ramos Rivera
  • Point Of Contact
  • Directora General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  • Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
14010 México
Tlalpan
MX
  • 50045000

Географический охват

País: MEXICO (SINALOA)

Ограничивающие координаты Юг Запад [25,495, -108,503], Север Восток [25,525, -108,453]

Таксономический охват

Reino: Bacteria, Chromista, Fungi, Plantae, Animalia Filo: Firmicutes, Ciliophora, Acidobacteria, Cyanobacteria, Proteobacteria, Chytridiomycota, Ascomycota, Actinobacteria, Chlorophyta, Basidiomycota, Tracheophyta, Nematoda, Incertae sedis, Gemmatimonadetes, Bacteroidetes, Nemata, Zygomycota, Glomeromycota, Mucoromycota, Chloroflexi, Planctomycetes Clase: Bacilli, Spirotrichea, Cyanophyceae, Deltaproteobacteria, Chytridiomycetes, Gammaproteobacteria, Eurotiomycetes, Actinobacteria, Dothideomycetes, Mollicutes, Chlorophyceae, Sordariomycetes, Agaricomycetes, Trebouxiophyceae, Magnoliopsida, Pezizomycetes, Chromadorea, Oligohymenophorea, Incertae sedis, Sphingobacteriia, Alphaproteobacteria, Secernentea, Microbotryomycetes, Flavobacteriia, Betaproteobacteria, Glomeromycetes, Mortierellomycetes, Tremellomycetes, Entomophthoromycetes, Gemmatimonadetes, Cytophagia, Planctomycetacia, Sphingobacteria Orden: Bacillales, Sporadotrichida, Leptolyngbyales, Olpidiales, Vibrionales, Onygenales, Pleosporales, Acholeplasmatales, Oedogoniales, Sphaeropleales, Eurotiales, Hypocreales, Solirubrobacterales, Agaricales, Prasiolales, Solanales, Pezizales, Capnodiales, Rhabditida, Lactobacillales, Actinomycetales, Peniculida, Incertae sedis, Sapindales, Sphingobacteriales, Myxococcales, Caryophyllales, Pseudomonadales, Chroococcales, Mucorales, Leucosporidiales, Sporidiobolales, Xanthomonadales, Sordariales, Flavobacteriales, Rhizobiales, Chlamydomonadales, Oscillatoriales, Poales, Sphingomonadales, Burkholderiales, Caulobacterales, Glomerales, Mortierellales, Nostocales, Tremellales, Rhizophlyctidales, Entomophthorales, Gemmatimonadales, Enterobacteriales, Cytophagales, Geastrales, Rhodospirillales, Pseudanabaenales, Planctomycetales, Thelephorales, Stichotrichida, Cantharellales, Acidobacteriales Familia: Bacillaceae, Halteriidae, Leptolyngbyaceae, Olpidiaceae, Vibrionaceae, Ajellomycetaceae, Pleosporaceae, Paenibacillaceae, Acholeplasmataceae, Oedogoniaceae, Scenedesmaceae, Sporormiaceae, Aspergillaceae, Incertae sedis, Patulibacteraceae, Pleurotaceae, Koliellaceae, Solanaceae, Pyronemataceae, Davidiellaceae, Cortinariaceae, Cephalobidae, Enterococcaceae, Mycobacteriaceae, Parameciidae, Bolbitiaceae, Onygenaceae, Meliaceae, Trichocomaceae, Nectriaceae, Sphingobacteriaceae, Cystobacteraceae, Chenopodiaceae, Micrococcaceae, Pseudomonadaceae, Geminocystaceae, Mucoraceae, Leucosporidiaceae, Myxococcaceae, Xanthomonadaceae, Chaetomiaceae, Micromonosporaceae, Flavobacteriaceae, Rhizobiaceae, Dunaliellaceae, Moraxellaceae, Oxytrichidae, Oscillatoriaceae, Poaceae, Strophariaceae, Sphingomonadaceae, Comamonadaceae, Marasmiaceae, Leptosphaeriaceae, Caulobacteraceae, Microbacteriaceae, Glomeraceae, Lophiostomataceae, Brucellaceae, Mortierellaceae, Carnobacteriaceae, Nostocaceae, Tremellaceae, Solirubrobacteraceae, Rhizophlyctidaceae, Didymellaceae, Psathyrellaceae, Conidiobolaceae, Gemmatimonadaceae, Enterobacteriaceae, Oxalobacteraceae, Burkholderiaceae, Agaricaceae, Cytophagaceae, Pratylenchidae, Streptomycetaceae, Microcoleaceae, Basidiobolaceae, Geastraceae, Acetobacteraceae, Pseudanabaenaceae, Didymosphaeriaceae, Pluteaceae, Stephanosporaceae, Geodermatophilaceae, Sordariaceae, Nocardioidaceae, Thelephoraceae, Testudinaceae, Ceratobasidiaceae, Podosporaceae, Acidobacteriaceae, Propionibacteriaceae, Pezizaceae, Flexibacteraceae

Kingdom Bacteria, Chromista, Fungi, Plantae, Animalia
Phylum Firmicutes, Ciliophora, Acidobacteria, Cyanobacteria, Proteobacteria, Chytridiomycota, Ascomycota (hongos de saco, levaduras), Actinobacteria, Chlorophyta, Basidiomycota (hongos de sombrerito), Tracheophyta, Nematoda, Incertae sedis, Gemmatimonadetes, Bacteroidetes, Nemata, Zygomycota, Glomeromycota, Mucoromycota, Chloroflexi, Planctomycetes
Class Bacilli, Spirotrichea, Cyanophyceae, Deltaproteobacteria, Chytridiomycetes, Gammaproteobacteria, Eurotiomycetes, Actinobacteria, Dothideomycetes, Mollicutes, Chlorophyceae, Sordariomycetes, Agaricomycetes, Trebouxiophyceae, Magnoliopsida, Pezizomycetes, Chromadorea, Oligohymenophorea, Incertae sedis, Sphingobacteriia, Alphaproteobacteria, Secernentea, Microbotryomycetes, Flavobacteriia, Betaproteobacteria, Glomeromycetes, Mortierellomycetes, Tremellomycetes, Entomophthoromycetes, Gemmatimonadetes, Cytophagia, Planctomycetacia, Sphingobacteria
Order Bacillales, Sporadotrichida, Leptolyngbyales, Olpidiales, Vibrionales, Onygenales, Pleosporales, Acholeplasmatales, Oedogoniales, Sphaeropleales, Eurotiales, Hypocreales, Solirubrobacterales, Agaricales, Prasiolales, Solanales, Pezizales, Capnodiales, Rhabditida, Lactobacillales, Actinomycetales, Peniculida, Incertae sedis, Sapindales, Sphingobacteriales, Myxococcales, Caryophyllales, Pseudomonadales, Chroococcales, Mucorales, Leucosporidiales, Sporidiobolales, Xanthomonadales, Sordariales, Flavobacteriales, Rhizobiales, Chlamydomonadales, Oscillatoriales, Poales, Sphingomonadales, Burkholderiales, Caulobacterales, Glomerales, Mortierellales, Nostocales, Tremellales, Rhizophlyctidales, Entomophthorales, Gemmatimonadales, Enterobacteriales, Cytophagales, Geastrales, Rhodospirillales, Pseudanabaenales, Planctomycetales, Thelephorales, Stichotrichida, Cantharellales, Acidobacteriales
Family Bacillaceae, Halteriidae, Leptolyngbyaceae, Olpidiaceae, Vibrionaceae, Ajellomycetaceae, Pleosporaceae, Paenibacillaceae, Acholeplasmataceae, Oedogoniaceae, Scenedesmaceae, Sporormiaceae, Aspergillaceae, Incertae sedis, Patulibacteraceae, Pleurotaceae, Koliellaceae, Solanaceae, Pyronemataceae, Davidiellaceae, Cortinariaceae, Cephalobidae, Enterococcaceae, Mycobacteriaceae, Parameciidae, Bolbitiaceae, Onygenaceae, Meliaceae, Trichocomaceae, Nectriaceae, Sphingobacteriaceae, Cystobacteraceae, Chenopodiaceae, Micrococcaceae, Pseudomonadaceae, Geminocystaceae, Mucoraceae, Leucosporidiaceae, Myxococcaceae, Xanthomonadaceae, Chaetomiaceae, Micromonosporaceae, Flavobacteriaceae, Rhizobiaceae, Dunaliellaceae, Moraxellaceae, Oxytrichidae, Oscillatoriaceae, Poaceae, Strophariaceae, Sphingomonadaceae, Comamonadaceae, Marasmiaceae, Leptosphaeriaceae, Caulobacteraceae, Microbacteriaceae, Glomeraceae, Lophiostomataceae, Brucellaceae, Mortierellaceae, Carnobacteriaceae, Nostocaceae, Tremellaceae, Solirubrobacteraceae, Rhizophlyctidaceae, Didymellaceae, Psathyrellaceae, Conidiobolaceae, Gemmatimonadaceae, Enterobacteriaceae, Oxalobacteraceae, Burkholderiaceae, Agaricaceae, Cytophagaceae, Pratylenchidae, Streptomycetaceae, Microcoleaceae, Basidiobolaceae, Geastraceae, Acetobacteraceae, Pseudanabaenaceae, Didymosphaeriaceae, Pluteaceae, Stephanosporaceae, Geodermatophilaceae, Sordariaceae, Nocardioidaceae, Thelephoraceae, Testudinaceae, Ceratobasidiaceae, Podosporaceae, Acidobacteriaceae, Propionibacteriaceae, Pezizaceae, Flexibacteraceae
Genus Bacillus, Halteria, Leptolyngbya, Olpidium, Vibrio, Emmonsia, Alternaria, Paenibacillus, Candidatus Phytoplasma, Oedogonium, Virgibacillus, Scenedesmus, Berkleasmium, Emericella, Acremonium, Patulibacter, Hohenbuehelia, Pseudochlorella, Lycium, Cheilymenia, Cladosporium, Cortinarius, Zeldia, Enterococcus, Mycobacterium, Paramecium, Aporospora, Conocybe, Paracoccidioides, Brevibacillus, Chrysosporium, Entandrophragma, Eurotium, Fusarium, Stegelleta, Sphingobacterium, Anaeromyxobacter, Lentibacillus, Atriplex, Archangium, Arthrobacter , Pseudomonas, Nectria, Cyanobacterium, Panaeolus, Rhizopus, Leucosporidium, Myxococcus, Rhodotorula, Stenotrophomonas, Humicola, Micromonospora, Flavobacterium, Agrobacterium, Dunaliella, Halobacillus, Acinetobacter, Cyrtohymena, Chaetomium, Oscillatoria, Echinochloa, Gymnopilus, Sphingosinicella, Delftia, Gymnopus, Acrobeloides, Terribacillus, Paecilomyces, Leptosphaeria, Caulobacter, Microbacterium, Cephalosporium, Glomus, Ochrobactrum, Sphingopyxis, Cochliobolus, Mortierella, Carnobacterium, Absidia, Nostoc, Aspergillus, Cryptococcus, Anoxybacillus, Corynascus, Solirubrobacter, Hyalangium, Rhizophlyctis, Oxytricha, Phoma, Geobacillus, Coprinopsis, Heydenia, Conidiobolus, Gemmatimonas, Pantoea, Massilia, Calonectria, Pyrenochaeta, Burkholderia, Enterobacter, Rhodosporidium, Lophiostoma, Tulostoma, Ochroconis, Dyadobacter, Ralstonia, Pratylenchus, Streptomyces, Microcoleus, Basidiobolus, Coprinellus, Geastrum, Granulibacter, Xenobotrytis, Psathyrella, Paraconiothyrium, Chamaeota, Lindtneria, Blastococcus, Sphingomonas, Kribbella, Pseudorobillarda, Pedobacter, Leucoagaricus, Acrobeles, Pontibacter, Kluyvera, Stagonosporopsis, Rhizopycnis, Rummeliibacillus, Lepidosphaeria, Scolecobasidium, Candidatus Entotheonella, Rhizoctonia, Cladorrhinum, Neosartorya, Arthrospira, Heterocephalobellus, Spiromastix, Friedmanniella, Agaricus, Calymmatobacterium, Terfezia, Chlorophyllum
Species Halteria grandinella, Bacillus subtilis, Olpidium brassicae, Vibrio splendidus, Emmonsia parva, Alternaria tenuissima, Oedogonium tenerum, Bacillus megaterium, Bacillus cereus, Emericella dentata, Acremonium strictum, Bacillus pumilus, Patulibacter minatonensis, Bacillus firmus, Hohenbuehelia portegna, Pseudochlorella pyrenoidosa, Lycium ruthenicum, Cheilymenia stercorea, Paenibacillus popilliae, Cladosporium oxysporum, Virgibacillus marismortui, Cortinarius olearioides, Alternaria alternata, Paenibacillus chondroitinus, Enterococcus avium, Mycobacterium gordonae, Paramecium tetraurelia, Bacillus flexus, Aporospora terricola, Paenibacillus polymyxa, Alternaria mali, Conocybe crispa, Alternaria longipes, Paracoccidioides brasiliensis, Paenibacillus fujiensis, Chrysosporium pilosum, Emmonsia crescens, Bacillus licheniformis, Bacillus endophyticus, Entandrophragma cylindricum, Mycobacterium avium, Eurotium chevalieri, Conocybe rickenii, Fusarium oxysporum, Cladosporium cladosporioides, Sphingobacterium spiritivorum, Anaeromyxobacter dehalogenans, Alternaria longissima, Paenibacillus lautus, Bacillus amyloliquefaciens, Lentibacillus salinarum, Atriplex centralasiatica, Bacillus sonorensis, Scenedesmus obliquus, Zeldia punctatus, Archangium gephyra, Bacillus aryabhattai, Pseudomonas fluorescens, Bacillus thuringiensis, Bacillus funiculus, Pseudomonas mendocina, Nectria mauritiicola, Panaeolus cambodginiensis, Rhizopus oryzae, Leucosporidium scottii, Myxococcus xanthus, Alternaria gaisen, Hohenbuehelia tremula, Panaeolus sphinctrinus (a-mo-kiá (Chinanteco), a-ni (Chinanteco), badao-zoo (Zapoteco), borrachito, cabeza de víbora, hongo de los corrales, malhat kjstsasa (Totonaco), mulitas, peazoo (Zapoteco), to-xka (Mazateco)), Paenibacillus alginolyticus, Bacillus psychrosaccharolyticus, Rhodotorula ingeniosa, Bacillus azotoformans, Humicola fuscoatra, Bacillus marisflavi, Micromonospora echinospora, Agrobacterium vitis, Halobacillus kuroshimensis, Cyrtohymena citrina, Mycobacterium interjectum, Echinochloa colona (arrocillo, arroz de monte, arroz del monte, pasto, zacate, zacate de agua, zacate gordura), Gymnopilus junonius, Emericella corrugata, Emericella nidulans, Sphingosinicella microcystinivorans, Delftia tsuruhatensis, Alternaria arborescens, Terribacillus halophilus, Leptosphaeria senegalensis, Caulobacter crescentus, Rhodotorula glutinis, Paenibacillus lentimorbus, Chaetomium globosum, Cephalosporium curtipes, Atriplex lentiformis, Paenibacillus larvae, Ochrobactrum cytisi, Sphingopyxis alaskensis, Bacillus oceanisediminis, Cochliobolus lunatus, Scenedesmus naegelii, Absidia corymbifera, Aspergillus tamarii, Cryptococcus magnus, Corynascus verrucosus, Hyalangium minutum, Chrysosporium lobatum, Rhizophlyctis rosea, Oxytricha longigranulosa, Cortinarius fulvocitrinus, Phoma medicaginis, Coprinopsis cinerea, Aspergillus variecolor, Brevibacillus brevis, Heydenia alpina, Conidiobolus coronatus, Acinetobacter baumannii, Pantoea eucrina, Calonectria hawksworthii, Paenibacillus validus, Burkholderia phenazinium, Paenibacillus illinoisensis, Burkholderia graminis, Lophiostoma cynaroidis, Ochroconis calidifluminalis, Dyadobacter fermentans, Ralstonia solanacearum, Pratylenchus goodeyi, Tulostoma melanocyclum, Emericella variecolor, Microcoleus vaginatus, Basidiobolus meristosporus, Coprinellus bisporus, Acinetobacter calcoaceticus, Geastrum fimbriatum, Geastrum triplex (chawuk (Tseltal), estrella de tierra, hongo estrella, wuswus lu' (Tseltal)), Granulibacter bethesdensis, Bacillus fusiformis, Xenobotrytis acaducospora, Pantoea ananatis, Psathyrella candolleana, Paraconiothyrium hawaiiense, Chamaeota sinica, Terribacillus goriensis, Lindtneria trachyspora, Cladosporium sphaerospermum, Blastococcus jejuensis, Fusarium chlamydosporum, Emericella undulata, Pseudorobillarda sojae, Terribacillus saccharophilus, Leucoagaricus littoralis, Mortierella wolfii, Bacillus sphaericus, Stagonosporopsis cucurbitacearum, Rhizopycnis vagum, Bacillus simplex, Lepidosphaeria nicotiae, Acrobeles complexus, Pseudomonas putida, Paenibacillus harenae, Fusarium lunatum, Geobacillus toebii, Virgibacillus dokdonensis, Cladorrhinum samala, Neosartorya glabra, Arthrospira platensis, Bacillus oleronius, Mycobacterium gilvum, Bacillus niabensis, Nostoc muscorum, Bacillus lentus, Pantoea agglomerans, Myxococcus fulvus, Spiromastix warcupii, Aspergillus dimorphicus, Streptomyces djakartensis, Agaricus xanthodermus (champiñón malo, llanero loco, yax ak (Tseltal)), Acinetobacter junii, Streptomyces aculeolatus, Calymmatobacterium granulomatis, Chlorophyllum molybdites (chejchew (Tseltal), corralito, falso champiñón, hongo malo de jardín, paragüas verdecitos, tlatzcalnanácatl (Náhuatl), yax ak (Tseltal)), Vibrio fluvialis
Infraspecificname Bacillus circulans subtilis

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 2006-03-22 / 2009-12-02

Данные проекта

La diversidad microbiana es un recurso poco estudiado en México. En zonas como Sinaloa en donde la agricultura es un importante motor socioeconómico, la mayor parte de la superficie es empleada para cultivos agrícolas. Este es el caso del municipio de Guasave, en donde la zona de preservación ecológica de centro de población La Uva constituye el único relicto de vegetación original preservada. Es de vital importancia iniciar esfuerzos a nivel local y nacional para conocer y conservar la diversidad microbiana presente en los suelos de esta región y del país en general. Una de las dificultades en el estudio de la diversidad microbiana es que se calcula que sólo se pueden cultivar en el laboratorio del 1 al 5% de la diversidad total de microorganismos. Por lo tanto, la utilización de técnicas moleculares de identificación en las que no se involucre el aislamiento de microorganismos resulta una estrategia que permite describir de manera más real la diversidad de los microorganismos presentes en un ecosistema tan diverso como lo es el suelo. En nuestro grupo iniciamos un primer esfuerzo a partir del 2006 a través de la generación de un banco de germoplasma vivo de microorganismos de suelo asociados a la rizosfera de plantas de tomate en un campo agrícola de la región, el cual consiste de cerca de 750 aislados de microorganismos preservados en ultracongelación a -70°C. Del mismo modo se generó información de la diversidad microbiana total a través del aislamiento de ADN genómico de suelo, y la posterior generación y secuenciación de bibliotecas de ADNr. Mediante esta estrategia se identificaron 500 fragmentos de ADN de origen procariote y 500 de origen eucariote. En el presente proyecto primeramente se propone concluir la identificación de los microorganismos existentes en el banco de tomate para posteriormente utilizar la misma estrategia de generación de un banco de microorganismos vivos y un banco de DNA de suelo a partir de muestras de rizosfera de Datura stramonium, la cual es una planta solanácea silvestre común en la zona de reserva. Posteriormente esta información será utilizada para realizar estudios comparativos entre tipo de organismos presentes en la rizosfera de solanáceas en zonas de cultivo, tal como el tomate, y solanáceas en zonas preservadas. El objetivo del trabajo en la zona de reserva incluirá el análisis de la diversidad de microorganismos asociados a la rizosfera de D. stramonium a través de la secuenciación masiva de 1,000 fragmentos de ADN ribosomal de una biblioteca generada a partir de ADN genómico de suelo y la generación de un banco de germoplasma vivo de 750 especimenes criopreservados a -70°C. Finalmente se propone elaborar una base de datos compatible con el sistema Biótica con los datos recabados para cada espécimen del banco, el cual incluirá los datos de colecta, georeferencias, características físicas y químicas de los suelos, fotografías que muestren la morfología colonial y microscópica de cada aislado, los datos del procedimiento de identificación molecular y análisis de secuencias. Además se pondrán a disposición los datos de las listas de las especies identificadas en los dos bancos de germoplasma vivos y en los bancos generados a partir de los datos de secuenciación masiva de ADN ribosomal tanto de los suelos de la zona de cultivo como los de la zona de reserva.

Название Estudio de la microflora de los suelos de la zona de preservación ecológica 'La Uva' (Sinaloa) con vegetación de selva baja caducifolia empleando taxonomía molecular
Идентификатор SNIB-IE001-IE0011312F_corregida-ND
Финансирование Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
Описание района исследования Bacterias Hongos Invertebrados Plantas Cromistas agallas, royas, tizones algas verdes ciliados con flores como acelgas, amarantos, betabeles, biznagas, bugambilias, claveles, epazotes, espinacas, huauhzontles, jojobas, nopales, quelites, quinoas, saguaros, trigos serracenos, tunas, verdolagas, xoconostles con flores como alpiste, arroz, avena, caña de azúcar, cebada, centeno, heno, juncos, maíz, mijo, pastos terrestres, piña, sorgo, trigo, triticale, tules con flores como berenjenas, camotes, chiles, floripondios, jitomates, papas, petunias, pimientos, tabacos, toloaches, tomates con flores como caobas, copales, limas, limones, naranjas, mandarinas, mangos, maples, nueces de la India, pirúles, pistaches, rudas, toronjas, zapotes blancos de copa falsas setas gusanos redondos, gusanos cilíndricos o helmintos como áscaris, filarias, nemátodos, triquinas levaduras líquenes micorrizas mohos NO DISPONIBLE no patógenas no patógenas y patógenas otros hongos o líquenes quitridios setas

Исполнители проекта:

Ignacio Eduardo Maldonado Mendoza
  • Content Provider

Данные коллекции

Название коллекции Colección de microorganismos asociados a la rizósfera de Datura;CIIDIR-004;Centro Interdisciplinario de Investigación para el Desarrollo Integral Regional, Unidad Sinaloa, Instituto Politécnico Nacional;CIIDIR-IPN
Идентификатор коллекции SNIB-IE001-IE0011312F_corregida-ND
Идентификатор родительской коллекции NO APLICA
Название коллекции Colección de microorganismos asociados a la rizósfera de Tomate;CIIDIR-001;Centro Interdisciplinario de Investigación para el Desarrollo Integral Regional, Unidad Sinaloa, Instituto Politécnico Nacional;CIIDIR-IPN
Идентификатор коллекции SNIB-IE001-IE0011312F_corregida-ND
Идентификатор родительской коллекции NO APLICA
Единицы хранения Между 1 и 48 Ejemplar

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы bbedc129-ddc2-4651-b64d-f9d7666e4b74
https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-IE001