Author: Patricia Ramos Rivera
Keywords: Occurrence, Mamíferos, Occurrence

El código de barras de las especies NOM-059 de mamíferos del Noroeste de México

Patricia Cortés Calva^1, CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad^2

1 Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste SCPrograma de Planeación Ambiental y Conservación, Mar Bermejo # 195, 23090, La Paz, Mexico; 2 Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad, Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal, 14010, MÉXICO, Mexico

Corresponding author(s): Patricia Cortés Calva (pcortes04@cibnor.mx), CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad (patricia.ramos@conabio.gob.mx)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

'Cortés-Calva P. 2015. El código de barras de las especies NOM-059 de mamíferos del Noroeste de México. Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste S. C. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto HB005. México, D. F.'

Abstract

Para el desarrollo de esta propuesta de investigación, se utilizará el material depositado en la colección de tejidos del CIBNOR el que data de más de 10 años de trabajo en campo, además de material que se colectará mediante el apoyo de este proyecto. Se pretende obtener la información de por lo menos 67 taxa incluidos en la NOM-059-SEMARNAT-2001 con distribución  en el noroeste mexicano. Como es sabido, esta región geográfica de México estuvo sometida a procesos geológicos del pasado por lo que alberga especies con importancia biogeográfica tal como son los endemismos de las islas, las especies tipo y de distribución restringida por citar algunos. Por ello, consideramos la obtención de la información genética de las especies de mamíferos del noroeste de México, para derivar los códigos de barras del ADN de los taxa con algún estatus de protección en nuestro país e incorporarlas al sistema BOLD, aportando con ello conocimiento de las especies presentes consideradas en peligro y/o amenazadas en la Norma Oficial Mexicana, creando librerías genéticas de estos taxa de especial interés por estar consideradas dentro de alguna categoría de amenaza. Se procesarán los tejidos que se tienen en la colección de mamíferos del CIBNOR y se complementarán con biopsias de ejemplares de reciente colecta, se seguirá el protocolo de MexBOL para los análisis de extracción, amplificación y secuenciación del ADN, los cuales se efectuarán en el Nodo Norte de la Red MexBOL (Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste). Una vez obtenidos los códigos de barras de las especies  se incorporarán a la base de datos en el sistema BOLD. Debido a la importancia del conocimiento de la genética de estas poblaciones para su conservación, se proyecta la secuenciación de hasta 10 individuos. Se elaborarán los informes de avance con los indicadores de éxito solicitado, entregando un informe final que incluya la integración de información así como, la hoja de cálculo que circunscriba los datos de los taxa en estudio.
Palabras clave: DNA, mamíferos, NOM-059, México, código de barras, noroeste
Reino: 1
Filo: 1
Clase: 1
Orden: 6
Familia: 9
Género: 14
Especie: 21
Epitetoinfraespecifico: 33

Keywords: Occurrence, Mamíferos, Occurrence

Project details

Project title: El código de barras de las especies NOM-059 de mamíferos del Noroeste de México
Personnel: Patricia Cortés Calva
Funding: Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
Study area descriptions/descriptor: Mamíferos
ardillas, marmotas, perritos de la pradera
berrendos, bisontes, borregos, cabras, camellos, ciervos, jabalies, pecaries, toros, vacas, venados
castores, ratones de abazones, ratones canguro, tuzas
comadrejas, hurones, mangostas, nutrias, tejones
conejos, liebres
hámsters, lemmis, ratas, ratones de campo, ratones urbanos
murciélagos
musarañas, topos
ratas, ratones

Data published through GBIF: https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-HB005

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: Reino: Animalia
Filo: Chordata
Clase: Mammalia
Orden: Rodentia, Lagomorpha, Artiodactyla, Carnivora, Chiroptera, Soricomorpha
Familia: Heteromyidae, Cricetidae, Leporidae, Sciuridae, Antilocapridae, Mustelidae, Phyllostomidae, Soricidae, Vespertilionidae
Taxonomic ranks
Kingdom: Animalia
Phylum: Chordata
Class: Mammalia
Order: Rodentia, Lagomorpha, Artiodactyla, Carnivora, Chiroptera, Soricomorpha
Family: Heteromyidae, Cricetidae, Leporidae, Sciuridae, Antilocapridae, Mustelidae, Phyllostomidae, Soricidae, Vespertilionidae
Genus: Chaetodipus, Peromyscus, Dipodomys, Neotoma, Sylvilagus, Tamias, Lepus, Ammospermophilus, Antilocapra, Taxidea, Leptonycteris, Notiosorex, Myotis, Tamiasciurus
Species: Peromyscus interparietalis, Dipodomys insularis, Neotoma bryanti, Neotoma phenax, Chaetodipus dalquesti, Tamias merriami, Lepus insularis, Ammospermophilus insularis, Sylvilagus mansuetus, Neotoma varia, Peromyscus stephani, Peromyscus slevini, Antilocapra americana, Dipodomys margaritae, Peromyscus pseudocrinitus, Taxidea taxus, Leptonycteris yerbabuenae, Notiosorex crawfordi, Dipodomys phillipsii, Myotis vivesi, Tamiasciurus mearnsi
Infraspecificname: Chaetodipus baileyi subsp. insularis, Peromyscus eremicus subsp. collatus, Chaetodipus spinatus subsp. bryanti, Peromyscus eremicus subsp. cinereus, Chaetodipus arenarius subsp. ammophilus, Dipodomys merriami subsp. mitchelli, Neotoma lepida subsp. marcosensis, Chaetodipus spinatus subsp. margaritae, Sylvilagus bachmani subsp. cerrosensis, Peromyscus eremicus subsp. tiburonensis, Chaetodipus fallax subsp. anthonyi, Chaetodipus spinatus subsp. marcosensis, Peromyscus crinitus subsp. pallidissimus, Lepus californicus subsp. magdalenae, Peromyscus boylii subsp. glasselli, Neotoma lepida subsp. perpallida, Peromyscus eremicus subsp. cedrosensis, Chaetodipus penicillatus subsp. seri, Chaetodipus arenarius subsp. siccus, Peromyscus eremicus subsp. avius, Chaetodipus arenarius subsp. albulus, Lepus californicus subsp. sheldoni, Peromyscus maniculatus subsp. exiguus, Peromyscus maniculatus subsp. geronimensis, Neotoma albigula subsp. seri, Chaetodipus spinatus subsp. lorenzi, Peromyscus maniculatus subsp. dorsalis, Peromyscus eremicus subsp. insulicola, Chaetodipus spinatus subsp. pullus, Neotoma lepida subsp. vicina, Chaetodipus intermedius subsp. minimus, Peromyscus eremicus subsp. polypolius, Peromyscus maniculatus subsp. margaritae
Common names: ratón de Isla San Lorenzo, rata canguro, rata canguro de la isla San José, rata de campo de Baja California, rata de campo de Cedros, rata magueyera, rata cambalachera sonorense, rata de campo, rata de campo de Sonora, ratón de abazones del Cabo, chimoco, liebre negra, ardilla, ardilla antílope, ardilla terrestre, juancito, conejo de isla San José, rata cambalachera de Turner, ratón de Isla San Esteban, ratón de la Isla Catalina, berrendo, rata canguro de Santa Margarita, ratón de Cedros, ratón de Isla Coronados, tejón, tlalcoyote, murciélago, murciélago hocicudo menor, murciélago magueyero menor, musaraña, musaraña del desierto común, musaraña desértica norteña, rata canguro, rata canguro coliblanca del sur, rata canguro de Phillip, miotis pescador, murciélago, murciélago ratón pescador, ardilla arborícola, ardilla de San Pedro Mártir, ardilla roja, ratón de abazones sonorense, ratón de Turner, ratón de abazones de Baja California, ratón de cactus, ratón de bolsas del Sur de Baja California, rata canguro de Merriam, rata cambalachera desértica, ratón de abazones de Baja California, conejo matorralero, ratón de cactus, ratón de abazones, ratón de abazones de Cedros, ratón de abazones de Espíritu Santo, ratón de cañada, liebre cola negra, ratón arbustero, rata de campo de Baja California, rata de campo de Cedros, rata magueyera, ratón de cactus, ratón de abazones desértico, ratón de abazones arenero, ratón de bolsas de Isla Cerralvo, ratón de cactus, ratón de isla Cerralvo, ratón de abazones arenero, liebre cola negra, ratón norteamericano, ratón norteamericano, rata cambalachera garganta blanca, ratón de abazones de Baja California, ratón norteamericano, ratón de cactus, ratón de abazones de Baja California, rata de campo de Baja California, rata de campo de Cedros, rata magueyera, ratón de abazones de roca, ratón de cactus, ratón norteamericano

Spatial coverage

General spatial coverage: País: MEXICO (BAJA CALIFORNIA, BAJA CALIFORNIA SUR, PUEBLA, SINALOA, SONORA)
Coordinates: 18°19'44.4''N and 32°2'45.6''N Latitude; 116°6'28.8''W and 97°30'10.8''W Longitude 

Temporal coverage: October 21, 1995 - April 8, 2013

Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: Colección de Mamíferos;CIB;Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C.;CIBNOR
Collection identifier: SNIB-HB005-HB0051509F-ND

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive El código de barras de las especies NOM-059 de mamíferos del Noroeste de México
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: https://www.snib.mx/iptconabio/archive.do?r=SNIB-HB005
Publication date of data: 2024-04-11
Language: Spanish
Licences of use: Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License

External datasets

Dataset description
Object name: SNIB-HB005-CSV.zip
Character encoding: UTF-8
Format name: CSV
Distribution: http://www.snib.mx/proyectos/HB005/SNIB-HB005-CSV.zip

Dataset description
Object name: SNIB-HB005-BD.zip
Character encoding: UTF-8
Format name: MDB
Format version: MicrosoftAccess2007
Distribution: http://www.snib.mx/proyectos/HB005/SNIB-HB005-BD.zip

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2024-04-05
Hierarchy level: Dataset