Author: Patricia Ramos Rivera
Keywords: Occurrence, Bacterias, Occurrence

Elaboración de la base de datos de la colección de cepas de bacterias fitopatógenas de la Dirección General de Sanidad Vegetal

Bárbara Hernández Macías^1, CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad^2

1 Secretaría de Agricultura, Ganadería, Desarrollo Rural, Pesca y AlimentaciónServicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad AgroalimentariaDirección General de Sanidad Vegetal, Guillermo Pérez Valenzuela # 127, 04100, de México, Mexico; 2 Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad, Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal, 14010, MÉXICO, Mexico

Corresponding author(s): Bárbara Hernández Macías (barbara.hernandez@senasica.gob.mx), CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad (patricia.ramos@conabio.gob.mx)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

'Hernández-Macías B. 2017. Elaboración de la base de datos de la colección de cepas de bacterias fitopatógenas de la Dirección General de Sanidad Vegetal. Colección CNRF-B. Servicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad Agroalimentaria (SENASICA). Secretaría de Agricultura, Ganadería, Desarrollo Rural, Pesca y Alimentación (SAGARPA). Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto JC004. Ciudad de México'

Abstract

El Centro Nacional de Referencia Fitosanitaria, del Servicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad Agroalimentaria (SENASICA), tiene la misión de preservar la sanidad vegetal de nuestro país. Para el área de diagnóstico, el centro cuenta con laboratorios especializados, entre los cuales se encuentra el laboratorio de Bacteriología
La Colección Bacteriológica de la Dirección General de Sanidad Vegetal (CNRF-B-DGSV), se encuentra en estado inicial, por su importancia biológica y económica, las cepas que se tienen se han aislado de material vegetal de importación, así como recientemente de material nacional, son de importancia para la agricultura, por ser consideradas como plagas.
Por su distribución y presencia en el territorio se les conoce como plagas de importancia económica, cuando no están presente en país se les nombra como plaga cuarentenada, siendo esta última la de mayor relevancia por el costo económico y como contaminante biológico. El aumento del intercambio de productos con otros países y la actividad turística, favorecen la posible entrada de plagas cuarentenadas, por consiguiente, es importante tener información relacionada con la biología, distribución, hospedantes, además de tener ejemplares debidamente identificados que sirvan como material de referencia o como consulta para los investigadores.
La CNRF-B-DGSV cuenta con 25 cepas, de diverso origen.
La forma de preservación de la colección es a través del uso de agua destilada estéril a temperatura ambiente, agua destilada estéril a 4°C y en medio de cultivo con aceite mineral.
Con la intención de contribuir al conocimiento cada vez más preciso de las bacterias que afectan a los vegetales, sus productos y subproductos, la Dirección General de Sanidad Vegetal-SAGARPA, ha fijado las bases para establecer un Sistema de Diagnóstico Fitosanitario, cuyas acciones básicas es la caracterización de bacterias fitopatógenas y de aquí la importancia de una Colección de Cepas Bacterianas organizada para permitir un eficiente sistema de consulta.
De ahí la importancia de crear una base de datos adecuada para facilitar la ubicación exacta de cada ejemplar y la información básica y esencial para corroboraciones posteriores de bacterias fitopatógenas.
Para el desarrollo de la base de datos de la Colección Bacteriológica de la DGSV, por el número de ejemplares que la integran, el proyecto se desarrollara en cuatro etapas,
Acervo de la Colección
La colección cuenta hasta el momento con un total de 25 cepas bacterianas. La colección está enfocada principalmente a bacterias de importancia cuarentenaria y económica de origen nacional e internacional
La Colección está compuesta por los siguientes géneros de importancias agrícola:
Clavibacter
Curtobacterium
Dickeya
Pantoea
Pseudomonas
Ralstonia
Stenotrophomonas
Xanthomonas
Reino: 1
Filo: 3
Clase: 3
Orden: 7
Familia: 8
Género: 19
Especie: 41
Epitetoinfraespecifico: 6

Keywords: Occurrence, Bacterias, Occurrence

Project details

Project title: Elaboración de la base de datos de la colección de cepas de bacterias fitopatógenas de la Dirección General de Sanidad Vegetal
Personnel: Bárbara Hernández Macías
Funding: Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
Study area descriptions/descriptor: Bacterias
NO DISPONIBLE
no patógenas
no patógenas y patógenas
patógenas
proteobacterias beta
pseudomonadales

Data published through GBIF: https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-JC004

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: Reino: Prokaryotae
Filo: Proteobacteria, Actinobacteria, Tenericutes
Clase: Gammaproteobacteria, Betaproteobacteria, Alphaproteobacteria
Orden: Xanthomonadales, Actinomycetales, Pseudomonadales, Enterobacteriales, Burkholderiales, Rhizobiales, Entomoplasmatales
Familia: Xanthomonadaceae, Microbacteriaceae, Pseudomonadaceae, Enterobacteriaceae, Burkholderiaceae, Comamonadaceae, Rhizobiaceae, Spiroplasmataceae
Taxonomic ranks
Kingdom: Prokaryotae
Phylum: Proteobacteria, Actinobacteria, Tenericutes
Class: Gammaproteobacteria, Betaproteobacteria, Alphaproteobacteria
Order: Xanthomonadales, Actinomycetales, Pseudomonadales, Enterobacteriales, Burkholderiales, Rhizobiales, Entomoplasmatales
Family: Xanthomonadaceae, Microbacteriaceae, Pseudomonadaceae, Enterobacteriaceae, Burkholderiaceae, Comamonadaceae, Rhizobiaceae, Spiroplasmataceae
Genus: Xanthomonas, Clavibacter, Pseudomonas, Pantoea, Burkholderia, Acidovorax, Rhizobium, Erwinia, Ralstonia, Curtobacterium, Tatumella, Dickeya, Serratia, Spiroplasma, Brenneria, Xylella, Gibbsiella, Pectobacterium, Stenotrophomonas
Species: Xanthomonas fragariae, Pseudomonas marginalis, Pseudomonas aeruginosa, Xanthomonas axonopodis, Pantoea agglomerans, Pseudomonas fluorescens, Burkholderia cepacia, Acidovorax citrulli, Rhizobium radiobacter, Xanthomonas campestris, Pseudomonas viridiflava, Erwinia amylovora, Pantoea ananatis, Ralstonia solanacearum, Curtobacterium flaccumfaciens, Curtobacterium luteum, Pseudomonas argentinensis, Tatumella citrea, Dickeya chrysanthemi, Rhizobium rhizogenes, Xanthomonas albilineans, Xanthomonas arboricola, Pantoea anthophila, Xanthomonas translucens, Serratia marcescens, Spiroplasma citri, Pseudomonas syringae, Xanthomonas sacchari, Pseudomonas cichorii, Xanthomonas euvesicatoria, Pseudomonas taiwanensis, Xanthomonas melonis, Pseudomonas entomophila, Brenneria rubrifaciens, Pseudomonas rizosphaerae, Pantoea dispersa, Pectobacterium carotovorum, Stenotrophomonas maltophilia, Pseudomonas lundensis, Pseudomonas putida, Spiroplasma kunkelii
Infraspecificname: Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis, Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis, Pantoea stewartii subsp. stewartii, Pantoea stewartii subsp. indologenes, Xylella fastidiosa subsp. multiplex, Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa

Spatial coverage

General spatial coverage: País: COLOMBIA
País: COSTA RICA
País: ESTADOS UNIDOS DE AMERICA (CALIFORNIA, FLORIDA, GEORGIA, NEBRASKA, OREGON, WASHINGTON)
País: MEXICO (BAJA CALIFORNIA, CAMPECHE, CHIAPAS, CHIHUAHUA, CIUDAD DE MEXICO, COLIMA, DISTRITO FEDERAL, DURANGO, GUANAJUATO, GUERRERO, HIDALGO, JALISCO, MEXICO, MICHOACAN DE OCAMPO, MORELOS, NAYARIT, NUEVO LEON, OAXACA, PUEBLA, QUINTANA ROO, SAN LUIS POTOSI, SINALOA, SONORA, TABASCO, TLAXCALA, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE, YUCATAN, ZACATECAS)
Coordinates: 15°21'28.8''N and 27°19'4.8''N Latitude; 109°54'36''W and 87°2'45.6''W Longitude 

Temporal coverage: January 1, 1996 - July 27, 2016

Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: Colección de Cepas de Bacterias Fitopatógenas;CNRF-B;Centro Nacional de Referencia Fitosanitaria, Dirección General de Sanidad Vegetal, Servicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad Agroalimentaria;CNRF-DGSV-SENASICA
Collection identifier: SNIB-JC004-JC0041707F_SIB_2017.08.10-ND
Specimen preservation method: Freeze-dried
Specimen preservation method: Other
Specimen preservation method: Glycerin
Curatorial unit: Between 1 and 15 (Ejemplar)

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive Elaboración de la base de datos de la colección de cepas de bacterias fitopatógenas de la Dirección General de Sanidad Vegetal
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Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: https://www.snib.mx/iptconabio/archive.do?r=SNIB-JC004
Publication date of data: 2024-04-11
Language: Spanish
Licences of use: Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License

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Dataset description
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Dataset description
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Format name: MDB
Format version: MicrosoftAccess2007
Distribution: http://www.snib.mx/proyectos/JC004/SNIB-JC004-BD.zip

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2024-04-05
Hierarchy level: Dataset

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