Geographic distribution of lizards (genus Plestiodon) and hummingbirds endemics of México (Distribución geográfica de lagartijas (género Plestiodon) y colibríes endémicos de México)

Teresa Patricia Feria Arroyo1, CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad2

1 The University of Texas
Pan American, 1201 W University Drive Col. ND, 78539, Edinburg, Mexico; 2 Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad, Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal, 14010, MÉXICO, Mexico

Corresponding author(s): Teresa Patricia Feria Arroyo (tpferia@utpa.edu), CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad (patricia.ramos@conabio.gob.mx)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

'Feria-A. P. y M. Oyervides. 2016. Geographic distribution of lizards (genus Plestiodon) and hummingbirds endemics of México" (Distribución geográfica de lagartijas (género Plestiodon) y colibríes endémicos de México). Universidad de Texas-Pan American. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto JM007. Ciudad de México'

Abstract

The great biological richness and the high number of endemism of Mexico are being threatened, because of the excessive transformation of habitat that occurs in different regions of the country, in addition to other factors. Thus, it is urgent to document the distribution of Mexican species, particularly those that are endemic, in a category of risk, or that lack of detailed geographic information. The objective of this study is to contribute to the biogeographical knowledge of some endemic species of lizards and hummingbirds in Mexico. For this, a database with detailed information about the geographical distribution of 12 endemic lizard species of the Plestiodon genera, and 24 endemic species of hummingbirds, will be compiled by the exhaustive review of literature, personal databases of the participants of this project, and online databases (e.g., REMIB). Maps of potential distribution of the study species will be obtained with MaxEnt and 19 climatic variables. These maps will be evaluated quantitatively and qualitatively. During the quantitative evaluation, the presence data will be divided into the training data (70%), and test data (30%), and will be assessed by the AUC (Area Under the Curve), in the ROC statistic; this process will be conducted in MaxEnt. In the qualitative evaluation, group experts will be evaluating the maps according to their experience. After this, the maps with the best quantitative and qualitative evaluations will be edited to obtain more realistic maps of distribution of the study species. The editing of maps will be performed using maps of the biographic provinces, hydrological sub-basins, and land cover/use from INEGI. The results will be sent to CONABIO as in this call for grants, and will be presented in different national and international congresses, as well as published in per-review journals.
La gran riqueza biológica y el número tan alto de endemismos en México se ven amenazados, entre otros factores, por la desmedida transformación del hábitat que ocurre en algunas regiones del país. Por lo tanto resulta urgente documentar la distribución de sus especies, particularmente de aquellas que son endémicas, se encuentran en alguna categoría de riesgo, o bien se cuenta con pocos datos sobre su distribución. El objetivo de este estudio es contribuir con el conocimiento biogeográfico de algunas especies endémicas de lagartijas y colibríes de México. Para lo cual se compilará una base de datos con información detallada sobre la distribución geográfica de 12 especies endémicas de lagartijas del género Plestiodon y 24 especies de colibríes endémicos mediante la revisión exhaustiva de literatura, bases de datos personales de los participantes de este proyecto y bases de datos en línea (p.e., REMIB). Se obtendrán mapas de distribución potencial para las especies de estudio mediante el uso de MaxEnt y 19 variables climáticas. Los mapas se evaluaran cuantitativa y cualitativamente. En la evaluación cualitativa, se dividirán los datos de presencia en datos de entrenamiento (70%) y datos de prueba (30%) y se evaluaran mediante el AUC (Area Under the Curve) en el estadístico ROC, proceso que se realizara en MaxEnt. En la evaluación cualitativa, los expertos de los grupos evaluaran los mapas de acuerdo a su experiencia. Posteriormente, los mapas que tengan las mejores evaluaciones cuantitativas y cualitativas se editaran para obtener mapas más realísticos de la distribución de las especies de estudio. La edición de mapas se realizará utilizando los mapas de Provincias Biogeográficas, Subcuencas Hidrológicas y Uso de Suelo y Vegetación de INEGI. Los resultados serán enviados a la Conabio conforme a las especificaciones de esta convocatoria y serán presentados en diferentes congresos nacionales e internacionales, así como publicados en revistas arbitradas.
Reino: 1
Filo: 1
Clase: 2
Orden: 2
Familia: 2
Género: 11
Especie: 18
Epitetoinfraespecifico: 2

Keywords: Occurrence, Aves, Reptiles, Occurrence

Project details

Project title: Geographic distribution of lizards (genus Plestiodon) and hummingbirds endemics of México (Distribución geográfica de lagartijas (género Plestiodon) y colibríes endémicos de México)
Personnel: Teresa Patricia Feria Arroyo
Funding: Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
Study area descriptions/descriptor: Aves
Reptiles
camaleones, geckos, iguanas, lagartijas, lagartos
colibríes, vencejos

Data published through GBIF: https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-JM007

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: Reino: Animalia
Filo: Chordata
Clase: Aves, Reptilia
Orden: Apodiformes, Squamata
Familia: Trochilidae, Scincidae
Taxonomic ranks
Kingdom: Animalia
Phylum: Chordata
Class: Aves, Reptilia
Order: Apodiformes, Squamata
Family: Trochilidae, Scincidae
Genus: Atthis, Thalurania, Lampornis, Hylocharis, Cynanthus, Chlorostilbon, Amazilia, Plestiodon, Doricha, Eupherusa, Campylopterus
Species: Atthis heloisa, Thalurania ridgwayi, Hylocharis xantusii, Cynanthus sordidus, Chlorostilbon auriceps, Cynanthus doubledayi, Amazilia yucatanensis, Amazilia wagneri, Chlorostilbon forficatus, Plestiodon dicei, Doricha eliza, Plestiodon brevirostris, Plestiodon sumichrasti, Plestiodon dugesii, Plestiodon parviauriculatus, Eupherusa poliocerca, Eupherusa cyanophrys, Campylopterus excellens
Infraspecificname: Lampornis amethystinus subsp. margaritae, Amazilia rutila subsp. graysoni
Common names: bumblebee hummingbird, zumbador mexicano, mexican woodnymph, ninfa mexicana, Xantus's hummingbird, zafiro bajacaliforniano, zafiro de Xantus, colibrí oscuro, colibrí opaco, colibrí oscuro, Canivet´s emerald, esmeralda mexicana, esmeralda occidental, colibrí vientre canelo, colibrí yucateco, Canivet´s emerald, esmeralda de Cozumel, esmeralda de Isla Cozumel, mexican sheartail, colibrí cola hendida, colibrí tijereta mexicano, ajolote, eslizón chato, salamanquesa, eslizón listado, eslizón listado del sureste, eslizón chato, eslizón de Cuitzeo, ajolote, eslizón pigmeo norteño, lince, lince pigmeo norteño, salamanquesa, colibrí cola blanca, colibrí cola blanca, colibrí guerrerense, colibrí miahuatleco, colibrí oaxaqueño, fandanguero cola larga, fandanguero tuxtleño

Spatial coverage

General spatial coverage: País: MEXICO (BAJA CALIFORNIA SUR, CHIHUAHUA, COLIMA, DISTRITO FEDERAL, DURANGO, GUERRERO, HIDALGO, JALISCO, MEXICO, MICHOACAN DE OCAMPO, MORELOS, NAYARIT, NUEVO LEON, OAXACA, PUEBLA, QUERETARO, QUINTANA ROO, SINALOA, SONORA, TABASCO, TAMAULIPAS, TLAXCALA, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE, YUCATAN, ZACATECAS)
Coordinates: 16°13'17.76''N and 26°59'36.36''N Latitude; 112°4'31''W and 86°56'44.88''W Longitude 

Temporal coverage: November 26, 1859 - November 6, 2011

Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: Bird Collection;LSUMZ;Museum of Natural Science, Louisiana State University;LSU
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: Bird Studies Canada;BSC;The Canadian Migration Monitoring Network;CMMN
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: Birds Collection;MVZ;Museum of Vertebrate Zoology, University of California, Berkeley;MVZ-UCB
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: Birds Collection;CM;Carnegie Museum of Natural History;CMNH
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: Birds Collection;FMNH;Field Museum of Natural History;FMNH
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: Birds Collection;DMNH;Delaware Museum of Natural History;DMNH
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: Colección Nacional de Aves;CNAV;Instituto de Biología, Universidad Nacional Autónoma de México;IBUNAM
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: Collection of Ornithology;YPM;Yale Peabody Museum of Natural History, Yale University;YPMNH-YU
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: Collection of Ornithology;SDNHM;San Diego Natural History Museum;SDNHM
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: National Bird Collection;USNM;National Museum of Natural History, Smithsonian Institution;NMNH-SI
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: NO DISPONIBLE;UNAM;Universidad Nacional Autónoma de México;UNAM
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: NO DISPONIBLE;BSC;NO DISPONIBLE;USNM
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: NO DISPONIBLE
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: Ornithological Collection;ANSP;Academy of Natural Sciences, Philadelphia;ANSP
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: Ornithology Collection;MCZ;Museum of Comparative Zoology, Harvard University;MCZ-HU
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: Ornithology Collection;MLZ;Occidental College;OC
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: Ornithology Collection;CAS-ORN;California Academy of Sciences;CAS
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: Ornithology Collection;AMNH;American Museum of Natural History;AMNH
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Natural collections description

Parent collection identifier: NO APLICA
Collection name: Ornitology Collection;KU;Biodiversity Institute and Natural History Museum, University of Kansas;KU
Collection identifier: SNIB-JM007-JM0071506F_SIB2016.08.18-ND
Curatorial unit: Between 1 and 2 (Ejemplar)

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive Geographic distribution of lizards (genus Plestiodon) and hummingbirds endemics of México (Distribución geográfica de lagartijas (género Plestiodon) y colibríes endémicos de México)
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: https://www.snib.mx/iptconabio/archive.do?r=SNIB-JM007
Publication date of data: 2023-08-16
Language: Spanish
Licences of use: Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License

External datasets

Dataset description
Object name: SNIB-JM007-CSV.zip
Character encoding: UTF-8
Format name: CSV
Distribution: http://www.snib.mx/proyectos/JM007/SNIB-JM007-CSV.zip

Dataset description
Object name: SNIB-JM007-BD.zip
Character encoding: UTF-8
Format name: MDB
Format version: MicrosoftAccess2007
Distribution: http://www.snib.mx/proyectos/JM007/SNIB-JM007-BD.zip

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2023-08-15
Hierarchy level: Dataset