Description
En el presente proyecto se desarrollará una base de datos de secuencias de ADN de referencia, asociadas a la información taxonómica de cada especie de helmintos de anfibios y reptiles en México. Esta base de datos servirá en un futuro cercano como un sistema de identificación rápida de especies que será una vía de comunicación ágil entre los generadores de información taxonómica y los usuarios de ésta (ecólogos, conservacionistas, ecoguardias, etc.). La identificación rápida y oportuna de los helmintos de anfibios y reptiles de México aportará información acerca de las condiciones de las poblaciones de hospederos debido a que los parásitos pueden utilizarse como especies centinelas de alteraciones ambientales. El objetivo general del presente proyecto es caracterizar genéticamente a especies selectas de helmintos de anfibios y reptiles en México, con secuencias del gen Citocromo Oxidasa I (COI) para generar una herramienta de identificación rápida de dichas especies. Se obtendrán las secuencias parciales del gen COI para 73 especies de helmintos anfibios y reptiles de México. En los casos necesarios se obtendrán las secuencias de otras regiones de ADN para lograr la diferenciación de las especies. Las secuencias se analizarán con metodologías de agrupación filogenética como parsimonia o análisis bayesianos. Se generará una base de datos con la información taxonómica y geográfica de los ejemplares, con páginas electrónicas asociadas que contengan la secuencia de COI, la fotografía y otras secuencias si es el caso.
Reino: 1 Filo: 2 Clase: 2 Orden: 5 Familia: 18 Género: 22 Especie: 23
Data Records
The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 372 records.
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Versions
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Rights
Researchers should respect the following rights statement:
The publisher and rights holder of this work is Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.
GBIF Registration
This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: aa6bf18d-4d34-417b-a009-3501002575af. Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by Biodiversity Information System of Mexico.
Keywords
Occurrence; Invertebrados; Occurrence
External data
The resource data is also available in other formats
SNIB-HB026-CSV.zip | http://www.snib.mx/proyectos/HB026/SNIB-HB026-CSV.zip UTF-8 CSV |
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SNIB-HB026-BD.zip | http://www.snib.mx/proyectos/HB026/SNIB-HB026-BD.zip UTF-8 MDB MicrosoftAccess2007 |
Contacts
- Originator
- Responsable
- 01 312 3161000 ext. 49003 01 315 35 10200 56229167
- Metadata Provider
- Dirección General de Sistemas
- Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
- 50045000
- Point Of Contact
- Directora General de Sistemas
- Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
- 50045000
Geographic Coverage
País: COSTA RICA (GUANACASTE) País: ESTADOS UNIDOS DE AMERICA (CALIFORNIA, GEORGIA, WISCONSIN) País: MEXICO (CHIAPAS, COLIMA, GUERRERO, JALISCO, MEXICO, MICHOACAN DE OCAMPO, MORELOS, NAYARIT, NUEVO LEON, OAXACA, SAN LUIS POTOSI, TABASCO, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE, YUCATAN)
Bounding Coordinates | South West [15.788, -105.356], North East [25.933, -90.266] |
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Taxonomic Coverage
Reino: Animalia Filo: Nematoda, Platyhelminthes Clase: Chromadorea, Trematoda Orden: Panagrolaimida, Spirurida, Diplostomida, Rhabditida, Plagiorchiida Familia: Rhabdiasidae, Pharyngodonidae, Cosmocercidae, Clinostomidae, Molineidae, Physalopteridae, Gorgoderidae, Pleurogenidae, Haematoloechidae, Onchocercidae, Plagiorchiidae, Macroderoididae, Diaphanocephalidae, Derogenidae, Glypthelminthidae, Cladorchiidae, Kathlaniidae, Heterakidae
Kingdom | Animalia |
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Phylum | Nematoda, Platyhelminthes |
Class | Chromadorea, Trematoda |
Order | Panagrolaimida, Spirurida, Diplostomida, Rhabditida, Plagiorchiida |
Family | Rhabdiasidae, Pharyngodonidae, Cosmocercidae, Clinostomidae, Molineidae, Physalopteridae, Gorgoderidae, Pleurogenidae, Haematoloechidae, Onchocercidae, Plagiorchiidae, Macroderoididae, Diaphanocephalidae, Derogenidae, Glypthelminthidae, Cladorchiidae, Kathlaniidae, Heterakidae |
Genus | Rhabdias, Aplectana, Clinostomum, Oswaldocruzia, Physaloptera, Gorgoderina, Langeronia, Haematoloechus, Foleyellides, Choledocystus, Rauschiella, Kalicephalus, Halipegus, Parapharyngodon, Glypthelmins, Turgida, Megalodiscus, Cruzia, Parallopharynx, Cosmocerca, Strongyluris, Cosmocercella |
Species | Rhabdias lamothei, Langeronia macrocirra, Haematoloechus coloradenis, Haematoloechus meridionalis, Choledocystus hepaticus, Haematoloechus floedae, Rauschiella tineri, Halipegus occidualis, Haematoloechus macrorchis, Rhabdias kuzmini, Haematoloechus complexus, Parapharyngodon chamelensis, Glypthelmins quieta, Rhabdias fuscovenosa, Halipegus psilonotae, Haematoloechus illimis, Megalodiscus americanus, Cruzia morleyi, Haematoloechus danbrooksi, Parallopharynx arctus, Cosmocerca podicipinus, Oswaldocruzia subauricularis, Cosmocercella diaglenae |
Temporal Coverage
Start Date / End Date | 1997-04-25 / 2010-06-30 |
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Project Data
En el presente proyecto se desarrollará una base de datos de secuencias de ADN de referencia, asociadas a la información taxonómica de cada especie de helmintos de anfibios y reptiles en México. Esta base de datos servirá en un futuro cercano como un sistema de identificación rápida de especies que será una vía de comunicación ágil entre los generadores de información taxonómica y los usuarios de ésta (ecólogos, conservacionistas, ecoguardias, etc.). La identificación rápida y oportuna de los helmintos de anfibios y reptiles de México aportará información acerca de las condiciones de las poblaciones de hospederos debido a que los parásitos pueden utilizarse como especies centinelas de alteraciones ambientales. El objetivo general del presente proyecto es caracterizar genéticamente a especies selectas de helmintos de anfibios y reptiles en México, con secuencias del gen Citocromo Oxidasa I (COI) para generar una herramienta de identificación rápida de dichas especies. Se obtendrán las secuencias parciales del gen COI para 73 especies de helmintos anfibios y reptiles de México. En los casos necesarios se obtendrán las secuencias de otras regiones de ADN para lograr la diferenciación de las especies. Las secuencias se analizarán con metodologías de agrupación filogenética como parsimonia o análisis bayesianos. Se generará una base de datos con la información taxonómica y geográfica de los ejemplares, con páginas electrónicas asociadas que contengan la secuencia de COI, la fotografía y otras secuencias si es el caso.
Title | Códigos de barras de helmintos de anfibios y reptiles de México |
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Identifier | SNIB-HB026-Varios archivos XLS-ND |
Funding | Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO) |
Study Area Description | Invertebrados gusanos planos o helmintos como duelas, monogéneos, planarias, solitarias (tenias) gusanos redondos, gusanos cilíndricos o helmintos como áscaris, filarias, nemátodos, triquinas |
The personnel involved in the project:
- Content Provider
Collection Data
Collection Name | NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE;Research Collection of Virginia Leon;NO DISPONIBLE |
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Collection Identifier | SNIB-HB026-Varios archivos XLS-ND |
Parent Collection Identifier | NO APLICA |
Collection Name | Colección Nacional de Helmintos;CNHE;Instituto de Biología, Universidad Nacional Autónoma de México;IBUNAM |
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Collection Identifier | SNIB-HB026-Varios archivos XLS-ND |
Parent Collection Identifier | NO APLICA |
Curatorial Units | Between 1 and 76 Ejemplar |
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Additional Metadata
Alternative Identifiers | aa6bf18d-4d34-417b-a009-3501002575af |
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https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-HB026 |