Descripción
En el presente proyecto se desarrollará una base de datos de secuencias de ADN de referencia, asociadas a la información taxonómica de cada especie de helmintos de anfibios y reptiles en México. Esta base de datos servirá en un futuro cercano como un sistema de identificación rápida de especies que será una vía de comunicación ágil entre los generadores de información taxonómica y los usuarios de ésta (ecólogos, conservacionistas, ecoguardias, etc.). La identificación rápida y oportuna de los helmintos de anfibios y reptiles de México aportará información acerca de las condiciones de las poblaciones de hospederos debido a que los parásitos pueden utilizarse como especies centinelas de alteraciones ambientales. El objetivo general del presente proyecto es caracterizar genéticamente a especies selectas de helmintos de anfibios y reptiles en México, con secuencias del gen Citocromo Oxidasa I (COI) para generar una herramienta de identificación rápida de dichas especies. Se obtendrán las secuencias parciales del gen COI para 73 especies de helmintos anfibios y reptiles de México. En los casos necesarios se obtendrán las secuencias de otras regiones de ADN para lograr la diferenciación de las especies. Las secuencias se analizarán con metodologías de agrupación filogenética como parsimonia o análisis bayesianos. Se generará una base de datos con la información taxonómica y geográfica de los ejemplares, con páginas electrónicas asociadas que contengan la secuencia de COI, la fotografía y otras secuencias si es el caso.
Reino: 1 Filo: 2 Clase: 2 Orden: 5 Familia: 18 Género: 22 Especie: 23
Registros
Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 372 registros.
Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.
Versiones
La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.
Derechos
Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:
El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).
Registro GBIF
Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: aa6bf18d-4d34-417b-a009-3501002575af. Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Biodiversity Information System of Mexico.
Palabras clave
Occurrence; Invertebrados; Occurrence
Datos externos
Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos
SNIB-HB026-CSV.zip | http://www.snib.mx/proyectos/HB026/SNIB-HB026-CSV.zip UTF-8 CSV |
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SNIB-HB026-BD.zip | http://www.snib.mx/proyectos/HB026/SNIB-HB026-BD.zip UTF-8 MDB MicrosoftAccess2007 |
Contactos
- Originador
- Responsable
- 01 312 3161000 ext. 49003 01 315 35 10200 56229167
- Proveedor De Los Metadatos
- Dirección General de Sistemas
- Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
- 50045000
- Punto De Contacto
- Directora General de Sistemas
- Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
- 50045000
Cobertura geográfica
País: COSTA RICA (GUANACASTE) País: ESTADOS UNIDOS DE AMERICA (CALIFORNIA, GEORGIA, WISCONSIN) País: MEXICO (CHIAPAS, COLIMA, GUERRERO, JALISCO, MEXICO, MICHOACAN DE OCAMPO, MORELOS, NAYARIT, NUEVO LEON, OAXACA, SAN LUIS POTOSI, TABASCO, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE, YUCATAN)
Coordenadas límite | Latitud Mínima Longitud Mínima [15,788, -105,356], Latitud Máxima Longitud Máxima [25,933, -90,266] |
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Cobertura taxonómica
Reino: Animalia Filo: Nematoda, Platyhelminthes Clase: Chromadorea, Trematoda Orden: Panagrolaimida, Spirurida, Diplostomida, Rhabditida, Plagiorchiida Familia: Rhabdiasidae, Pharyngodonidae, Cosmocercidae, Clinostomidae, Molineidae, Physalopteridae, Gorgoderidae, Pleurogenidae, Haematoloechidae, Onchocercidae, Plagiorchiidae, Macroderoididae, Diaphanocephalidae, Derogenidae, Glypthelminthidae, Cladorchiidae, Kathlaniidae, Heterakidae
Reino | Animalia |
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Filo | Nematoda, Platyhelminthes |
Class | Chromadorea, Trematoda |
Orden | Panagrolaimida, Spirurida, Diplostomida, Rhabditida, Plagiorchiida |
Familia | Rhabdiasidae, Pharyngodonidae, Cosmocercidae, Clinostomidae, Molineidae, Physalopteridae, Gorgoderidae, Pleurogenidae, Haematoloechidae, Onchocercidae, Plagiorchiidae, Macroderoididae, Diaphanocephalidae, Derogenidae, Glypthelminthidae, Cladorchiidae, Kathlaniidae, Heterakidae |
Género | Rhabdias, Aplectana, Clinostomum, Oswaldocruzia, Physaloptera, Gorgoderina, Langeronia, Haematoloechus, Foleyellides, Choledocystus, Rauschiella, Kalicephalus, Halipegus, Parapharyngodon, Glypthelmins, Turgida, Megalodiscus, Cruzia, Parallopharynx, Cosmocerca, Strongyluris, Cosmocercella |
Especie | Rhabdias lamothei, Langeronia macrocirra, Haematoloechus coloradenis, Haematoloechus meridionalis, Choledocystus hepaticus, Haematoloechus floedae, Rauschiella tineri, Halipegus occidualis, Haematoloechus macrorchis, Rhabdias kuzmini, Haematoloechus complexus, Parapharyngodon chamelensis, Glypthelmins quieta, Rhabdias fuscovenosa, Halipegus psilonotae, Haematoloechus illimis, Megalodiscus americanus, Cruzia morleyi, Haematoloechus danbrooksi, Parallopharynx arctus, Cosmocerca podicipinus, Oswaldocruzia subauricularis, Cosmocercella diaglenae |
Cobertura temporal
Fecha Inicial / Fecha Final | 1997-04-25 / 2010-06-30 |
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Datos del proyecto
En el presente proyecto se desarrollará una base de datos de secuencias de ADN de referencia, asociadas a la información taxonómica de cada especie de helmintos de anfibios y reptiles en México. Esta base de datos servirá en un futuro cercano como un sistema de identificación rápida de especies que será una vía de comunicación ágil entre los generadores de información taxonómica y los usuarios de ésta (ecólogos, conservacionistas, ecoguardias, etc.). La identificación rápida y oportuna de los helmintos de anfibios y reptiles de México aportará información acerca de las condiciones de las poblaciones de hospederos debido a que los parásitos pueden utilizarse como especies centinelas de alteraciones ambientales. El objetivo general del presente proyecto es caracterizar genéticamente a especies selectas de helmintos de anfibios y reptiles en México, con secuencias del gen Citocromo Oxidasa I (COI) para generar una herramienta de identificación rápida de dichas especies. Se obtendrán las secuencias parciales del gen COI para 73 especies de helmintos anfibios y reptiles de México. En los casos necesarios se obtendrán las secuencias de otras regiones de ADN para lograr la diferenciación de las especies. Las secuencias se analizarán con metodologías de agrupación filogenética como parsimonia o análisis bayesianos. Se generará una base de datos con la información taxonómica y geográfica de los ejemplares, con páginas electrónicas asociadas que contengan la secuencia de COI, la fotografía y otras secuencias si es el caso.
Título | Códigos de barras de helmintos de anfibios y reptiles de México |
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Identificador | SNIB-HB026-Varios archivos XLS-ND |
Fuentes de Financiación | Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO) |
Descripción del área de estudio | Invertebrados gusanos planos o helmintos como duelas, monogéneos, planarias, solitarias (tenias) gusanos redondos, gusanos cilíndricos o helmintos como áscaris, filarias, nemátodos, triquinas |
Personas asociadas al proyecto:
- Content Provider
Datos de la colección
Nombre de la Colección | NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE;Research Collection of Virginia Leon;NO DISPONIBLE |
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Identificador de la Colección | SNIB-HB026-Varios archivos XLS-ND |
Identificador de la Colección Parental | NO APLICA |
Nombre de la Colección | Colección Nacional de Helmintos;CNHE;Instituto de Biología, Universidad Nacional Autónoma de México;IBUNAM |
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Identificador de la Colección | SNIB-HB026-Varios archivos XLS-ND |
Identificador de la Colección Parental | NO APLICA |
Unidades curatoriales | Entre 1 y 76 Ejemplar |
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Metadatos adicionales
Identificadores alternativos | aa6bf18d-4d34-417b-a009-3501002575af |
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https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-HB026 |