| Lonchocarpus berriozabalensis Miranda ex M. Sousa, 2009 |
| Lonchocarpus bicolor M. Sousa, 1990 |
| Lonchocarpus brachyanthus M. Sousa, 2014 |
| Lonchocarpus brenesii M. Sousa, 2009 |
| Lonchocarpus castilloi Standl., 1932 |
| Lonchocarpus caudatus Pittier, 1917 |
| Lonchocarpus chavelasii M. Sousa ex Cruz Durán & G. Andrade, 2021 |
| Lonchocarpus chiapensis Lundell, 1946 |
| Lonchocarpus cochleatus Pittier, 1917 |
| Lonchocarpus comitensis Pittier, 1917 |
| Lonchocarpus congestiflorus M. Sousa & J. Linares, 2011 |
| Lonchocarpus constrictus Pittier, 1917 |
| Lonchocarpus crassicalyx M. Sousa, 2014 |
| Lonchocarpus cruentus Lundell, 1945 |
| Lonchocarpus cruentus subsp. cruentus Lundell, 1945 |
| Lonchocarpus cruentus subsp. grandiflorus M. Sousa, 1945 |
| Lonchocarpus domingensis (Turpin ex Pers.) DC., 1825 |
| Lonchocarpus dumetorum Brandegee, 1922 |
| Lonchocarpus emarginatus Pittier, 1917 |
| Lonchocarpus epigaeus M. Sousa, 1989 |