| Catenula Mereschk., 1903 |
| Catenula adhaerens (Mereschk.) Mereschk., 1902 |
| Catenula pelagica Mereschk., 1902 |
| Caulobothrium Baer, 1948 |
| Caulobothrium opisthorchis Riser, 1955 |
| Ceracea Cragin, 1885 |
| Ceracea lagerheimii Pat., 1893 |
| Ceratosporella Höhn., 1923 |
| Ceratosporella deviata Subram., 1957 |
| Cercaria Müller, 1773 |
| Cercaria burti Miller, 1923 |
| Cercaria ephemera Nitzsch, 1817 |
| Cercaria floridensis McCoy, 1928 |
| Cercaria physellae Talbot, 1936 |
| Chaetoseptoria Tehon, 1937 |
| Chaetoseptoria wellmanii J. A. Stev., 1946 |
| Chalara (Corda) Rabenh., 1844 |
| Chalara affinis Sacc. & Berl., 1885 |
| Chalara alabamensis E. B. G. Jones & E. G. Ingram, 1976 |
| Chalara aurea (Corda) S. Hughes, 1958 |