| Aecidium roseum Dietel & Holw., 1897 |
| Aecidium solani Mont., 1852 |
| Aecidium steviicola Arthur, 1918 |
| Aecidium thevetiae Sacc., 1913 |
| Aecidium zephyranthis Shear, 1902 |
| Akashiwo Gert Hansen & Moestrup, 2000 |
| Akashiwo sanguinea (K. Hirasaka) Gert Hansen & Moestrup, 2000 |
| Alysidiopsis B. Sutton, 1973 |
| Alysidiopsis pipsissewae B. Sutton, 1973 |
| Anaselenosporella Heredia, R. F. Castañeda & R. M. Arias, 2010 |
| Anaselenosporella sylvatica Heredia, R. F. Castañeda & R. M. Arias, 2010 |
| Anaseptoidium R. F. Castañeda, Heredia & R. M. Arias, 2012 |
| Anaseptoidium mycophilum R. F. Castañeda, Heredia & R. M. Arias, 2012 |
| Ancorasporella J. Mena, Mercado & Heredia, 2017 |
| Ancorasporella mexicana J. Mena, Mercado & Heredia, 2017 |
| Anellaria P. Karst., 1879 |
| Anellaria sepulchralis (Berk.) Singer, 1951 |
| Anthobothrium Van Beneden, 1850 |
| Anthobothrium caseyi Ruhnke & Caira, 2009 |
| Anthothoe Carlgren, 1938 |