| Schwanniomyces occidentalis Klöcker, 1909 |
| Scolecobasidium E. V. Abbott, 1927 |
| Scolecobasidium constrictum E. V. Abbott, 1927 |
| Scolicotrichum Kunze, 1817 |
| Scolicotrichum musae Zimm., 1902 |
| Selenodriella R. F. Castañeda & W. B. Kendr., 1990 |
| Selenodriella fertilis (Piroz. & Hodges) R. F. Castañeda & W. B. Kendr., 1990 |
| Selenodriella intermedia R. F. Castañeda & W. B. Kendr., 1990 |
| Selenodriella perramosa W. B. Kendr. & R. F. Castañeda, 1990 |
| Selenopemphix P.N. Benedek, 1972 |
| Selenopemphix nephroides P.N. Benedek, 1972 |
| Selenopemphix quanta (M.R. Bradford) Matsuoka, 1985 |
| Selenosporella G. Arnaud ex MacGarvie, 1968 |
| Selenosporella conglutinata R.F. Castañeda, 1985 |
| Selenosporella curvispora G. Arnaud ex MacGarvie, 1969 |
| Septomyrothecium Matsush., 1971 |
| Septomyrothecium uniseptatum Matsush., 1971 |
| Septonema Corda, 1837 |
| Septonema fragile R. F. Castañeda, 1988 |
| Sinophysis Nie & C. Wang, 1944 |