| Cyanothrix Gardner, 1927 |
| Heterohormogonium J.J. Copel., 1936 |
| Lauterbonia Pringsheim, 1968 |
| Synechococcaceae Komárek & Anagn., 1995 |
| Synechococcus Nägeli, 1849 |
| Synechococcus aeruginosus Nägeli, 1849 |
| Synechococcus cedrorum Sauv., 1892 |
| Synechococcus elongatus (Nägeli) Nägeli, 1849 |
| Synechococcus geitleri De Toni, 1936 |
| Synechococcus nidulans (Pringsheim) Komárek, 1970 |
| Synechococcus parvulus Nägeli, 1849 |
| Synechococcus racemosus Wolle, 1881 |