Jerarquía taxonómica:
Gomphonemataceae → Gomphonema Ehrenb., 1832

Familia:
Gomphonemataceae

Autor:
Ehrenb., 1832

Sinónimos:
El catálogo no cuenta con sinónimos para este género

Especies válidas/aceptadas:
Gomphonema acidoclinatum
Gomphonema acuminatum
Gomphonema acuminatum var. clavus
Gomphonema acuminatum var. intermedium
Gomphonema affine
Gomphonema affine var. rhombicum
Gomphonema amoenum
Gomphonema anglicum
Gomphonema angustatum
Gomphonema angustum
Gomphonema angustum var. lunatum
Gomphonema apicatum
Gomphonema apuncto
Gomphonema aquaemineralis
Gomphonema astridiae
Gomphonema augur
Gomphonema auritum
Gomphonema bourbonense
Gomphonema brasiliense
Gomphonema brasiliense var. brasiliense
Gomphonema brasiliensoides
Gomphonema capitatum
Gomphonema carolinense
Gomphonema catena
Gomphonema clavatum
Gomphonema clevei
Gomphonema clevei var. javanica
Gomphonema commutatum
Gomphonema coronatum
Gomphonema cumrhis
Gomphonema dichotomum
Gomphonema dubravicense
Gomphonema entolejum
Gomphonema exilissimum
Gomphonema gandhii
Gomphonema gracile
Gomphonema graciledictum
Gomphonema hebridense
Gomphonema helveticum
Gomphonema innocens
Gomphonema insigne
Gomphonema intricatum
Gomphonema kobayashiae
Gomphonema kobayasii
Gomphonema lagenula
Gomphonema lanceolatum
Gomphonema laticollum
Gomphonema lepidum
Gomphonema lippertii
Gomphonema longiceps
Gomphonema maclaughlinii
Gomphonema mariovense
Gomphonema martini
Gomphonema meridionale
Gomphonema mexicanum
Gomphonema micropus
Gomphonema minusculum
Gomphonema minutum
Gomphonema minutum f. pachypus
Gomphonema minutum f. syriacum
Gomphonema naviculoides
Gomphonema novacula
Gomphonema olivaceum
Gomphonema parvuliforme
Gomphonema parvulius
Gomphonema parvulum
Gomphonema parvulum var. genuinum
Gomphonema parvulum var. parvulum
Gomphonema productum
Gomphonema pseudoaugur
Gomphonema pseudobohemicum
Gomphonema pseudosphaerophorum
Gomphonema pumilum
Gomphonema pumilum var. rigidum
Gomphonema pusillum
Gomphonema pygmaeum
Gomphonema salae
Gomphonema saprophilum
Gomphonema sarcophagus
Gomphonema simum
Gomphonema sphaerophorum
Gomphonema stonei
Gomphonema subclavatum
Gomphonema subclavatum var. subclavatum
Gomphonema subtile
Gomphonema sundaense
Gomphonema tenellum
Gomphonema tenuissimum
Gomphonema tergestinum
Gomphonema truncatum
Gomphonema truncatum var. truncatum
Gomphonema truncatum var. turgidum
Gomphonema undulatum
Gomphonema utae
Gomphonema ventricosum
Gomphonema ventricosum var. ventricosum
Gomphonema vibrio
Gomphonema vibrio var. pulvinatum
Gomphonema vibrioides
Gomphonema wiltschkorum
Gomphonema yucatanense