| Oncidium pusillum (L.) Mutel, 1837 |
| Oncidium pusillum var. megalanthum Schltr., 1924 |
| Oncidium pygmaeum (Lindl.) Beer, 1854 |
| Oncidium rariflorum A. Rich. & Galeotti, 1845 |
| Oncidium reflexum Lindl., 1837 |
| Oncidium reflexum var. intermedium Regel, 1856 |
| Oncidium reichenheimii (Linden & Rchb. f.) Garay & Stacy, 1974 |
| Oncidium retemeyerianum Rchb. f., 1856 |
| Oncidium saltator Lem., 1847 |
| Oncidium salvadorense Schltr., 1913 |
| Oncidium sawyeri L.O. Williams, 1951 |
| Oncidium scriptum (Scheidw.) Rchb. f., 1863 |
| Oncidium signatum Rchb. f., 1881 |
| Oncidium sotoanum R. Jiménez & Hágsater, 2010 |
| Oncidium sotoanum subsp. papalosmum R. Jiménez, 2010 |
| Oncidium sotoanum subsp. sotoanum R. Jiménez & Hágsater, 2010 |
| Oncidium sphacelatum Lindl., 1841 |
| Oncidium sphacelatum var. majus Lindl., 1841 |
| Oncidium sphacelatum var. minus Lindl., 1841 |
| Oncidium stelligerum Rchb. f., 1873 |