Ceiba aesculifolia como especie modelo para el estudio molecular del envejecimiento de las semillas en relación al desempeño germinativo

Occurrence
Latest version published by Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad on Apr 1, 2025 Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad

Download the latest version of this resource data as a Darwin Core Archive (DwC-A) or the resource metadata as EML or RTF:

Data as a DwC-A file download 6 records in Spanish (9 KB) - Update frequency: not planned
Metadata as an EML file download in Spanish (16 KB)
Metadata as an RTF file download in Spanish (12 KB)

Description

Proyecto financiado con recursos provenientes de la Dirección General del Sector Primario y Recursos Naturales Renovables de la SEMARNAT. En los últimos años se ha señalado la importancia del estudio de la diversidad genética de las especies para comprender la fisiología de las plantas dentro de un contexto ecológico. En este proyecto hemos seleccionado a Ceiba aesculifolia, una especie silvestre con un gran potencial para análisis genéticos y fisiológicos, así como por su importancia en procesos de restauración y el aprovechamiento de sus frutos (fibra y semilla) en las diferentes localidades donde se distribuye. En particular, estamos interesados en llevar a cabo un análisis transcriptómico del proceso de germinación en función del contenido relativo de agua de las semillas como un parámetro fisiológico adecuado para comparar los diferentes lotes de semillas, provenientes de diferentes años de colecta, y para comparar los diferentes tratamientos que pueden modificar el desempeño germinativo. Los datos obtenidos por medio de las técnicas de secuenciación masiva del transcriptoma de las diferentes muestras nos permitirán obtener una base con datos genéticos de la semilla de Ceiba aesculifolia que podrá ser usada como referencia para otro tipo de estudios. Por un lado, la combinación de los transcriptomas asociados a diferentes tratamientos de acondicionamiento mátrico y de envejecimiento, junto con sus respectivos grupos control, nos permitirá obtener una base de datos de posibles transcritos asociados a un amplio espectro de procesos biológicos pertenecientes a diversos programas de desarrollo. Por otro lado, el análisis comparativo de los transcriptomas de cada tratamiento nos permitirá discernir entre los distintos procesos biológicos que están asociados con el mejoramiento de la respuesta germinativa y el deterioro de las semillas por el proceso de envejecimiento. Estos análisis a su vez permitirán plantear nuevas hipótesis de trabajo para el manejo de especies mexicanas no-modelo. Este proyecto constituye una parte de la tesis doctoral de la alumna Ximena Gómez Maqueo Bribiesca, bajo la tutoría de los Dres. Alicia Gamboa de Buen (tutor principal) y Luis David Alcaraz Peraza.

Reino: 1 Filo: 1 Clase: 1 Orden: 1 Familia: 1 Género: 1 Especie: 1

Data Records

The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 6 records.

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

Versions

The table below shows only published versions of the resource that are publicly accessible.

Rights

Researchers should respect the following rights statement:

The publisher and rights holder of this work is Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF Registration

This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: 5a201bcf-7396-4dcb-a535-238957812be3.  Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by Biodiversity Information System of Mexico.

Keywords

Occurrence; Plantas; Occurrence

External data

The resource data is also available in other formats

SNIB-OE001-CSV.zip http://www.snib.mx/proyectos/OE001/SNIB-OE001-CSV.zip UTF-8 CSV
SNIB-OE001-BD.zip http://www.snib.mx/proyectos/OE001/SNIB-OE001-BD.zip UTF-8 MDB MicrosoftAccess2007

Contacts

Alicia Gamboa de Buen
  • Originator
  • Responsable
Universidad Nacional Autónoma de MéxicoInstituto de EcologíaDepartamento de Ecología Funcional y Aplicada
04510 México
Distrito Federal
MX
  • 5622-8222 ext. 47897
CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
  • Metadata Provider
  • Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  • Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
14010 MÉXICO
Tlalpan
MX
  • 50045000
Patricia Ramos Rivera
  • Point Of Contact
  • Directora General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  • Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
14010 México
Tlalpan
MX
  • 50045000

Geographic Coverage

País: MEXICO (VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE)

Bounding Coordinates South West [19.541, -96.735], North East [19.541, -96.735]

Taxonomic Coverage

Reino: Plantae Filo: Tracheophyta Clase: Magnoliopsida Orden: Malvales Familia: Malvaceae

Kingdom Plantae
Phylum Tracheophyta
Class Magnoliopsida
Order Malvales
Family Malvaceae
Genus Ceiba
Species Ceiba aesculifolia (Pochote, Mosmót (Zoque), ahaiyá (Guarijío), algodoncillo, ceiba, ceibo (Maya), ch'oo (Maya), chote, huacapi (Guarijío), k'inim (Maya), kuch (Maya), kuché (Maya), len-o-ma (Chontal de Oaxaca), ma-tzu (Chinanteco), matzu (Chinanteco), mo-dzu (Chinanteco), piim (Maya), piim yaxche (Maya), pochota (Totonaco), pochote, pochotl (Náhuatl), píin (Maya), ya'ax che' (Maya), ya'ax-che (Maya), ya'ax-ek (Maya), ya'axche (Maya), yaga-piogo-xila (Zapoteco), yaga-piogo-xilla (Zapoteco), yaxché (Maya))

Temporal Coverage

Start Date / End Date 2012-02-08 / 2016-02-15

Project Data

Proyecto financiado con recursos provenientes de la Dirección General del Sector Primario y Recursos Naturales Renovables de la SEMARNAT. En los últimos años se ha señalado la importancia del estudio de la diversidad genética de las especies para comprender la fisiología de las plantas dentro de un contexto ecológico. En este proyecto hemos seleccionado a Ceiba aesculifolia, una especie silvestre con un gran potencial para análisis genéticos y fisiológicos, así como por su importancia en procesos de restauración y el aprovechamiento de sus frutos (fibra y semilla) en las diferentes localidades donde se distribuye. En particular, estamos interesados en llevar a cabo un análisis transcriptómico del proceso de germinación en función del contenido relativo de agua de las semillas como un parámetro fisiológico adecuado para comparar los diferentes lotes de semillas, provenientes de diferentes años de colecta, y para comparar los diferentes tratamientos que pueden modificar el desempeño germinativo. Los datos obtenidos por medio de las técnicas de secuenciación masiva del transcriptoma de las diferentes muestras nos permitirán obtener una base con datos genéticos de la semilla de Ceiba aesculifolia que podrá ser usada como referencia para otro tipo de estudios. Por un lado, la combinación de los transcriptomas asociados a diferentes tratamientos de acondicionamiento mátrico y de envejecimiento, junto con sus respectivos grupos control, nos permitirá obtener una base de datos de posibles transcritos asociados a un amplio espectro de procesos biológicos pertenecientes a diversos programas de desarrollo. Por otro lado, el análisis comparativo de los transcriptomas de cada tratamiento nos permitirá discernir entre los distintos procesos biológicos que están asociados con el mejoramiento de la respuesta germinativa y el deterioro de las semillas por el proceso de envejecimiento. Estos análisis a su vez permitirán plantear nuevas hipótesis de trabajo para el manejo de especies mexicanas no-modelo. Este proyecto constituye una parte de la tesis doctoral de la alumna Ximena Gómez Maqueo Bribiesca, bajo la tutoría de los Dres. Alicia Gamboa de Buen (tutor principal) y Luis David Alcaraz Peraza.

Title Ceiba aesculifolia como especie modelo para el estudio molecular del envejecimiento de las semillas en relación al desempeño germinativo
Identifier SNIB-OE001-OE0012001F-ND
Funding Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
Study Area Description Plantas con flores como achiotes, algodón, baobabs, cacao, ceibas, flor de Jamaica, flor de manita, jonote, malvas, pochotes

The personnel involved in the project:

Alicia Gamboa de Buen
  • Content Provider

Collection Data

Collection Name NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE
Collection Identifier SNIB-OE001-OE0012001F-ND
Parent Collection Identifier NO APLICA
Curatorial Units Between 1 and 6 Ejemplar

Additional Metadata

Alternative Identifiers 5a201bcf-7396-4dcb-a535-238957812be3
https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-OE001