Ceiba aesculifolia como especie modelo para el estudio molecular del envejecimiento de las semillas en relación al desempeño germinativo

Registro biológico
Última versión publicado por Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad el abr 1, 2025 Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad

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Descripción

Proyecto financiado con recursos provenientes de la Dirección General del Sector Primario y Recursos Naturales Renovables de la SEMARNAT. En los últimos años se ha señalado la importancia del estudio de la diversidad genética de las especies para comprender la fisiología de las plantas dentro de un contexto ecológico. En este proyecto hemos seleccionado a Ceiba aesculifolia, una especie silvestre con un gran potencial para análisis genéticos y fisiológicos, así como por su importancia en procesos de restauración y el aprovechamiento de sus frutos (fibra y semilla) en las diferentes localidades donde se distribuye. En particular, estamos interesados en llevar a cabo un análisis transcriptómico del proceso de germinación en función del contenido relativo de agua de las semillas como un parámetro fisiológico adecuado para comparar los diferentes lotes de semillas, provenientes de diferentes años de colecta, y para comparar los diferentes tratamientos que pueden modificar el desempeño germinativo. Los datos obtenidos por medio de las técnicas de secuenciación masiva del transcriptoma de las diferentes muestras nos permitirán obtener una base con datos genéticos de la semilla de Ceiba aesculifolia que podrá ser usada como referencia para otro tipo de estudios. Por un lado, la combinación de los transcriptomas asociados a diferentes tratamientos de acondicionamiento mátrico y de envejecimiento, junto con sus respectivos grupos control, nos permitirá obtener una base de datos de posibles transcritos asociados a un amplio espectro de procesos biológicos pertenecientes a diversos programas de desarrollo. Por otro lado, el análisis comparativo de los transcriptomas de cada tratamiento nos permitirá discernir entre los distintos procesos biológicos que están asociados con el mejoramiento de la respuesta germinativa y el deterioro de las semillas por el proceso de envejecimiento. Estos análisis a su vez permitirán plantear nuevas hipótesis de trabajo para el manejo de especies mexicanas no-modelo. Este proyecto constituye una parte de la tesis doctoral de la alumna Ximena Gómez Maqueo Bribiesca, bajo la tutoría de los Dres. Alicia Gamboa de Buen (tutor principal) y Luis David Alcaraz Peraza.

Reino: 1 Filo: 1 Clase: 1 Orden: 1 Familia: 1 Género: 1 Especie: 1

Registros

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Versiones

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Derechos

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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 5a201bcf-7396-4dcb-a535-238957812be3.  Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Biodiversity Information System of Mexico.

Palabras clave

Occurrence; Plantas; Occurrence

Datos externos

Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos

SNIB-OE001-CSV.zip http://www.snib.mx/proyectos/OE001/SNIB-OE001-CSV.zip UTF-8 CSV
SNIB-OE001-BD.zip http://www.snib.mx/proyectos/OE001/SNIB-OE001-BD.zip UTF-8 MDB MicrosoftAccess2007

Contactos

Alicia Gamboa de Buen
  • Originador
  • Responsable
Universidad Nacional Autónoma de MéxicoInstituto de EcologíaDepartamento de Ecología Funcional y Aplicada
04510 México
Distrito Federal
MX
  • 5622-8222 ext. 47897
CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
  • Proveedor De Los Metadatos
  • Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  • Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
14010 MÉXICO
Tlalpan
MX
  • 50045000
Patricia Ramos Rivera
  • Punto De Contacto
  • Directora General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  • Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
14010 México
Tlalpan
MX
  • 50045000

Cobertura geográfica

País: MEXICO (VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE)

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [19,541, -96,735], Latitud Máxima Longitud Máxima [19,541, -96,735]

Cobertura taxonómica

Reino: Plantae Filo: Tracheophyta Clase: Magnoliopsida Orden: Malvales Familia: Malvaceae

Reino Plantae
Filo Tracheophyta
Class Magnoliopsida
Orden Malvales
Familia Malvaceae
Género Ceiba
Especie Ceiba aesculifolia (Pochote, Mosmót (Zoque), ahaiyá (Guarijío), algodoncillo, ceiba, ceibo (Maya), ch'oo (Maya), chote, huacapi (Guarijío), k'inim (Maya), kuch (Maya), kuché (Maya), len-o-ma (Chontal de Oaxaca), ma-tzu (Chinanteco), matzu (Chinanteco), mo-dzu (Chinanteco), piim (Maya), piim yaxche (Maya), pochota (Totonaco), pochote, pochotl (Náhuatl), píin (Maya), ya'ax che' (Maya), ya'ax-che (Maya), ya'ax-ek (Maya), ya'axche (Maya), yaga-piogo-xila (Zapoteco), yaga-piogo-xilla (Zapoteco), yaxché (Maya))

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2012-02-08 / 2016-02-15

Datos del proyecto

Proyecto financiado con recursos provenientes de la Dirección General del Sector Primario y Recursos Naturales Renovables de la SEMARNAT. En los últimos años se ha señalado la importancia del estudio de la diversidad genética de las especies para comprender la fisiología de las plantas dentro de un contexto ecológico. En este proyecto hemos seleccionado a Ceiba aesculifolia, una especie silvestre con un gran potencial para análisis genéticos y fisiológicos, así como por su importancia en procesos de restauración y el aprovechamiento de sus frutos (fibra y semilla) en las diferentes localidades donde se distribuye. En particular, estamos interesados en llevar a cabo un análisis transcriptómico del proceso de germinación en función del contenido relativo de agua de las semillas como un parámetro fisiológico adecuado para comparar los diferentes lotes de semillas, provenientes de diferentes años de colecta, y para comparar los diferentes tratamientos que pueden modificar el desempeño germinativo. Los datos obtenidos por medio de las técnicas de secuenciación masiva del transcriptoma de las diferentes muestras nos permitirán obtener una base con datos genéticos de la semilla de Ceiba aesculifolia que podrá ser usada como referencia para otro tipo de estudios. Por un lado, la combinación de los transcriptomas asociados a diferentes tratamientos de acondicionamiento mátrico y de envejecimiento, junto con sus respectivos grupos control, nos permitirá obtener una base de datos de posibles transcritos asociados a un amplio espectro de procesos biológicos pertenecientes a diversos programas de desarrollo. Por otro lado, el análisis comparativo de los transcriptomas de cada tratamiento nos permitirá discernir entre los distintos procesos biológicos que están asociados con el mejoramiento de la respuesta germinativa y el deterioro de las semillas por el proceso de envejecimiento. Estos análisis a su vez permitirán plantear nuevas hipótesis de trabajo para el manejo de especies mexicanas no-modelo. Este proyecto constituye una parte de la tesis doctoral de la alumna Ximena Gómez Maqueo Bribiesca, bajo la tutoría de los Dres. Alicia Gamboa de Buen (tutor principal) y Luis David Alcaraz Peraza.

Título Ceiba aesculifolia como especie modelo para el estudio molecular del envejecimiento de las semillas en relación al desempeño germinativo
Identificador SNIB-OE001-OE0012001F-ND
Fuentes de Financiación Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
Descripción del área de estudio Plantas con flores como achiotes, algodón, baobabs, cacao, ceibas, flor de Jamaica, flor de manita, jonote, malvas, pochotes

Personas asociadas al proyecto:

Alicia Gamboa de Buen
  • Content Provider

Datos de la colección

Nombre de la Colección NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE
Identificador de la Colección SNIB-OE001-OE0012001F-ND
Identificador de la Colección Parental NO APLICA
Unidades curatoriales Entre 1 y 6 Ejemplar

Metadatos adicionales

Identificadores alternativos 5a201bcf-7396-4dcb-a535-238957812be3
https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-OE001