Descripción
Proyecto financiado con recursos provenientes de la Dirección General del Sector Primario y Recursos Naturales Renovables de la SEMARNAT. En los últimos años se ha señalado la importancia del estudio de la diversidad genética de las especies para comprender la fisiología de las plantas dentro de un contexto ecológico. En este proyecto hemos seleccionado a Ceiba aesculifolia, una especie silvestre con un gran potencial para análisis genéticos y fisiológicos, así como por su importancia en procesos de restauración y el aprovechamiento de sus frutos (fibra y semilla) en las diferentes localidades donde se distribuye. En particular, estamos interesados en llevar a cabo un análisis transcriptómico del proceso de germinación en función del contenido relativo de agua de las semillas como un parámetro fisiológico adecuado para comparar los diferentes lotes de semillas, provenientes de diferentes años de colecta, y para comparar los diferentes tratamientos que pueden modificar el desempeño germinativo. Los datos obtenidos por medio de las técnicas de secuenciación masiva del transcriptoma de las diferentes muestras nos permitirán obtener una base con datos genéticos de la semilla de Ceiba aesculifolia que podrá ser usada como referencia para otro tipo de estudios. Por un lado, la combinación de los transcriptomas asociados a diferentes tratamientos de acondicionamiento mátrico y de envejecimiento, junto con sus respectivos grupos control, nos permitirá obtener una base de datos de posibles transcritos asociados a un amplio espectro de procesos biológicos pertenecientes a diversos programas de desarrollo. Por otro lado, el análisis comparativo de los transcriptomas de cada tratamiento nos permitirá discernir entre los distintos procesos biológicos que están asociados con el mejoramiento de la respuesta germinativa y el deterioro de las semillas por el proceso de envejecimiento. Estos análisis a su vez permitirán plantear nuevas hipótesis de trabajo para el manejo de especies mexicanas no-modelo. Este proyecto constituye una parte de la tesis doctoral de la alumna Ximena Gómez Maqueo Bribiesca, bajo la tutoría de los Dres. Alicia Gamboa de Buen (tutor principal) y Luis David Alcaraz Peraza.
Reino: 1 Filo: 1 Clase: 1 Orden: 1 Familia: 1 Género: 1 Especie: 1
Registros
Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 6 registros.
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Versiones
La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.
Derechos
Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:
El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).
Registro GBIF
Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 5a201bcf-7396-4dcb-a535-238957812be3. Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Biodiversity Information System of Mexico.
Palabras clave
Occurrence; Plantas; Occurrence
Datos externos
Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos
SNIB-OE001-CSV.zip | http://www.snib.mx/proyectos/OE001/SNIB-OE001-CSV.zip UTF-8 CSV |
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SNIB-OE001-BD.zip | http://www.snib.mx/proyectos/OE001/SNIB-OE001-BD.zip UTF-8 MDB MicrosoftAccess2007 |
Contactos
- Originador
- Responsable
- 5622-8222 ext. 47897
- Proveedor De Los Metadatos
- Dirección General de Sistemas
- Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
- 50045000
- Punto De Contacto
- Directora General de Sistemas
- Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
- 50045000
Cobertura geográfica
País: MEXICO (VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE)
Coordenadas límite | Latitud Mínima Longitud Mínima [19,541, -96,735], Latitud Máxima Longitud Máxima [19,541, -96,735] |
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Cobertura taxonómica
Reino: Plantae Filo: Tracheophyta Clase: Magnoliopsida Orden: Malvales Familia: Malvaceae
Reino | Plantae |
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Filo | Tracheophyta |
Class | Magnoliopsida |
Orden | Malvales |
Familia | Malvaceae |
Género | Ceiba |
Especie | Ceiba aesculifolia (Pochote, Mosmót (Zoque), ahaiyá (Guarijío), algodoncillo, ceiba, ceibo (Maya), ch'oo (Maya), chote, huacapi (Guarijío), k'inim (Maya), kuch (Maya), kuché (Maya), len-o-ma (Chontal de Oaxaca), ma-tzu (Chinanteco), matzu (Chinanteco), mo-dzu (Chinanteco), piim (Maya), piim yaxche (Maya), pochota (Totonaco), pochote, pochotl (Náhuatl), píin (Maya), ya'ax che' (Maya), ya'ax-che (Maya), ya'ax-ek (Maya), ya'axche (Maya), yaga-piogo-xila (Zapoteco), yaga-piogo-xilla (Zapoteco), yaxché (Maya)) |
Cobertura temporal
Fecha Inicial / Fecha Final | 2012-02-08 / 2016-02-15 |
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Datos del proyecto
Proyecto financiado con recursos provenientes de la Dirección General del Sector Primario y Recursos Naturales Renovables de la SEMARNAT. En los últimos años se ha señalado la importancia del estudio de la diversidad genética de las especies para comprender la fisiología de las plantas dentro de un contexto ecológico. En este proyecto hemos seleccionado a Ceiba aesculifolia, una especie silvestre con un gran potencial para análisis genéticos y fisiológicos, así como por su importancia en procesos de restauración y el aprovechamiento de sus frutos (fibra y semilla) en las diferentes localidades donde se distribuye. En particular, estamos interesados en llevar a cabo un análisis transcriptómico del proceso de germinación en función del contenido relativo de agua de las semillas como un parámetro fisiológico adecuado para comparar los diferentes lotes de semillas, provenientes de diferentes años de colecta, y para comparar los diferentes tratamientos que pueden modificar el desempeño germinativo. Los datos obtenidos por medio de las técnicas de secuenciación masiva del transcriptoma de las diferentes muestras nos permitirán obtener una base con datos genéticos de la semilla de Ceiba aesculifolia que podrá ser usada como referencia para otro tipo de estudios. Por un lado, la combinación de los transcriptomas asociados a diferentes tratamientos de acondicionamiento mátrico y de envejecimiento, junto con sus respectivos grupos control, nos permitirá obtener una base de datos de posibles transcritos asociados a un amplio espectro de procesos biológicos pertenecientes a diversos programas de desarrollo. Por otro lado, el análisis comparativo de los transcriptomas de cada tratamiento nos permitirá discernir entre los distintos procesos biológicos que están asociados con el mejoramiento de la respuesta germinativa y el deterioro de las semillas por el proceso de envejecimiento. Estos análisis a su vez permitirán plantear nuevas hipótesis de trabajo para el manejo de especies mexicanas no-modelo. Este proyecto constituye una parte de la tesis doctoral de la alumna Ximena Gómez Maqueo Bribiesca, bajo la tutoría de los Dres. Alicia Gamboa de Buen (tutor principal) y Luis David Alcaraz Peraza.
Título | Ceiba aesculifolia como especie modelo para el estudio molecular del envejecimiento de las semillas en relación al desempeño germinativo |
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Identificador | SNIB-OE001-OE0012001F-ND |
Fuentes de Financiación | Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO) |
Descripción del área de estudio | Plantas con flores como achiotes, algodón, baobabs, cacao, ceibas, flor de Jamaica, flor de manita, jonote, malvas, pochotes |
Personas asociadas al proyecto:
- Content Provider
Datos de la colección
Nombre de la Colección | NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE |
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Identificador de la Colección | SNIB-OE001-OE0012001F-ND |
Identificador de la Colección Parental | NO APLICA |
Unidades curatoriales | Entre 1 y 6 Ejemplar |
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Metadatos adicionales
Identificadores alternativos | 5a201bcf-7396-4dcb-a535-238957812be3 |
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https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-OE001 |