Ceiba aesculifolia como especie modelo para el estudio molecular del envejecimiento de las semillas en relación al desempeño germinativo

Событие
Последняя версия опубликовано Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad апр. 1, 2025 Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
Дата публикации:
1 апреля 2025 г.
Лицензия:
CC-BY 4.0

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Описание

Proyecto financiado con recursos provenientes de la Dirección General del Sector Primario y Recursos Naturales Renovables de la SEMARNAT. En los últimos años se ha señalado la importancia del estudio de la diversidad genética de las especies para comprender la fisiología de las plantas dentro de un contexto ecológico. En este proyecto hemos seleccionado a Ceiba aesculifolia, una especie silvestre con un gran potencial para análisis genéticos y fisiológicos, así como por su importancia en procesos de restauración y el aprovechamiento de sus frutos (fibra y semilla) en las diferentes localidades donde se distribuye. En particular, estamos interesados en llevar a cabo un análisis transcriptómico del proceso de germinación en función del contenido relativo de agua de las semillas como un parámetro fisiológico adecuado para comparar los diferentes lotes de semillas, provenientes de diferentes años de colecta, y para comparar los diferentes tratamientos que pueden modificar el desempeño germinativo. Los datos obtenidos por medio de las técnicas de secuenciación masiva del transcriptoma de las diferentes muestras nos permitirán obtener una base con datos genéticos de la semilla de Ceiba aesculifolia que podrá ser usada como referencia para otro tipo de estudios. Por un lado, la combinación de los transcriptomas asociados a diferentes tratamientos de acondicionamiento mátrico y de envejecimiento, junto con sus respectivos grupos control, nos permitirá obtener una base de datos de posibles transcritos asociados a un amplio espectro de procesos biológicos pertenecientes a diversos programas de desarrollo. Por otro lado, el análisis comparativo de los transcriptomas de cada tratamiento nos permitirá discernir entre los distintos procesos biológicos que están asociados con el mejoramiento de la respuesta germinativa y el deterioro de las semillas por el proceso de envejecimiento. Estos análisis a su vez permitirán plantear nuevas hipótesis de trabajo para el manejo de especies mexicanas no-modelo. Este proyecto constituye una parte de la tesis doctoral de la alumna Ximena Gómez Maqueo Bribiesca, bajo la tutoría de los Dres. Alicia Gamboa de Buen (tutor principal) y Luis David Alcaraz Peraza.

Reino: 1 Filo: 1 Clase: 1 Orden: 1 Familia: 1 Género: 1 Especie: 1

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Версии

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Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 5a201bcf-7396-4dcb-a535-238957812be3.  Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Biodiversity Information System of Mexico.

Ключевые слова

Occurrence; Plantas; Occurrence

Внешние данные

Ресурс также доступен в других форматах

SNIB-OE001-CSV.zip http://www.snib.mx/proyectos/OE001/SNIB-OE001-CSV.zip UTF-8 CSV
SNIB-OE001-BD.zip http://www.snib.mx/proyectos/OE001/SNIB-OE001-BD.zip UTF-8 MDB MicrosoftAccess2007

Контакты

Alicia Gamboa de Buen
  • Originator
  • Responsable
Universidad Nacional Autónoma de MéxicoInstituto de EcologíaDepartamento de Ecología Funcional y Aplicada
04510 México
Distrito Federal
MX
  • 5622-8222 ext. 47897
CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
  • Metadata Provider
  • Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  • Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
14010 MÉXICO
Tlalpan
MX
  • 50045000
Patricia Ramos Rivera
  • Point Of Contact
  • Directora General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  • Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
14010 México
Tlalpan
MX
  • 50045000

Географический охват

País: MEXICO (VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE)

Ограничивающие координаты Юг Запад [19,541, -96,735], Север Восток [19,541, -96,735]

Таксономический охват

Reino: Plantae Filo: Tracheophyta Clase: Magnoliopsida Orden: Malvales Familia: Malvaceae

Kingdom Plantae
Phylum Tracheophyta
Class Magnoliopsida
Order Malvales
Family Malvaceae
Genus Ceiba
Species Ceiba aesculifolia (Pochote, Mosmót (Zoque), ahaiyá (Guarijío), algodoncillo, ceiba, ceibo (Maya), ch'oo (Maya), chote, huacapi (Guarijío), k'inim (Maya), kuch (Maya), kuché (Maya), len-o-ma (Chontal de Oaxaca), ma-tzu (Chinanteco), matzu (Chinanteco), mo-dzu (Chinanteco), piim (Maya), piim yaxche (Maya), pochota (Totonaco), pochote, pochotl (Náhuatl), píin (Maya), ya'ax che' (Maya), ya'ax-che (Maya), ya'ax-ek (Maya), ya'axche (Maya), yaga-piogo-xila (Zapoteco), yaga-piogo-xilla (Zapoteco), yaxché (Maya))

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 2012-02-08 / 2016-02-15

Данные проекта

Proyecto financiado con recursos provenientes de la Dirección General del Sector Primario y Recursos Naturales Renovables de la SEMARNAT. En los últimos años se ha señalado la importancia del estudio de la diversidad genética de las especies para comprender la fisiología de las plantas dentro de un contexto ecológico. En este proyecto hemos seleccionado a Ceiba aesculifolia, una especie silvestre con un gran potencial para análisis genéticos y fisiológicos, así como por su importancia en procesos de restauración y el aprovechamiento de sus frutos (fibra y semilla) en las diferentes localidades donde se distribuye. En particular, estamos interesados en llevar a cabo un análisis transcriptómico del proceso de germinación en función del contenido relativo de agua de las semillas como un parámetro fisiológico adecuado para comparar los diferentes lotes de semillas, provenientes de diferentes años de colecta, y para comparar los diferentes tratamientos que pueden modificar el desempeño germinativo. Los datos obtenidos por medio de las técnicas de secuenciación masiva del transcriptoma de las diferentes muestras nos permitirán obtener una base con datos genéticos de la semilla de Ceiba aesculifolia que podrá ser usada como referencia para otro tipo de estudios. Por un lado, la combinación de los transcriptomas asociados a diferentes tratamientos de acondicionamiento mátrico y de envejecimiento, junto con sus respectivos grupos control, nos permitirá obtener una base de datos de posibles transcritos asociados a un amplio espectro de procesos biológicos pertenecientes a diversos programas de desarrollo. Por otro lado, el análisis comparativo de los transcriptomas de cada tratamiento nos permitirá discernir entre los distintos procesos biológicos que están asociados con el mejoramiento de la respuesta germinativa y el deterioro de las semillas por el proceso de envejecimiento. Estos análisis a su vez permitirán plantear nuevas hipótesis de trabajo para el manejo de especies mexicanas no-modelo. Este proyecto constituye una parte de la tesis doctoral de la alumna Ximena Gómez Maqueo Bribiesca, bajo la tutoría de los Dres. Alicia Gamboa de Buen (tutor principal) y Luis David Alcaraz Peraza.

Название Ceiba aesculifolia como especie modelo para el estudio molecular del envejecimiento de las semillas en relación al desempeño germinativo
Идентификатор SNIB-OE001-OE0012001F-ND
Финансирование Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
Описание района исследования Plantas con flores como achiotes, algodón, baobabs, cacao, ceibas, flor de Jamaica, flor de manita, jonote, malvas, pochotes

Исполнители проекта:

Alicia Gamboa de Buen
  • Content Provider

Данные коллекции

Название коллекции NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE
Идентификатор коллекции SNIB-OE001-OE0012001F-ND
Идентификатор родительской коллекции NO APLICA
Единицы хранения Между 1 и 6 Ejemplar

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы 5a201bcf-7396-4dcb-a535-238957812be3
https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-OE001