Ceiba aesculifolia como especie modelo para el estudio molecular del envejecimiento de las semillas en relación al desempeño germinativo

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Descrição

Proyecto financiado con recursos provenientes de la Dirección General del Sector Primario y Recursos Naturales Renovables de la SEMARNAT. En los últimos años se ha señalado la importancia del estudio de la diversidad genética de las especies para comprender la fisiología de las plantas dentro de un contexto ecológico. En este proyecto hemos seleccionado a Ceiba aesculifolia, una especie silvestre con un gran potencial para análisis genéticos y fisiológicos, así como por su importancia en procesos de restauración y el aprovechamiento de sus frutos (fibra y semilla) en las diferentes localidades donde se distribuye. En particular, estamos interesados en llevar a cabo un análisis transcriptómico del proceso de germinación en función del contenido relativo de agua de las semillas como un parámetro fisiológico adecuado para comparar los diferentes lotes de semillas, provenientes de diferentes años de colecta, y para comparar los diferentes tratamientos que pueden modificar el desempeño germinativo. Los datos obtenidos por medio de las técnicas de secuenciación masiva del transcriptoma de las diferentes muestras nos permitirán obtener una base con datos genéticos de la semilla de Ceiba aesculifolia que podrá ser usada como referencia para otro tipo de estudios. Por un lado, la combinación de los transcriptomas asociados a diferentes tratamientos de acondicionamiento mátrico y de envejecimiento, junto con sus respectivos grupos control, nos permitirá obtener una base de datos de posibles transcritos asociados a un amplio espectro de procesos biológicos pertenecientes a diversos programas de desarrollo. Por otro lado, el análisis comparativo de los transcriptomas de cada tratamiento nos permitirá discernir entre los distintos procesos biológicos que están asociados con el mejoramiento de la respuesta germinativa y el deterioro de las semillas por el proceso de envejecimiento. Estos análisis a su vez permitirán plantear nuevas hipótesis de trabajo para el manejo de especies mexicanas no-modelo. Este proyecto constituye una parte de la tesis doctoral de la alumna Ximena Gómez Maqueo Bribiesca, bajo la tutoría de los Dres. Alicia Gamboa de Buen (tutor principal) y Luis David Alcaraz Peraza.

Reino: 1 Filo: 1 Clase: 1 Orden: 1 Familia: 1 Género: 1 Especie: 1

Registros de Dados

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Versões

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Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF Registration

Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: 5a201bcf-7396-4dcb-a535-238957812be3.  Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por Biodiversity Information System of Mexico.

Palavras-chave

Occurrence; Plantas; Occurrence

Dados externos

Os dados de recurso também estão disponíveis em outros formatos

SNIB-OE001-CSV.zip http://www.snib.mx/proyectos/OE001/SNIB-OE001-CSV.zip UTF-8 CSV
SNIB-OE001-BD.zip http://www.snib.mx/proyectos/OE001/SNIB-OE001-BD.zip UTF-8 MDB MicrosoftAccess2007

Contatos

Alicia Gamboa de Buen
  • Originador
  • Responsable
Universidad Nacional Autónoma de MéxicoInstituto de EcologíaDepartamento de Ecología Funcional y Aplicada
04510 México
Distrito Federal
MX
  • 5622-8222 ext. 47897
CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
  • Provedor Dos Metadados
  • Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  • Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
14010 MÉXICO
Tlalpan
MX
  • 50045000
Patricia Ramos Rivera
  • Ponto De Contato
  • Directora General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  • Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
14010 México
Tlalpan
MX
  • 50045000

Cobertura Geográfica

País: MEXICO (VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE)

Coordenadas delimitadoras Sul Oeste [19,541, -96,735], Norte Leste [19,541, -96,735]

Cobertura Taxonômica

Reino: Plantae Filo: Tracheophyta Clase: Magnoliopsida Orden: Malvales Familia: Malvaceae

Reino Plantae
Filo Tracheophyta
Class Magnoliopsida
Ordem Malvales
Família Malvaceae
Gênero Ceiba
Espécie Ceiba aesculifolia (Pochote, Mosmót (Zoque), ahaiyá (Guarijío), algodoncillo, ceiba, ceibo (Maya), ch'oo (Maya), chote, huacapi (Guarijío), k'inim (Maya), kuch (Maya), kuché (Maya), len-o-ma (Chontal de Oaxaca), ma-tzu (Chinanteco), matzu (Chinanteco), mo-dzu (Chinanteco), piim (Maya), piim yaxche (Maya), pochota (Totonaco), pochote, pochotl (Náhuatl), píin (Maya), ya'ax che' (Maya), ya'ax-che (Maya), ya'ax-ek (Maya), ya'axche (Maya), yaga-piogo-xila (Zapoteco), yaga-piogo-xilla (Zapoteco), yaxché (Maya))

Cobertura Temporal

Data Inicial / Data final 2012-02-08 / 2016-02-15

Dados Sobre o Projeto

Proyecto financiado con recursos provenientes de la Dirección General del Sector Primario y Recursos Naturales Renovables de la SEMARNAT. En los últimos años se ha señalado la importancia del estudio de la diversidad genética de las especies para comprender la fisiología de las plantas dentro de un contexto ecológico. En este proyecto hemos seleccionado a Ceiba aesculifolia, una especie silvestre con un gran potencial para análisis genéticos y fisiológicos, así como por su importancia en procesos de restauración y el aprovechamiento de sus frutos (fibra y semilla) en las diferentes localidades donde se distribuye. En particular, estamos interesados en llevar a cabo un análisis transcriptómico del proceso de germinación en función del contenido relativo de agua de las semillas como un parámetro fisiológico adecuado para comparar los diferentes lotes de semillas, provenientes de diferentes años de colecta, y para comparar los diferentes tratamientos que pueden modificar el desempeño germinativo. Los datos obtenidos por medio de las técnicas de secuenciación masiva del transcriptoma de las diferentes muestras nos permitirán obtener una base con datos genéticos de la semilla de Ceiba aesculifolia que podrá ser usada como referencia para otro tipo de estudios. Por un lado, la combinación de los transcriptomas asociados a diferentes tratamientos de acondicionamiento mátrico y de envejecimiento, junto con sus respectivos grupos control, nos permitirá obtener una base de datos de posibles transcritos asociados a un amplio espectro de procesos biológicos pertenecientes a diversos programas de desarrollo. Por otro lado, el análisis comparativo de los transcriptomas de cada tratamiento nos permitirá discernir entre los distintos procesos biológicos que están asociados con el mejoramiento de la respuesta germinativa y el deterioro de las semillas por el proceso de envejecimiento. Estos análisis a su vez permitirán plantear nuevas hipótesis de trabajo para el manejo de especies mexicanas no-modelo. Este proyecto constituye una parte de la tesis doctoral de la alumna Ximena Gómez Maqueo Bribiesca, bajo la tutoría de los Dres. Alicia Gamboa de Buen (tutor principal) y Luis David Alcaraz Peraza.

Título Ceiba aesculifolia como especie modelo para el estudio molecular del envejecimiento de las semillas en relación al desempeño germinativo
Identificador SNIB-OE001-OE0012001F-ND
Financiamento Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
Descrição da Área de Estudo Plantas con flores como achiotes, algodón, baobabs, cacao, ceibas, flor de Jamaica, flor de manita, jonote, malvas, pochotes

O pessoal envolvido no projeto:

Alicia Gamboa de Buen
  • Content Provider

Dados de Coleção

Nome da Coleção NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE;NO DISPONIBLE
Identificador da Coleção SNIB-OE001-OE0012001F-ND
Identificador da Coleção Parental NO APLICA
Unidades de Curadoria Entre 1 e 6 Ejemplar

Metadados Adicionais

Identificadores alternativos 5a201bcf-7396-4dcb-a535-238957812be3
https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-OE001