| Habenaria virens A. Rich. & Galeotti, 1845 |
| Habenaria volcanica (Lindl.) S. Watson, 1883 |
| Habenaria wercklei Schltr., 1923 |
| Habenaria xochitliae R. González, 2006 |
| Habenaria yookuaaensis Mejía-Marín, Espejo, López-Ferr. & R. Jiménez, 2017 |
| Habenaria zamudioana R. González, 1997 |
| Habenaria zapopana R. González & Cuev.-Fig., 2010 |
| Habenella Small, 1903 |
| Habenella alata (Hook.) Szlach. & Kras-Lap., 2006 |
| Habenella brevilabiata (A. Rich. & Galeotti) Szlach. & Kras-Lap., 2006 |
| Habenella eustachya (Rchb. f.) Szlach. & Kras-Lap., 2006 |
| Habenella odontopetala (Rchb. f.) Small, 1933 |
| Habenella strictissima (Rchb. f.) Szlach. & Kras-Lap., 2006 |
| Hagsatera R. González, 1974 |
| Hagsatera brachycolumna (L.O. Williams) R. González, 1974 |
| Hagsatera rosilloi R. González, 1974 |
| Hapalorchis Schltr., 1919 |
| Hapalorchis lineatus (Lindl.) Schltr., 1920 |
| Harrisella Fawc. & Rendle, 1909 |
| Harrisella amesiana Cogn., 1910 |