| Epidendrum raniferum Lindl., 1831 |
| Epidendrum repens Cogn., 1909 |
| Epidendrum rhizophorum Bateman ex Lindl., 1838 |
| Epidendrum rhynchophorum A. Rich. & Galeotti, 1845 |
| Epidendrum rigidum Lodd., 1830 |
| Epidendrum rimbachii Schltr., 1921 |
| Epidendrum roseoscriptum Hágsater, 1993 |
| Epidendrum rosilloi Hágsater, 1988 |
| Epidendrum rowleyi Withner & G.E. Pollard, 1969 |
| Epidendrum sancti-ramoni Kraenzl., 1929 |
| Epidendrum santaclarense Ames, 1923 |
| Epidendrum satyrioides Sw., 1788 |
| Epidendrum schenckianum Kraenzl., 1909 |
| Epidendrum schlechterianum Ames, 1924 |
| Epidendrum scriptum A. Rich. & Galeotti, 1845 |
| Epidendrum sculptum Rchb. f., 1854 |
| Epidendrum segoviense A.H. Heller, 1968 |
| Epidendrum selligerum Bateman ex Lindl., 1838 |
| Epidendrum sellowii Rchb. f., 1850 |
| Epidendrum seriatum Lindl., 1853 |