| Nitzschia spathulata W. Sm., 1853 |
| Nitzschia spectabilis W.Smith, 1853 |
| Nitzschia subfraudulenta G.R. Hasle, 1974 |
| Nitzschia sublinearis Hust., 1930 |
| Nitzschia sublinearis var. major Freng., 1942 |
| Nitzschia subpacifica Hasle, 1965 |
| Nitzschia subtilis Grunow, 1880 |
| Nitzschia supralitorea Lange-Bert., 1979 |
| Nitzschia tarda Hust., 1949 |
| Nitzschia tenuirostris Mangin, 1952 |
| Nitzschia tenuis W.Smith, 1853 |
| Nitzschia terrestris (J.B.Petersen) Hust., 1934 |
| Nitzschia thermalis (Ehrenb.) Auerswald, 1861 |
| Nitzschia thermalis var. minor Hilse, 1862 |
| Nitzschia tropica Hust., 1949 |
| Nitzschia tryblionella Hantzsch, 1860 |
| Nitzschia tryblionella var. suborbicularis Cleve-Euler, 1939 |
| Nitzschia tubicola Grunow, 1880 |
| Nitzschia umbonata (Ehrenb.) Lange-Bert., 1978 |
| Nitzschia valdestriata Aleem & Hust., 1951 |