| Nitzschia amabilis Suzuki, 2010 |
| Nitzschia americana Hasle, 1964 |
| Nitzschia amphibia Grunow, 1862 |
| Nitzschia amphibia f. rostrata Hust., 1959 |
| Nitzschia amphibioides Hust., 1942 |
| Nitzschia angularis W. Sm., 1853 |
| Nitzschia angularis var. affinis (Grunow) Grunow, 1881 |
| Nitzschia angustata (W. Sm.) Grunow, 1880 |
| Nitzschia angusteforaminata Lange-Bert., 1980 |
| Nitzschia antillarum (Cleve & Grunow) Meister, 1937 |
| Nitzschia archibaldii Lange-Bert.,1980 |
| Nitzschia aremonica Archibald, 1983 |
| Nitzschia bacillariaeformis Hust., 1922 |
| Nitzschia bacillum Hust., 1922 |
| Nitzschia balcanica Hust., 1945 |
| Nitzschia bicapitata Cleve, 1901 |
| Nitzschia bifurcata Kaczmarska & Licea, 1986 |
| Nitzschia bilobata W. Sm., 1853 |
| Nitzschia bilobata var. bilobata W. Sm., 1853 |
| Nitzschia bilobata var. minor Grunow, 1881 |